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整合多源转录组学数据鉴别哮喘发生上皮细胞的潜在生物标志物
1
作者
谢连华
卢淑娴
+2 位作者
郭芳阳
张弋峰
刘潜
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025年第8期695-705,共11页
目的基于多源转录组学数据的生物信息学分析,挖掘哮喘上皮细胞的潜在生物标志物,并通过哮喘模型的肺组织及其上皮细胞验证潜在靶基因的表达。方法整合基因表达数据集(GEO)数据库中3组哮喘患者和正常对照组上皮细胞的基因表达谱数据,通...
目的基于多源转录组学数据的生物信息学分析,挖掘哮喘上皮细胞的潜在生物标志物,并通过哮喘模型的肺组织及其上皮细胞验证潜在靶基因的表达。方法整合基因表达数据集(GEO)数据库中3组哮喘患者和正常对照组上皮细胞的基因表达谱数据,通过基因差异表达分析和基因共表达网络分析,鉴别与哮喘相关的关键基因及生物学通路。最后,利用哮喘动物模型在肺组织和肺组织上皮细胞验证主要关键基因。结果通过差异基因表达分析,哮喘上皮细胞与正常对照组相比,存在1121个上调基因和1484个下调基因。生物学通路富集分析表明,上调基因主要参与糖基化过程,下调基因主要参与免疫细胞分化过程。基因共表达网络分析发现,糖基化相关通路的模块9与哮喘呈显著正相关,而参与胰岛素等信号通路的模块17与哮喘呈显著负相关。我们发现多肽N-乙酰半乳糖胺转移酶5(GALNT5)、吡咯啉-5-羧酸还原酶-1(PYCR1)和癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)基因是模块9的关键基因且在哮喘中显著上调。最后,我们在哮喘肺组织上皮细胞中验证了GALNT5、PYCR1和CEACAM5在模型组中表达均上调。同时,通过构建大鼠哮喘模型,我们进一步证实了这三个基因的蛋白水平在模型组肺组织中也显著上调。结论本研究通过数据整合和实验验证,鉴定出与哮喘疾病发展密切相关的关键基因和生物学通路,这些结果为哮喘的诊断和治疗提供新的理论基础和潜在靶点。
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关键词
多源转录组学数据
基因共表达网络
上皮细胞
生物标志物
生物学通路
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职称材料
血塞通软胶囊对东莨菪碱致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力及突触可塑性的影响研究
2
作者
胡小童
胡卓瑶
+3 位作者
曹秀敏
安欣
黄雄峰
陈乔
《海南医科大学学报》
2025年第22期1718-1728,共11页
目的:探究血塞通软胶囊(Xuesaitong soft capsule,XST)对东莨菪碱所致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力的影响及突触可塑性的调节作用。方法:90只雄性昆明小鼠随机分为空白(Control)组,模型(Model)组,盐酸多奈哌齐(DPH)组及血塞通低、...
目的:探究血塞通软胶囊(Xuesaitong soft capsule,XST)对东莨菪碱所致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力的影响及突触可塑性的调节作用。方法:90只雄性昆明小鼠随机分为空白(Control)组,模型(Model)组,盐酸多奈哌齐(DPH)组及血塞通低、中、高剂量(XST-L、XST-M、XST-H)组。通过腹腔注射东莨菪碱制备阿尔茨海默病模型,使用Morris水迷宫检测小鼠空间认知记忆功能改变;H&E染色观测小鼠海马CA1区和皮质区细胞形态改变;透射电镜观察海马超微结构变化;ELISA测定脑组织中环磷酸腺苷(cAMP)含量变化,免疫组化染色检测突触素(SYN)、生长相关蛋白-43(GAP-43)、突触后致密物-95(PSD-95)蛋白水平表达;Western blot检测PSD-95、GAP-43、SYN、环磷酸腺苷反应元件结合蛋白(CREB)、蛋白激酶A(PKA)在海马和皮质区的表达。结果:Morris水迷宫结果显示,与Control组比较,Model组小鼠平均逃避潜伏时间明显延长,穿越平台次数出现减少(P<0.05),游泳轨迹冗长杂乱。与Model组相比,经XST治疗后小鼠平均逃避潜伏期明显缩短,穿越平台次数增加(P<0.05),探寻轨迹简短清晰。H&E染色结果显示,Model组细胞层变薄,神经元排列松散紊乱,部分细胞胞膜破裂,细胞核深染,染色质裂解,突起不同程度消失。与Model组比较,各用药组上述病理变化得到不同程度改善。透射电镜观察结果显示,Model组突触结构不完整,突触间隙模糊,突触小泡以及突触前致密物质减少,药物干预后突触结构相对完整,突触间隙清晰,突触小泡密度增加,线粒体丰富,突触前致密物增多,突触后膜增厚。ELISA结果显示,与Control组比较,Model组cAMP蛋白表达明显减少(P<0.01);与Model组比较,海马区DPH组和XST-H组cAMP含量明显增加(P<0.05),皮质区DPH组、XST-M组和XST-H组cAMP含量明显升高(P<0.05)。免疫组化结果显示,与Control组比较,Model组SYN、GAP-43、PSD-95蛋白表达均呈明显下降趋势(P<0.01)。与Model组相比,其余各组以上蛋白表达均有不同程度的增加(P<0.05)。Western Blot结果显示,与Control组比较,Model组PSD-95、GAP-43、CREB、PKA和SYN蛋白表达明显减少(P<0.05);与Model组比较,药物干预后PSD-95、GAP-43、CREB、PKA和SYN表达水平不同程度增加(P<0.05)。结论:XST能够改善阿尔兹海默病模型小鼠学习记忆能力,其作用机制可能与激活cAMP/PKA/CREB信号通路、修复突触可塑性相关。
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关键词
血塞通软胶囊
阿尔茨海默病
突触可塑性
学习记忆能力
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职称材料
题名
整合多源转录组学数据鉴别哮喘发生上皮细胞的潜在生物标志物
1
作者
谢连华
卢淑娴
郭芳阳
张弋峰
刘潜
机构
江西中医药大学中西医结合一级学科平台
江西
中医药大学
中西医
结合
儿童健康研究院儿童药物创新中心
江西
中医药大学
医学转化中心
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025年第8期695-705,共11页
基金
江西省科学技术厅省级科技专项资金(20243BCC31008,20242BAB25432)
国家级重大科研培育项目(2023ZDPY001)
江西省教育厅省级项目(S202310412060)。
文摘
目的基于多源转录组学数据的生物信息学分析,挖掘哮喘上皮细胞的潜在生物标志物,并通过哮喘模型的肺组织及其上皮细胞验证潜在靶基因的表达。方法整合基因表达数据集(GEO)数据库中3组哮喘患者和正常对照组上皮细胞的基因表达谱数据,通过基因差异表达分析和基因共表达网络分析,鉴别与哮喘相关的关键基因及生物学通路。最后,利用哮喘动物模型在肺组织和肺组织上皮细胞验证主要关键基因。结果通过差异基因表达分析,哮喘上皮细胞与正常对照组相比,存在1121个上调基因和1484个下调基因。生物学通路富集分析表明,上调基因主要参与糖基化过程,下调基因主要参与免疫细胞分化过程。基因共表达网络分析发现,糖基化相关通路的模块9与哮喘呈显著正相关,而参与胰岛素等信号通路的模块17与哮喘呈显著负相关。我们发现多肽N-乙酰半乳糖胺转移酶5(GALNT5)、吡咯啉-5-羧酸还原酶-1(PYCR1)和癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)基因是模块9的关键基因且在哮喘中显著上调。最后,我们在哮喘肺组织上皮细胞中验证了GALNT5、PYCR1和CEACAM5在模型组中表达均上调。同时,通过构建大鼠哮喘模型,我们进一步证实了这三个基因的蛋白水平在模型组肺组织中也显著上调。结论本研究通过数据整合和实验验证,鉴定出与哮喘疾病发展密切相关的关键基因和生物学通路,这些结果为哮喘的诊断和治疗提供新的理论基础和潜在靶点。
关键词
多源转录组学数据
基因共表达网络
上皮细胞
生物标志物
生物学通路
Keywords
multisource transcriptomics data
gene co-expression networks
epithelial cells
biomarkers
biological pathways
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
R256.12 [医药卫生—中医内科学]
R562.25 [医药卫生—呼吸系统]
Q344.13 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
血塞通软胶囊对东莨菪碱致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力及突触可塑性的影响研究
2
作者
胡小童
胡卓瑶
曹秀敏
安欣
黄雄峰
陈乔
机构
江西中医药大学中西医结合一级学科平台
出处
《海南医科大学学报》
2025年第22期1718-1728,共11页
基金
江西省一流学科江西中医药大学中西医结合(zxyylxk20220103)
江西省中医药管理局科技计划项目(2020B0331)
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ211211)。
文摘
目的:探究血塞通软胶囊(Xuesaitong soft capsule,XST)对东莨菪碱所致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力的影响及突触可塑性的调节作用。方法:90只雄性昆明小鼠随机分为空白(Control)组,模型(Model)组,盐酸多奈哌齐(DPH)组及血塞通低、中、高剂量(XST-L、XST-M、XST-H)组。通过腹腔注射东莨菪碱制备阿尔茨海默病模型,使用Morris水迷宫检测小鼠空间认知记忆功能改变;H&E染色观测小鼠海马CA1区和皮质区细胞形态改变;透射电镜观察海马超微结构变化;ELISA测定脑组织中环磷酸腺苷(cAMP)含量变化,免疫组化染色检测突触素(SYN)、生长相关蛋白-43(GAP-43)、突触后致密物-95(PSD-95)蛋白水平表达;Western blot检测PSD-95、GAP-43、SYN、环磷酸腺苷反应元件结合蛋白(CREB)、蛋白激酶A(PKA)在海马和皮质区的表达。结果:Morris水迷宫结果显示,与Control组比较,Model组小鼠平均逃避潜伏时间明显延长,穿越平台次数出现减少(P<0.05),游泳轨迹冗长杂乱。与Model组相比,经XST治疗后小鼠平均逃避潜伏期明显缩短,穿越平台次数增加(P<0.05),探寻轨迹简短清晰。H&E染色结果显示,Model组细胞层变薄,神经元排列松散紊乱,部分细胞胞膜破裂,细胞核深染,染色质裂解,突起不同程度消失。与Model组比较,各用药组上述病理变化得到不同程度改善。透射电镜观察结果显示,Model组突触结构不完整,突触间隙模糊,突触小泡以及突触前致密物质减少,药物干预后突触结构相对完整,突触间隙清晰,突触小泡密度增加,线粒体丰富,突触前致密物增多,突触后膜增厚。ELISA结果显示,与Control组比较,Model组cAMP蛋白表达明显减少(P<0.01);与Model组比较,海马区DPH组和XST-H组cAMP含量明显增加(P<0.05),皮质区DPH组、XST-M组和XST-H组cAMP含量明显升高(P<0.05)。免疫组化结果显示,与Control组比较,Model组SYN、GAP-43、PSD-95蛋白表达均呈明显下降趋势(P<0.01)。与Model组相比,其余各组以上蛋白表达均有不同程度的增加(P<0.05)。Western Blot结果显示,与Control组比较,Model组PSD-95、GAP-43、CREB、PKA和SYN蛋白表达明显减少(P<0.05);与Model组比较,药物干预后PSD-95、GAP-43、CREB、PKA和SYN表达水平不同程度增加(P<0.05)。结论:XST能够改善阿尔兹海默病模型小鼠学习记忆能力,其作用机制可能与激活cAMP/PKA/CREB信号通路、修复突触可塑性相关。
关键词
血塞通软胶囊
阿尔茨海默病
突触可塑性
学习记忆能力
Keywords
Xuesaitong soft capsule
Alzheimer′s disease
Synaptic plasticity
Learning and memory ability
分类号
R285.5 [医药卫生]
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整合多源转录组学数据鉴别哮喘发生上皮细胞的潜在生物标志物
谢连华
卢淑娴
郭芳阳
张弋峰
刘潜
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025
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血塞通软胶囊对东莨菪碱致阿尔茨海默病模型小鼠学习记忆能力及突触可塑性的影响研究
胡小童
胡卓瑶
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黄雄峰
陈乔
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