针对滑坡预测聚类研究中由于难以确定传统聚类算法需要预先设置的簇个数和无法精准衡量不确定因素降雨量导致预测效果欠佳的问题,提出一种新的聚类算法——不确定PAHT(partition algorithm on the hierarchical thinking)算法。该算法...针对滑坡预测聚类研究中由于难以确定传统聚类算法需要预先设置的簇个数和无法精准衡量不确定因素降雨量导致预测效果欠佳的问题,提出一种新的聚类算法——不确定PAHT(partition algorithm on the hierarchical thinking)算法。该算法引入一种不确定数据模型——M-D距离,有效刻画了不确定的雨量数据;并结合层次聚类思想,通过找出最佳阈值p~*自动确定k值。以延安宝塔区为实例进行对比实验,实验结果验证了不确定M-D距离和PAHT算法的有效性及不确定PAHT算法在滑坡危险性预测上的可行性。展开更多
针对大数据下密度聚类算法中存在的数据划分不合理、参数寻优能力不佳、并行性能较低等问题,提出一种基于IFOA的并行密度聚类算法(density-based clustering algorithm by using improve fruit fly optimization based on MapReduce,MR-...针对大数据下密度聚类算法中存在的数据划分不合理、参数寻优能力不佳、并行性能较低等问题,提出一种基于IFOA的并行密度聚类算法(density-based clustering algorithm by using improve fruit fly optimization based on MapReduce,MR-DBIFOA)。首先,该算法基于KD树,提出网格划分策略(divide gird based on KD tree,KDG)来自动划分数据网格;其次在局部聚类中,提出基于自适应搜索策略(step strategy based on knowledge learn,KLSS)和聚类判定函数(clustering criterion function,CCF)的果蝇群优化算法(improve fruit fly optimization algorithm,IFOA);然后根据IFOA进行局部聚类中最优参数的动态寻优,从而使局部聚类的聚类效果得到提升;同时结合MapReduce模型提出局部聚类算法DBIFOA(density-based clustering algorithm using IFOA);最后提出了基于QR-tree的并行合并局部簇算法(cluster merging algorithm by using MapReduce,MR-QRMEC),实现局部簇的并行合并,使算法整体的并行性能得到加强。实验表明,MR-DBIFOA在大数据下的并行效率更高,且聚类效果更好。展开更多
针对蚁群融合FCM聚类算法在蛋白质相互作用网络中进行复合物识别的准确率不高、召回率较低以及时间性能不佳等问题进行了研究,提出一种基于模糊蚁群的加权蛋白质复合物识别算法FAC-PC(algorithm for identifying weighted protein compl...针对蚁群融合FCM聚类算法在蛋白质相互作用网络中进行复合物识别的准确率不高、召回率较低以及时间性能不佳等问题进行了研究,提出一种基于模糊蚁群的加权蛋白质复合物识别算法FAC-PC(algorithm for identifying weighted protein complexes based on fuzzy ant colony clustering)。首先,融合边聚集系数与基因共表达的皮尔森相关系数构建加权网络;其次提出EPS(essential protein selection)度量公式来选取关键蛋白质,遍历关键蛋白质的邻居节点,设计蛋白质适应度PFC(protein fitness calculation)来获取关键组蛋白质,利用关键组蛋白质替换种子节点进行蚁群聚类,克服蚁群算法中因大量拾起放下和重复合并过滤操作而导致准确率较低和收敛速度过慢的缺陷;接着设计SI(similarity improvement)度量优化拾起放下概率来对节点进行蚁群聚类进而获得聚类数目;最后将关键蛋白质和通过蚁群聚类得到的聚类数目初始化FCM算法,设计隶属度更新策略来优化隶属度的更新,同时提出兼顾类内距和类间距的FCM迭代目标函数,最终利用改进的FCM完成复合物的识别。将FAC-PC算法应用在DIP数据上进行复合物的识别,实验结果表明FAC-PC算法的准确率和召回率较高,能够较准确地识别蛋白质复合物。展开更多
文摘针对滑坡预测聚类研究中由于难以确定传统聚类算法需要预先设置的簇个数和无法精准衡量不确定因素降雨量导致预测效果欠佳的问题,提出一种新的聚类算法——不确定PAHT(partition algorithm on the hierarchical thinking)算法。该算法引入一种不确定数据模型——M-D距离,有效刻画了不确定的雨量数据;并结合层次聚类思想,通过找出最佳阈值p~*自动确定k值。以延安宝塔区为实例进行对比实验,实验结果验证了不确定M-D距离和PAHT算法的有效性及不确定PAHT算法在滑坡危险性预测上的可行性。
文摘针对大数据下密度聚类算法中存在的数据划分不合理、参数寻优能力不佳、并行性能较低等问题,提出一种基于IFOA的并行密度聚类算法(density-based clustering algorithm by using improve fruit fly optimization based on MapReduce,MR-DBIFOA)。首先,该算法基于KD树,提出网格划分策略(divide gird based on KD tree,KDG)来自动划分数据网格;其次在局部聚类中,提出基于自适应搜索策略(step strategy based on knowledge learn,KLSS)和聚类判定函数(clustering criterion function,CCF)的果蝇群优化算法(improve fruit fly optimization algorithm,IFOA);然后根据IFOA进行局部聚类中最优参数的动态寻优,从而使局部聚类的聚类效果得到提升;同时结合MapReduce模型提出局部聚类算法DBIFOA(density-based clustering algorithm using IFOA);最后提出了基于QR-tree的并行合并局部簇算法(cluster merging algorithm by using MapReduce,MR-QRMEC),实现局部簇的并行合并,使算法整体的并行性能得到加强。实验表明,MR-DBIFOA在大数据下的并行效率更高,且聚类效果更好。
文摘针对蚁群融合FCM聚类算法在蛋白质相互作用网络中进行复合物识别的准确率不高、召回率较低以及时间性能不佳等问题进行了研究,提出一种基于模糊蚁群的加权蛋白质复合物识别算法FAC-PC(algorithm for identifying weighted protein complexes based on fuzzy ant colony clustering)。首先,融合边聚集系数与基因共表达的皮尔森相关系数构建加权网络;其次提出EPS(essential protein selection)度量公式来选取关键蛋白质,遍历关键蛋白质的邻居节点,设计蛋白质适应度PFC(protein fitness calculation)来获取关键组蛋白质,利用关键组蛋白质替换种子节点进行蚁群聚类,克服蚁群算法中因大量拾起放下和重复合并过滤操作而导致准确率较低和收敛速度过慢的缺陷;接着设计SI(similarity improvement)度量优化拾起放下概率来对节点进行蚁群聚类进而获得聚类数目;最后将关键蛋白质和通过蚁群聚类得到的聚类数目初始化FCM算法,设计隶属度更新策略来优化隶属度的更新,同时提出兼顾类内距和类间距的FCM迭代目标函数,最终利用改进的FCM完成复合物的识别。将FAC-PC算法应用在DIP数据上进行复合物的识别,实验结果表明FAC-PC算法的准确率和召回率较高,能够较准确地识别蛋白质复合物。
