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江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
1
作者
吴欢生
康冬柳
+5 位作者
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期772-776,共5页
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5...
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5对特异性引物,对BHoV-JX株的全基因组序列进行分段PCR扩增,扩增产物分别克隆于p MD18-T载体中,采用通用引物进行序列测定后全序列拼接与分析。结果显示,BHoV-JX株全基因组序列为5 157 bp,其中编码区为4 755 bp,包含3个开放阅读框(ORF),分别编码NS1、VP1及VP2蛋白,具有细小病毒共同结构特征,属于新型细小病毒。编码区序列同源比对结果显示,BHoV-JX与其他8株参考株核苷酸序列同源性为88.60%~98.25%,推导氨基酸序列同源性为93.30%~99.55%。系统进化树分析显示,BHoV-JX株与2011年香港分离株JF504698.1亲缘关系最近,同处独立分支,而与2015年我国青海省、甘肃省分离株亲缘关系较远,且分属不同分支。本研究首次在江西省牛急性腹泻粪便中检测到BHoV,证实该病毒在江西省的存在,该病毒株与2011年香港BHoV-2分离株JF504698.1亲缘关系最近,该结果为BHoV流行病学研究提供了参考依据。
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关键词
牛香港病毒(BHoV)
全基因组序列
进化树
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题名
江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
1
作者
吴欢生
康冬柳
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
机构
江西省
畜禽疫病诊断与防控
重点
实验室
/
江西农业大学
动物
群发性疾病监测与防治
研究
所
吉安市畜牧兽医局
江西省
动物
疫病预防控制
中心
华中
农业
大学
动物
医学院
江西省动物营养重点实验室/江西省营养饲料开发工程研究中心江西农业大学
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期772-776,共5页
基金
江西省牛羊疾病防控岗位体系(JXRS-13)
国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)。
文摘
为了掌握牛香港病毒(Bovine Hokovirus,BHoV)江西株(JX)的全基因组序列特征,本研究以江西宜春某牛场急性腹泻BHoV阳性粪便为材料,通过比对GenBank中已登录的8株Bovine Hokovirus全基因组序列,利用Primer Premier 5.0设计了首尾重叠的5对特异性引物,对BHoV-JX株的全基因组序列进行分段PCR扩增,扩增产物分别克隆于p MD18-T载体中,采用通用引物进行序列测定后全序列拼接与分析。结果显示,BHoV-JX株全基因组序列为5 157 bp,其中编码区为4 755 bp,包含3个开放阅读框(ORF),分别编码NS1、VP1及VP2蛋白,具有细小病毒共同结构特征,属于新型细小病毒。编码区序列同源比对结果显示,BHoV-JX与其他8株参考株核苷酸序列同源性为88.60%~98.25%,推导氨基酸序列同源性为93.30%~99.55%。系统进化树分析显示,BHoV-JX株与2011年香港分离株JF504698.1亲缘关系最近,同处独立分支,而与2015年我国青海省、甘肃省分离株亲缘关系较远,且分属不同分支。本研究首次在江西省牛急性腹泻粪便中检测到BHoV,证实该病毒在江西省的存在,该病毒株与2011年香港BHoV-2分离株JF504698.1亲缘关系最近,该结果为BHoV流行病学研究提供了参考依据。
关键词
牛香港病毒(BHoV)
全基因组序列
进化树
Keywords
Bovine Hokovirus
whole genome sequence
phylogenetic tree
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
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1
江西省急性腹泻牛源的BHoV JX株全基因组序列测定及其分析
吴欢生
康冬柳
胡爱明
刘远超
李家奎
瞿明仁
欧阳克惠
曹华斌
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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