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人工智能与分子模拟在药物设计中的研究进展 被引量:5
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作者 张民权 龚铭城 +2 位作者 陈泽锴 陈振华 周良良 《医药导报》 CAS 北大核心 2024年第1期78-84,共7页
随着现代药物研究的不断深入,传统计算机模拟已经不能满足未来药物设计实验的需求。分子模拟作为传统计算机模拟的经典技术之一,可以构造分析复杂的分子模型,研究分子运动的动态过程,但模拟结果受人为因素影响大,准确度较低。近年来,人... 随着现代药物研究的不断深入,传统计算机模拟已经不能满足未来药物设计实验的需求。分子模拟作为传统计算机模拟的经典技术之一,可以构造分析复杂的分子模型,研究分子运动的动态过程,但模拟结果受人为因素影响大,准确度较低。近年来,人工智能与分子模拟技术的融合成为药物设计研究的新方法。人工智能技术利用大数据筛选出对应的化合物进行分子模拟,并将模拟结果反馈给人工智能系统进行学习,不断优化人工神经网络。联用人工智能与分子模拟技术,提高了药物设计研究的效率,降低了人为因素对模拟结果的影响,增加了模拟结果的可信度。该文总结了当前国内外应用人工智能和分子模拟技术进行药物设计的研究成果,以期为未来药物研发从计算机辅助药物设计(CADD)向人工智能辅助药物研发(AIDD)的转变提供参考。 展开更多
关键词 分子模拟 人工智能 药物载体 药物设计
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微液滴质谱法促进的酰胺键构建及其在小分子和蛋白偶联中的应用
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作者 姜雪 杨黄丽 +6 位作者 刘晓燕 肖伟 邱萌 程志刚 周振 涂其冬 高校飞 《质谱学报》 北大核心 2025年第3期277-285,共9页
酰胺键的构建在小分子药物合成、高分子材料合成和修饰、抗体药物偶联物的制备中具有重要作用。本研究探讨了电喷雾微液滴质谱技术促进酚酯氨解形成酰胺键的优势,以及在小分子-蛋白共价偶联复合物制备方面的应用。以4-硝基苯基-2-(((苄... 酰胺键的构建在小分子药物合成、高分子材料合成和修饰、抗体药物偶联物的制备中具有重要作用。本研究探讨了电喷雾微液滴质谱技术促进酚酯氨解形成酰胺键的优势,以及在小分子-蛋白共价偶联复合物制备方面的应用。以4-硝基苯基-2-(((苄氧基)羰基)氨基)乙酸酯(Z-Gly-ONP)与溶菌酶的游离氨基氨解反应为模型,研究电喷雾微液滴技术中样品流速、鞘气压力、电场强度、溶剂极性等对酰胺键偶联效率的影响。结果表明,样品流速和鞘气压力在微液滴中酚酯氨解构建酰胺键反应过程中发挥着主要作用。这可能是由于在电喷雾过程中,雾化气体气流大和样品流速低的情况下,喷口处的样品溶液去溶剂化效率高,导致样品的局部浓度提高,促使样品分子之间发生碰撞的频率增大,酰胺键形成反应的转化率提高。另外,微液滴技术成功应用于肿瘤抗原多肽与模型蛋白的共价偶联,蛋白偶联转化率达89%,且溶液相中反应剩余模型蛋白原料相对信号达74%。同等条件下与溶液相相比,微液滴中Z-Gly-ONP与溶菌酶的游离氨基氨解形成酰胺键的转化率明显提高,表明电喷雾微液滴技术在肿瘤抗原多肽-含T表位的载体蛋白共价偶联复合物的高效制备方面具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 电喷雾 微液滴 酰胺键形成 氨解 质谱
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微液滴技术促进不混溶两相间酰胺键形成反应的质谱研究
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作者 刘晓燕 杨黄丽 +6 位作者 姜雪 肖伟 邱萌 程志刚 周振 涂其冬 高校飞 《质谱学报》 北大核心 2025年第4期484-492,共9页
不混溶两相中酰胺键的形成对不同亲疏水官能团间的共价偶联具有重要意义。本文采用同轴双液路喷雾装置,探索微液滴技术在促进不混溶两相间物质氨解反应形成酰胺键的优势。首先,以N-苄氧羰基-2-氨基乙酸对硝基苯酚酯(E_(a))与溶菌酶蛋白... 不混溶两相中酰胺键的形成对不同亲疏水官能团间的共价偶联具有重要意义。本文采用同轴双液路喷雾装置,探索微液滴技术在促进不混溶两相间物质氨解反应形成酰胺键的优势。首先,以N-苄氧羰基-2-氨基乙酸对硝基苯酚酯(E_(a))与溶菌酶蛋白氨解反应为模型,研究样品流速、鞘管压强和溶剂等因素对不混溶两相微液滴中氨解效率的影响。研究发现,样品流速和鞘管压强对反应效率起到关键作用,可能是由于高压气流对流速较低的初始液滴施加强大的剪切应力,促使初始液滴变小,进而提高两相间物质交换效率。当氨解反应分别采用几种疏水性有机溶剂(如甲苯、乙酸乙酯、己酮、二氯甲烷、正丁醇)时,微液滴中的相对转化率在80%~91%之间。当小分子是带有大疏水基团的活性酯类E_(a)、E_(b)(N-苄氧羰基-4-氨基乙酸对硝基苯酚酯)、E_(c)(N-苄氧羰基-6-氨基乙酸对硝基苯酚酯)、E_(d)(N-芴甲氧羰基-2-氨基乙酸对硝基苯酚酯)、E_(e)(N-芴甲氧羰基-4-氨基乙酸对硝基苯酚酯)和E_f(N-芴甲氧羰基-6-氨基乙酸对硝基苯酚酯)时,微液滴体系中的氨解相对转化率在65%~91%之间,而在本体溶液中的相对转化率小于11%。由此可见,微液滴中不混溶两相间的氨解反应具有较广的底物适用范围,该方法在不同亲疏水官能团的共价偶联方面展现出潜在的应用价值。 展开更多
关键词 微液滴 酰胺键形成 两相反应 质谱
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多梳抑制性去泛素化酶复合物的结构与功能及其在血液肿瘤发生发展中的作用
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作者 张文文 蒋福全 陈振华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期879-888,共10页
多梳抑制性去泛素化酶(polycomb repressive deubiquitinase,PR-DUB)复合物是多梳蛋白家族的成员之一,通过调节组蛋白修饰参与染色体的表观遗传修饰。多梳抑制性复合物1(polycomb repressive complex 1,PRC1)和PR-DUB复合物通过对H2AK11... 多梳抑制性去泛素化酶(polycomb repressive deubiquitinase,PR-DUB)复合物是多梳蛋白家族的成员之一,通过调节组蛋白修饰参与染色体的表观遗传修饰。多梳抑制性复合物1(polycomb repressive complex 1,PRC1)和PR-DUB复合物通过对H2AK119Ub泛素化与去泛素化修饰调控平衡,保护活性基因免受异常沉默,去泛素化功能与促进基因活化和建立转录允许的染色质状态有关,除此之外还激活增强子并促进双链断裂处DNA损伤修复。附加性梳样1(additional sex comb-like1,ASXL1)作为表观遗传支架组装染色质修饰复合物和转录因子参与表观遗传调控。BRCA1相关蛋白1(BRCA1-associated protein 1,BAP1)作为去泛素化酶去除底物的泛素化修饰。PR-DUB复合物由核心二聚体和其他辅助因子组成,BAP1与ASXL1形成核心二聚体,其他亚基相互作用调节PR-DUB复合物靶向和功能。ASXL1和BAP1是与PR-DUB复合物去泛素化功能最相关的2个亚基,ASXL1的DEUBAD结构域激活BAP1发挥去泛素化作用水解H2AK119Ub1。了解ASXL1和BAP1的结构以及相互作用机制对研究PR-DUB复合物特异性去泛素化作用的机制至关重要。在人类中,PR-DUB复合物成分的突变经常引起多种血液肿瘤。ASXL 1基因突变常导致蛋白质翻译提前结束,大部分是由于C末端PHD结构域缺失导致。目前认为,PR-DUB复合物中突变的ASXL1或BAP1、表观遗传因子以及Akt/mTOR等靶点或信号通路相互作用是促进血液肿瘤发生发展的可能机制。这对于针对潜在的治疗靶点研究开发新的特异性靶向治疗药物至关重要。本文将介绍PR-DUB复合物的结构与功能、作用机制及其在血液肿瘤疾病中的发生,重点就ASXL1和BAP1进行综述,并系统总结了潜在的靶向治疗药物,以期为PR-DUB复合物在血液疾病防治中的研究提供科学参考。 展开更多
关键词 多梳抑制性去泛素化酶复合物 去泛素化修饰 基因突变 血液肿瘤
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黄芩苷的药理特性及其作用机制研究进展 被引量:80
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作者 吴缠婷 周良良 +2 位作者 邹婉清 成禹昕 陈振华 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第2期63-67,共5页
黄芩属双子叶唇形科草本植物,常以干燥根部入药,是一种值得开发的传统中药。黄芩苷作为黄芩提取物中有效的黄酮类成分之一,具有抗炎、抗肿瘤、抗氧化、抗抑郁等广泛的药理活性,在医药领域有着十分广阔的应用前景。目前,随着对黄芩苷药... 黄芩属双子叶唇形科草本植物,常以干燥根部入药,是一种值得开发的传统中药。黄芩苷作为黄芩提取物中有效的黄酮类成分之一,具有抗炎、抗肿瘤、抗氧化、抗抑郁等广泛的药理活性,在医药领域有着十分广阔的应用前景。目前,随着对黄芩苷药理作用的深入研究,其具体的分子作用机制还需要大量的研究对其进行阐释。就黄芩苷的药理作用及其相应的作用机制进行文献综述,为黄芩苷的进一步开发和应用及特定部位的有效治疗提供研究依据。 展开更多
关键词 黄芩苷 抗结肠炎 抗抑郁 抗肿瘤 心脑血管
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大黄素药理作用及新剂型研究进展 被引量:25
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作者 谢蓉 张民权 +2 位作者 李莹 周良良 陈振华 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第12期120-125,共6页
大黄素是中药大黄中一种蒽醌类活性单体,具有显著的抗肿瘤、抗炎、抗病毒、抗菌、保护肝肾等多种药理作用,广泛应用于肝癌、肺癌、结肠炎、胰腺炎等疾病的治疗。大黄素药理活性广泛,但存在溶解性差,广泛代谢、生物利用度低等问题,未能... 大黄素是中药大黄中一种蒽醌类活性单体,具有显著的抗肿瘤、抗炎、抗病毒、抗菌、保护肝肾等多种药理作用,广泛应用于肝癌、肺癌、结肠炎、胰腺炎等疾病的治疗。大黄素药理活性广泛,但存在溶解性差,广泛代谢、生物利用度低等问题,未能实现临床转化。针对这一问题国内外学者使用纳米粒、脂质纳米颗粒、金属配合物等新剂型技术,提高大黄素的溶解度和生物利用度,赋予其靶向性、缓释性等特性,以适用临床。通过检索PubMed、SCI-HUB等数据库中大黄素药理作用和新剂型的相关文献,进行归纳总结,对大黄素药理作用和新剂型的研究进展进行综述,为进一步开展大黄素的新剂型研究提供参考。 展开更多
关键词 大黄素 抗肿瘤 抗炎 新剂型 纳米粒 脂质纳米颗粒
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一种多吡啶铜(Ⅰ)配合物的合成、结构及DNA光裂解研究
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作者 张琴 黄羽 +3 位作者 李知敏 胡迈 廖向文 王金涛 《人工晶体学报》 CAS 北大核心 2021年第11期2103-2108,共6页
本文以1-甲基-4′-对苯甲基-2,2′,6′,2″-三联吡啶六氟磷酸盐(L)为配体合成了一例新的铜配合物[CuL_(2)](PF_(6))_(3)·H_(2)O(配合物1)。通过X射线单晶衍射技术、热重分析和X射线光电子能谱(XPS)对所合成的配合物进行了结构的表... 本文以1-甲基-4′-对苯甲基-2,2′,6′,2″-三联吡啶六氟磷酸盐(L)为配体合成了一例新的铜配合物[CuL_(2)](PF_(6))_(3)·H_(2)O(配合物1)。通过X射线单晶衍射技术、热重分析和X射线光电子能谱(XPS)对所合成的配合物进行了结构的表征和化学价的分析。单晶衍射分析结果表明,该配合物属于单斜晶系,P2_(1/c)空间群,晶胞参数为a=1.27315(10)nm、b=1.90201(13)nm、c=2.10955(17)nm、β=101.269(2)°、V=5.0099(7)nm^(3)。XPS分析结果表明,配合物中的铜离子是以+1价的形式存在。热重分析表明,该配合物具有较高的热稳定性。琼脂糖凝胶电泳实验表明,该配合物在光照条件下能有效使DNA裂解,表明该配合物具有明显的潜在生物活性。 展开更多
关键词 多吡啶 铜配合物 溶剂慢挥发法 凝胶电泳实验 DNA光裂解
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