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江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
1
作者
吴欢生
康冬柳
+5 位作者
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期772-776,共5页
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5...
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5对特异性引物,对BHoV-JX株的全基因组序列进行分段PCR扩增,扩增产物分别克隆于p MD18-T载体中,采用通用引物进行序列测定后全序列拼接与分析。结果显示,BHoV-JX株全基因组序列为5 157 bp,其中编码区为4 755 bp,包含3个开放阅读框(ORF),分别编码NS1、VP1及VP2蛋白,具有细小病毒共同结构特征,属于新型细小病毒。编码区序列同源比对结果显示,BHoV-JX与其他8株参考株核苷酸序列同源性为88.60%~98.25%,推导氨基酸序列同源性为93.30%~99.55%。系统进化树分析显示,BHoV-JX株与2011年香港分离株JF504698.1亲缘关系最近,同处独立分支,而与2015年我国青海省、甘肃省分离株亲缘关系较远,且分属不同分支。本研究首次在江西省牛急性腹泻粪便中检测到BHoV,证实该病毒在江西省的存在,该病毒株与2011年香港BHoV-2分离株JF504698.1亲缘关系最近,该结果为BHoV流行病学研究提供了参考依据。
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关键词
牛香港病毒(BHoV)
全基因组序列
进化树
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职称材料
当前牛羊养殖场抗生素使用现状与应对措施
被引量：
9
2
作者
陈敬
杨帆
+7 位作者
曹华斌
彭成诚
易馨
廖述弦
李静妮
陈华伟
欧阳克蕙
瞿明仁
《中国牛业科学》
2023年第1期80-84,共5页
长期以来,兽药用长效抗菌药剂(抗生素)在有效防治各类传染性动物疫病、提高农民生产畜禽养殖生产经营的效益、保障各类城市公共产品安全卫生的质量以及安全标准化生产活动中一直发挥并起着的积极重要作用。然而抗生素滥用易导致多种细...
长期以来,兽药用长效抗菌药剂(抗生素)在有效防治各类传染性动物疫病、提高农民生产畜禽养殖生产经营的效益、保障各类城市公共产品安全卫生的质量以及安全标准化生产活动中一直发挥并起着的积极重要作用。然而抗生素滥用易导致多种细菌产生耐药性,同时会带来较强毒副作用,危害公共卫生安全。2021年全国开展兽用抗菌药减量化行动,各省落实“同一健康”理念,高度重视减量化行动。江西省牛羊产业体系疫病防控岗专家团队深入江西省30多个牛羊养殖大县(区),针对各养殖企业及养殖户设计发放相关调查问卷,为科学指导推动畜禽养殖场户规范使用、减量使用抗生素,提出推动牛羊养殖发展的措施与建议,供各位读者、养殖户进行参考。
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关键词
抗生素
牛羊养殖
使用现状
应对措施
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职称材料
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
被引量：
3
3
作者
吴欢生
王飞兵
+7 位作者
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1106-1110,共5页
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采...
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采用探针法荧光定量PCR(Taq Man qPCR)对组织样品检测,对PCV4阳性组织样品采用普通PCR扩增其Cap基因并分析其同源性及遗传进化关系。结果显示,25份样品中检测到3份PCV4阳性样品,检出率为12%(3/25);普通PCR扩增结果显示,在3份阳性样品中均扩增到约1300 bp的目的条带,测序后的序列比对分析结果显示其均为PCV4全长Cap基因序列(JXNC-2020、JXYC-2020及JXGZ-2020)。Cap基因的同源性分析显示,3个野猪源PCV4 Cap基因序列间的同源性为98.69%~100%,氨基酸序列间的同源性为97.1%~100%;与韩国野猪源PCV4流行株E115 Cap基因序列的同源性为98.11%~98.54%,氨基酸序列的同源性为96.93%~98.25%;与国内家猪源PCV4 Cap基因序列的同源性为98.54%~99.13%,氨基酸序列同源性97.37%~99.12%;与E115株相比,本研究获得的3个PCV4 Cap蛋白氨基酸序列分别存在3个及7个突变氨基酸。与国内PCV4相比,PCV4 Cap基因JXGZ-2020编码的氨基酸序列突变数明显少于其与韩国流行株相比。Cap基因的系统发育分析显示,野猪源PCV4与家猪源PCV4同属于一个分支,与圆环病毒属其他病毒处于不同分支。上述结果表明,野猪源PCV4与家猪源PCV4的亲缘关系较近,间接表明野猪可以促进PCV4的扩散与传播。本研究结果首次拓展了PCV4的宿主范围,为进一步研究PCV4的流行及基因组特征提供参考。
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关键词
野猪
家猪
猪圆环病毒4型
Cap基因
遗传进化分析
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职称材料
题名
江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
1
作者
吴欢生
康冬柳
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
机构
江西省畜禽疫病诊断与防控重点实验室/江西农业大学动物群发性疾病监测与防治研究所
吉安市畜牧兽医局
江西省
动物
疫病
预
防控
制中心
华中
农业
大学
动物
医学院
江西省
动物
营养
重点
实验室
/
江西省
营养饲料开发工程
研究
中心
江西农业大学
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期772-776,共5页
基金
江西省牛羊疾病防控岗位体系(JXRS-13)
国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)。
文摘
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5对特异性引物,对BHoV-JX株的全基因组序列进行分段PCR扩增,扩增产物分别克隆于p MD18-T载体中,采用通用引物进行序列测定后全序列拼接与分析。结果显示,BHoV-JX株全基因组序列为5 157 bp,其中编码区为4 755 bp,包含3个开放阅读框(ORF),分别编码NS1、VP1及VP2蛋白,具有细小病毒共同结构特征,属于新型细小病毒。编码区序列同源比对结果显示,BHoV-JX与其他8株参考株核苷酸序列同源性为88.60%~98.25%,推导氨基酸序列同源性为93.30%~99.55%。系统进化树分析显示,BHoV-JX株与2011年香港分离株JF504698.1亲缘关系最近,同处独立分支,而与2015年我国青海省、甘肃省分离株亲缘关系较远,且分属不同分支。本研究首次在江西省牛急性腹泻粪便中检测到BHoV,证实该病毒在江西省的存在,该病毒株与2011年香港BHoV-2分离株JF504698.1亲缘关系最近,该结果为BHoV流行病学研究提供了参考依据。
关键词
牛香港病毒(BHoV)
全基因组序列
进化树
Keywords
Bovine Hokovirus
whole genome sequence
phylogenetic tree
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
当前牛羊养殖场抗生素使用现状与应对措施
被引量：
9
2
作者
陈敬
杨帆
曹华斌
彭成诚
易馨
廖述弦
李静妮
陈华伟
欧阳克蕙
瞿明仁
机构
江西省畜禽疫病诊断与防控重点实验室/江西农业大学动物群发性疾病监测与防治研究所
奉新县现代
农业
技术服务中心
出处
《中国牛业科学》
2023年第1期80-84,共5页
基金
江西省现代农业产业技术体牛羊体系疫病防控岗项目(JXRS-13)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系项目(CARS-37)。
文摘
长期以来,兽药用长效抗菌药剂(抗生素)在有效防治各类传染性动物疫病、提高农民生产畜禽养殖生产经营的效益、保障各类城市公共产品安全卫生的质量以及安全标准化生产活动中一直发挥并起着的积极重要作用。然而抗生素滥用易导致多种细菌产生耐药性,同时会带来较强毒副作用,危害公共卫生安全。2021年全国开展兽用抗菌药减量化行动,各省落实“同一健康”理念,高度重视减量化行动。江西省牛羊产业体系疫病防控岗专家团队深入江西省30多个牛羊养殖大县(区),针对各养殖企业及养殖户设计发放相关调查问卷,为科学指导推动畜禽养殖场户规范使用、减量使用抗生素,提出推动牛羊养殖发展的措施与建议,供各位读者、养殖户进行参考。
关键词
抗生素
牛羊养殖
使用现状
应对措施
Keywords
antibiotics
cattle and sheep farming
current situation of use
countermeasures
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
S826 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
被引量：
3
3
作者
吴欢生
王飞兵
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
机构
江西省畜禽疫病诊断与防控重点实验室/江西农业大学动物群发性疾病监测与防治研究所
江西省
金溪县
农业
农村局
农业
技术推广中心
江西省
农业
技术推广中心
江西省
丰城市
农业
农村局
厦门海关技术中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1106-1110,共5页
基金
江西省非洲猪瘟疫情预警及官山保护周边猫科动物疫病监测(20191204)。
文摘
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关。为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采用探针法荧光定量PCR(Taq Man qPCR)对组织样品检测,对PCV4阳性组织样品采用普通PCR扩增其Cap基因并分析其同源性及遗传进化关系。结果显示,25份样品中检测到3份PCV4阳性样品,检出率为12%(3/25);普通PCR扩增结果显示,在3份阳性样品中均扩增到约1300 bp的目的条带,测序后的序列比对分析结果显示其均为PCV4全长Cap基因序列(JXNC-2020、JXYC-2020及JXGZ-2020)。Cap基因的同源性分析显示,3个野猪源PCV4 Cap基因序列间的同源性为98.69%~100%,氨基酸序列间的同源性为97.1%~100%;与韩国野猪源PCV4流行株E115 Cap基因序列的同源性为98.11%~98.54%,氨基酸序列的同源性为96.93%~98.25%;与国内家猪源PCV4 Cap基因序列的同源性为98.54%~99.13%,氨基酸序列同源性97.37%~99.12%;与E115株相比,本研究获得的3个PCV4 Cap蛋白氨基酸序列分别存在3个及7个突变氨基酸。与国内PCV4相比,PCV4 Cap基因JXGZ-2020编码的氨基酸序列突变数明显少于其与韩国流行株相比。Cap基因的系统发育分析显示,野猪源PCV4与家猪源PCV4同属于一个分支,与圆环病毒属其他病毒处于不同分支。上述结果表明,野猪源PCV4与家猪源PCV4的亲缘关系较近,间接表明野猪可以促进PCV4的扩散与传播。本研究结果首次拓展了PCV4的宿主范围,为进一步研究PCV4的流行及基因组特征提供参考。
关键词
野猪
家猪
猪圆环病毒4型
Cap基因
遗传进化分析
Keywords
wild boars
domestic pigs
porcine circovirus 4
Cap gene
phylogenetic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
吴欢生
康冬柳
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
2
当前牛羊养殖场抗生素使用现状与应对措施
陈敬
杨帆
曹华斌
彭成诚
易馨
廖述弦
李静妮
陈华伟
欧阳克蕙
瞿明仁
《中国牛业科学》
2023
9
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职称材料
3
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
吴欢生
王飞兵
杨艳
周光斌
陈晨
徐田放
周贝怡
陈依婷
薛美佳
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
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北大核心
2022
3
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