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题名南酸枣转录组特征分析及SSR标记开发
被引量：1
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作者
徐梦阳
蔡宇宇
李婷
吴南生
孙荣喜
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机构
江西农业大学林学院南酸枣研究所
江西农业大学林学院亚热带森林资源培育江西省重点实验室
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出处
《广西植物》
北大核心
2025年第4期641-653,共13页
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基金
国家自然科学基金(32160387)。
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文摘
通过对南酸枣(Choerospondias axillaris)雌雄转录组特征进行分析及SSR标记开发,为其遗传评价和性别分子辅助育种提供理论支撑和科学依据。该文主要分析南酸枣雌雄转录组表达差异,SSR位点的分布及序列特征,在此基础上开展SSR位点挖掘,并进行SSR引物的开发和有效性验证。结果表明:(1)南酸枣转录组测序共获得40341条Unigenes序列,总长度、N50长度、平均长度和GC含量分别为52806369 bp、2409 bp、1309 bp和38.75%;共筛选到1949个雌雄差异表达基因,其中雄株比雌株显著上调的基因有1052个,下调的基因有897个。(2)在所有Unigenes中共检测到5251个SSR位点,619条Unigenes序列中含有2个及2个以上位点,SSR发生频率为11.18%,平均分布距离为10.06 kb;在所有SSR位点中,二核苷酸重复所占比例最高(46.95%),其次为三核苷酸重复(34.27%)。(3)经筛选及有效性验证共得到20对SSR多态性引物,在85份资源中共检测到80个等位基因,平均多态性信息含量(PIC)为0.56。综上认为,南酸枣叶片转录组测序质量较高,组装效果较好。20对多态性引物为后期遗传评价、性别辅助育种及指纹图谱构建提供参考。
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关键词
南酸枣
引物开发
转录组
SSR
位点特征
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Keywords
Choerospondias axillaris
primer development
transcriptome
SSR
locus characteristics
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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题名温度对不同种源南酸枣叶片性状可塑性的影响
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作者
李婷
叶学敏
孙荣喜
吴南生
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机构
江西农业大学林学院南酸枣研究所
江西省林业科学院南昌城市生态系统国家定位观测研究站
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出处
《热带亚热带植物学报》
北大核心
2025年第3期307-314,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(32160387)
江西省林业科学院青年人才培养项目(2024520802)资助。
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文摘
性状可塑性是植物适应气候变化的关键,然而,如今对气候因子如何影响植物性状可塑性的认识仍然有限。该研究以14个种源的南酸枣为研究对象,通过同质园实验研究不同种源南酸枣在温度和降水梯度下的叶片性状可塑性。结果表明,南酸枣叶片性状可塑性为0.034~0.236。不同种源南酸枣性状可塑性在温度梯度表现出显著变异,但除非结构性碳水化合物可塑性外,其他性状可塑性和降水因子无关。其中,叶长可塑性与年均温、最湿季均温和最冷季均温呈显著正相关,叶面积可塑性与年均温和最冷季均温均呈显著正相关,与平均气温日较差呈显著负相关,相对含水率可塑性与年均温和最冷季均温呈显著正相关,非结构性碳水化合物含量可塑性与年均温和最冷季均温呈显著负相关。温度因子对南酸枣性状可塑性有驱动作用,叶片表型可塑性的变异可能是种群在长期进化中对温度变化的主要适应策略。该研究厘清了温度和降水与性状可塑性的关系,可为预测气候变化背景下南酸枣适应性变化以及种质资源保护提供科学参考。
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关键词
南酸枣
变异系数
叶片功能性状
温度
降水
种源试验
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Keywords
Choerospondias axillaris
Coefficient of variation
Leaf functional trait
Temperature
Rainfall
Provenance test
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分类号
S665.1
[农业科学—果树学]
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