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野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
被引量：
3
1
作者
吴欢生
王飞兵
+7 位作者
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1106-1110,共5页
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采...
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采用探针法荧光定量PCR(Taq Man qPCR)对组织样品检测,对PCV4阳性组织样品采用普通PCR扩增其Cap基因并分析其同源性及遗传进化关系。结果显示,25份样品中检测到3份PCV4阳性样品,检出率为12%(3/25);普通PCR扩增结果显示,在3份阳性样品中均扩增到约1300 bp的目的条带,测序后的序列比对分析结果显示其均为PCV4全长Cap基因序列(JXNC-2020、JXYC-2020及JXGZ-2020)。Cap基因的同源性分析显示,3个野猪源PCV4 Cap基因序列间的同源性为98.69%~100%,氨基酸序列间的同源性为97.1%~100%;与韩国野猪源PCV4流行株E115 Cap基因序列的同源性为98.11%~98.54%,氨基酸序列的同源性为96.93%~98.25%;与国内家猪源PCV4 Cap基因序列的同源性为98.54%~99.13%,氨基酸序列同源性97.37%~99.12%;与E115株相比,本研究获得的3个PCV4 Cap蛋白氨基酸序列分别存在3个及7个突变氨基酸。与国内PCV4相比,PCV4 Cap基因JXGZ-2020编码的氨基酸序列突变数明显少于其与韩国流行株相比。Cap基因的系统发育分析显示,野猪源PCV4与家猪源PCV4同属于一个分支,与圆环病毒属其他病毒处于不同分支。上述结果表明,野猪源PCV4与家猪源PCV4的亲缘关系较近,间接表明野猪可以促进PCV4的扩散与传播。本研究结果首次拓展了PCV4的宿主范围,为进一步研究PCV4的流行及基因组特征提供参考。
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关键词
野猪
家猪
猪圆环病毒4型
Cap基因
遗传进化分析
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职称材料
题名
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
被引量：
3
1
作者
吴欢生
王飞兵
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
机构
江西省
畜禽疫病诊断与防控重点实验室/
江西
农业
大学动物群发性疾病监测与防治研究所
江西省金溪县农业农村局农业技术推广中心
江西省
农业
技术推广
中心
江西省
丰城市
农业
农村
局
厦门海关
技术
中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1106-1110,共5页
基金
江西省非洲猪瘟疫情预警及官山保护周边猫科动物疫病监测(20191204)。
文摘
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采用探针法荧光定量PCR(Taq Man qPCR)对组织样品检测,对PCV4阳性组织样品采用普通PCR扩增其Cap基因并分析其同源性及遗传进化关系。结果显示,25份样品中检测到3份PCV4阳性样品,检出率为12%(3/25);普通PCR扩增结果显示,在3份阳性样品中均扩增到约1300 bp的目的条带,测序后的序列比对分析结果显示其均为PCV4全长Cap基因序列(JXNC-2020、JXYC-2020及JXGZ-2020)。Cap基因的同源性分析显示,3个野猪源PCV4 Cap基因序列间的同源性为98.69%~100%,氨基酸序列间的同源性为97.1%~100%;与韩国野猪源PCV4流行株E115 Cap基因序列的同源性为98.11%~98.54%,氨基酸序列的同源性为96.93%~98.25%;与国内家猪源PCV4 Cap基因序列的同源性为98.54%~99.13%,氨基酸序列同源性97.37%~99.12%;与E115株相比,本研究获得的3个PCV4 Cap蛋白氨基酸序列分别存在3个及7个突变氨基酸。与国内PCV4相比,PCV4 Cap基因JXGZ-2020编码的氨基酸序列突变数明显少于其与韩国流行株相比。Cap基因的系统发育分析显示,野猪源PCV4与家猪源PCV4同属于一个分支,与圆环病毒属其他病毒处于不同分支。上述结果表明,野猪源PCV4与家猪源PCV4的亲缘关系较近,间接表明野猪可以促进PCV4的扩散与传播。本研究结果首次拓展了PCV4的宿主范围,为进一步研究PCV4的流行及基因组特征提供参考。
关键词
野猪
家猪
猪圆环病毒4型
Cap基因
遗传进化分析
Keywords
wild boars
domestic pigs
porcine circovirus 4
Cap gene
phylogenetic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
吴欢生
王飞兵
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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