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番茄Dicer-like蛋白基因家族生物信息学与表达分析
被引量:
1
1
作者
高振华
李漾漾
+3 位作者
王峰
齐明芳
李天来
刘玉凤
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期385-393,共9页
Dicer-like蛋白(DCLs)是RNA沉默机制中的重要参与者,通过miRNA进行基因调控和植物的抗病毒保护,并且还与其他生物和非生物胁迫有关。研究番茄中DCLs的蛋白质基本功能以及SlDCLs对环境的响应,可以为DCLs参与抗逆途径及其在逆境中的作用...
Dicer-like蛋白(DCLs)是RNA沉默机制中的重要参与者,通过miRNA进行基因调控和植物的抗病毒保护,并且还与其他生物和非生物胁迫有关。研究番茄中DCLs的蛋白质基本功能以及SlDCLs对环境的响应,可以为DCLs参与抗逆途径及其在逆境中的作用提供理论依据。为深入了解番茄中RNase Ⅲ核酸内切酶Dicer-like蛋白基因家族的特征,利用生物信息学的方法对番茄DCL蛋白基因家族成员进行染色体定位,分析蛋白质基本理化性质、系统发育进化、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域等。并通过qRT-PCR方法检测基因在组织中的表达模式和对激素、低温、盐、干旱等胁迫的响应。结果表明:番茄DCL基因有7个,分为4个家族;主要蛋白结构域有5个,启动子区域有响应各类激素、光信号、干旱等逆境的顺式作用元件,包括SlDCL1启动子区域的响应低温作用元件,SlDCL2a的SA、ABA响应元件,SlDCL2b的光响应元件,SlDCL2c的ABA,Me-JA响应元件,SlDCL2d的赤霉素响应元件,SlDCL3的Me-JA、SA响应元件,SlDCL4的干旱响应元件。结果表明:DCL家族基因在不同组织中具有不同的表达模式;激素、低温和渗透胁迫处理可以抑制或激活该家族成员的表达。SlDCL1直接响应低夜温,SlDCL2a对渗透胁迫响应明显;SlDCL2b的转录水平受到NACl的负调控;SlDCL2c受到低温以及ABA的正调控;SlDCL2d受NACl与PEG的负调控;PEG可以促进SlDCL3和SlDCL4的表达。
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关键词
番茄
DCL基因家族
生物信息学分析
基因表达
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职称材料
KNO3浓度对基质袋培薄皮甜瓜产量和风味品质的影响
被引量:
3
2
作者
耿国明
邵青旭
+2 位作者
李悦鹏
于雷
齐红岩
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期52-61,共10页
探究基质袋栽培条件下改变山崎配方营养液中KNO3浓度,对甜瓜矿质元素吸收、产量和风味品质的影响,为温室基质袋培甜瓜的优质生产提供依据。以薄皮甜瓜品种玉美人为试材,在甜瓜专用山崎配方基础上,根据2017年产量试验结果,进行5个不同KNO...
探究基质袋栽培条件下改变山崎配方营养液中KNO3浓度,对甜瓜矿质元素吸收、产量和风味品质的影响,为温室基质袋培甜瓜的优质生产提供依据。以薄皮甜瓜品种玉美人为试材,在甜瓜专用山崎配方基础上,根据2017年产量试验结果,进行5个不同KNO3浓度处理:0%、65%、100%、125%和200%,分别以NK1、NK2、NK3、NK4和NK5表示,其中100%为山崎配方中的原浓度,设为对照。测定甜瓜伸蔓期、果实膨大期和果实成熟期植株氮、钾元素吸收量、可溶性固形物、可溶性糖含量、香气成分、蔗糖代谢和香气合成相关酶活性及基因表达变化。结果表明:在产量、可溶性固形物和可溶性糖含量上NK1和NK5处理结果较低,而NK2、NK3和NK4处理的产量、可溶性固形物和可溶性糖含量无显著差异;测定出成熟甜瓜果实中香气物质39种,其中酯类物质为17种,NK3处理含量最高,NK1处理含量最低;测定NK2和NK3处理的SPS酶活性最高,NK1处理SPS酶活性最低;NK3处理的CmSPS01基因表达量最高,而其他4个处理间无显著差异;NK2和NK3处理CmLOX08、CmLOX09和CmAAT1基因表达量无显著差异且显著高于其他处理,而NK1处理CmLOX16的相对表达量最高,其相关作用有待进一步研究,由此可见NK2与NK3处理总体效果相似。综上所述,NK2和NK3处理综合表现较好;结合2017年产量试验结果得出结论,即减少KNO325%~35%时,有利于甜瓜优质生产,实现化肥减施。
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关键词
薄皮甜瓜
基质袋栽培
KNO3浓度
可溶性糖
香气成分
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职称材料
题名
番茄Dicer-like蛋白基因家族生物信息学与表达分析
被引量:
1
1
作者
高振华
李漾漾
王峰
齐明芳
李天来
刘玉凤
机构
沈阳
农业
大学
园艺学
院
/设施
园艺
省
部
共建
教育部
重点
实验室
/北方
园艺
设施
设计与
应用
技术
国家地方联合工程研究中心
(
辽宁
)
出处
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期385-393,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31772356)
国家现代农业产业体系建设专项项目(CARS-25)。
文摘
Dicer-like蛋白(DCLs)是RNA沉默机制中的重要参与者,通过miRNA进行基因调控和植物的抗病毒保护,并且还与其他生物和非生物胁迫有关。研究番茄中DCLs的蛋白质基本功能以及SlDCLs对环境的响应,可以为DCLs参与抗逆途径及其在逆境中的作用提供理论依据。为深入了解番茄中RNase Ⅲ核酸内切酶Dicer-like蛋白基因家族的特征,利用生物信息学的方法对番茄DCL蛋白基因家族成员进行染色体定位,分析蛋白质基本理化性质、系统发育进化、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域等。并通过qRT-PCR方法检测基因在组织中的表达模式和对激素、低温、盐、干旱等胁迫的响应。结果表明:番茄DCL基因有7个,分为4个家族;主要蛋白结构域有5个,启动子区域有响应各类激素、光信号、干旱等逆境的顺式作用元件,包括SlDCL1启动子区域的响应低温作用元件,SlDCL2a的SA、ABA响应元件,SlDCL2b的光响应元件,SlDCL2c的ABA,Me-JA响应元件,SlDCL2d的赤霉素响应元件,SlDCL3的Me-JA、SA响应元件,SlDCL4的干旱响应元件。结果表明:DCL家族基因在不同组织中具有不同的表达模式;激素、低温和渗透胁迫处理可以抑制或激活该家族成员的表达。SlDCL1直接响应低夜温,SlDCL2a对渗透胁迫响应明显;SlDCL2b的转录水平受到NACl的负调控;SlDCL2c受到低温以及ABA的正调控;SlDCL2d受NACl与PEG的负调控;PEG可以促进SlDCL3和SlDCL4的表达。
关键词
番茄
DCL基因家族
生物信息学分析
基因表达
Keywords
tomato
DCL gene family
bioinformatics analysis
gene expression
分类号
Q945.11 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
KNO3浓度对基质袋培薄皮甜瓜产量和风味品质的影响
被引量:
3
2
作者
耿国明
邵青旭
李悦鹏
于雷
齐红岩
机构
沈阳
农业
大学
园艺学
院
/设施
园艺
省
部
共建
教育部
重点
实验室
/北方
园艺
设施
设计与
应用
技术
国家地方联合工程研究中心
(
辽宁
)
出处
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期52-61,共10页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项项目(CARS-25)
沈阳市科技计划项目(17-143-3-00)。
文摘
探究基质袋栽培条件下改变山崎配方营养液中KNO3浓度,对甜瓜矿质元素吸收、产量和风味品质的影响,为温室基质袋培甜瓜的优质生产提供依据。以薄皮甜瓜品种玉美人为试材,在甜瓜专用山崎配方基础上,根据2017年产量试验结果,进行5个不同KNO3浓度处理:0%、65%、100%、125%和200%,分别以NK1、NK2、NK3、NK4和NK5表示,其中100%为山崎配方中的原浓度,设为对照。测定甜瓜伸蔓期、果实膨大期和果实成熟期植株氮、钾元素吸收量、可溶性固形物、可溶性糖含量、香气成分、蔗糖代谢和香气合成相关酶活性及基因表达变化。结果表明:在产量、可溶性固形物和可溶性糖含量上NK1和NK5处理结果较低,而NK2、NK3和NK4处理的产量、可溶性固形物和可溶性糖含量无显著差异;测定出成熟甜瓜果实中香气物质39种,其中酯类物质为17种,NK3处理含量最高,NK1处理含量最低;测定NK2和NK3处理的SPS酶活性最高,NK1处理SPS酶活性最低;NK3处理的CmSPS01基因表达量最高,而其他4个处理间无显著差异;NK2和NK3处理CmLOX08、CmLOX09和CmAAT1基因表达量无显著差异且显著高于其他处理,而NK1处理CmLOX16的相对表达量最高,其相关作用有待进一步研究,由此可见NK2与NK3处理总体效果相似。综上所述,NK2和NK3处理综合表现较好;结合2017年产量试验结果得出结论,即减少KNO325%~35%时,有利于甜瓜优质生产,实现化肥减施。
关键词
薄皮甜瓜
基质袋栽培
KNO3浓度
可溶性糖
香气成分
Keywords
oriental melon
substrate bag culture
KNO3 concentration
soluble sugar
aroma components
分类号
S652 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄Dicer-like蛋白基因家族生物信息学与表达分析
高振华
李漾漾
王峰
齐明芳
李天来
刘玉凤
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
2
KNO3浓度对基质袋培薄皮甜瓜产量和风味品质的影响
耿国明
邵青旭
李悦鹏
于雷
齐红岩
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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