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基于电负性均衡理论快速计算多肽分子中原子电荷的新方法(英文)
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作者 欧阳永中 花书贵 邓金连 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第1期58-68,共11页
原子电荷在深入理解和模拟蛋白质的化学行为中发挥了重要的作用。通过校正电负性均衡方法(EEM)可快速计算大分子中原子电荷的分布情况。为进一步提高电负性均衡方法的准确性,本文根据Bader提出的分子区域片段中原子电荷高度转移理论,提... 原子电荷在深入理解和模拟蛋白质的化学行为中发挥了重要的作用。通过校正电负性均衡方法(EEM)可快速计算大分子中原子电荷的分布情况。为进一步提高电负性均衡方法的准确性,本文根据Bader提出的分子区域片段中原子电荷高度转移理论,提出了一种校正电负性均衡理论的新方法,专门用于快速、准确计算生物大分子多肽或蛋白质中分子中原子电荷(AIM)。在EEM参数优化过程中,本方法不仅包括了不同原子间的连接性和价键的杂化属性,还考虑了分子片段或基团的区域化学环境因素对校正的影响。本研究对变量优化方法进行了深入讨论,微分进化算法被证明对目标函数有较好地表现。本方法计算的AIM电荷,与密度泛函理论的计算结果进行了比较。结果表明,与原来的EEM模型相比较,本方法计算的AIM电荷的精确度得到了大幅提高,为具有重复分子片段或基团的生物大分子体系(如多肽或蛋白质等)的原子电荷的快速计算提供了一种更为准确的方法,同时也为EEM的校正提供了一种新的思路。 展开更多
关键词 原子电荷 电负性均衡方法 分子中的原子电荷 分子片段转移 化学环境
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结合低场核磁共振分析反复冻融处理对肉鸡不同部位肌肉品质的影响 被引量:15
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作者 朱学伸 黄雪方 +4 位作者 鲁小讯 王艳 赵凯斌 徐铭 王仁雷 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第9期23-28,共6页
利用低场核磁共振(low-field nuclear magnetic resonance,LF-NMR)技术研究反复冻融处理对肉鸡不同部位肌肉品质的影响。结果表明,反复冻融期间p H值变化不显著(P>0.05)。随着冻融次数的增加,肉鸡胸肉和腿肉解冻汁液损失显著下降(P&l... 利用低场核磁共振(low-field nuclear magnetic resonance,LF-NMR)技术研究反复冻融处理对肉鸡不同部位肌肉品质的影响。结果表明,反复冻融期间p H值变化不显著(P>0.05)。随着冻融次数的增加,肉鸡胸肉和腿肉解冻汁液损失显著下降(P<0.05),硫代巴比妥酸反应物质(thiobabituric acid reactive substance,TBARS)值显著增大,总蛋白溶解度以及肌原纤维小片化冻融初期呈现上升趋势,总水分含量均逐渐降低。低场核磁共振T2弛豫时间分析显示,其自由水占比显著下降(P<0.05)。以上结果说明反复冻融使解冻汁液损失伴随自由水比例显著下降而逐步降低,由于肌肉p H值保持稳定,推测反复冻融过程中反复形成的冰晶对肌肉微观结构的破坏,尤其对肌原纤维蛋白质溶解度的影响起到一定的作用。 展开更多
关键词 低场核磁共振 反复冻融 肉鸡 肌肉品质
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超高效液相色谱-串联质谱法测定水中阿莫西林的残留量 被引量:2
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作者 林洁 刘祥萍 孙文芳 《理化检验(化学分册)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期783-786,共4页
采用超高效液相色谱-串联质谱法测定水中低含量的阿莫西林残留。将水样用亲水性聚四氟乙烯针式滤器进行过滤,以Kinetex 2.6μm C_(18)色谱柱为分离柱,以0.01%(体积分数)甲酸溶液-乙腈混合液为流动相进行梯度洗脱,质谱分析中选择电喷雾... 采用超高效液相色谱-串联质谱法测定水中低含量的阿莫西林残留。将水样用亲水性聚四氟乙烯针式滤器进行过滤,以Kinetex 2.6μm C_(18)色谱柱为分离柱,以0.01%(体积分数)甲酸溶液-乙腈混合液为流动相进行梯度洗脱,质谱分析中选择电喷雾正离子源和多反应监测模式,用外标法进行定量。阿莫西林的峰面积与其质量浓度在0.020~1.50μg·L^(-1)范围内呈线性关系,检出限(3S/N)为10 ng·L^(-1),测定下限(10S/N)为20 ng·L^(-1)。加标回收率在91.3%~105%之间,测定值的相对标准差(n=6)小于6.0%。 展开更多
关键词 超高效液相色谱-串联质谱法 阿莫西林 残留
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非共价作用对气相中B-DNA双螺旋结构稳定性的贡献:基于GEBF方法的密度泛函理论计算(英文)
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作者 花书贵 金浩 欧阳永中 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1309-1314,共6页
采用密度泛函理论,将基于能量的分子片方法(GEBF)应用于气相中优化B型脱氧核糖核酸(碱基对数目N=2,5,10)双螺旋构型的结构.通过比较M06-2X泛函和其他方法(B3LYP、B3LYP-vd W和TPSS泛函)的结果,发现不考虑碱基之间的π-π堆积作用将会导... 采用密度泛函理论,将基于能量的分子片方法(GEBF)应用于气相中优化B型脱氧核糖核酸(碱基对数目N=2,5,10)双螺旋构型的结构.通过比较M06-2X泛函和其他方法(B3LYP、B3LYP-vd W和TPSS泛函)的结果,发现不考虑碱基之间的π-π堆积作用将会导致碱基之间的纵向距离拉长.随着体系双螺旋链长的增加,没有考虑碱基堆积作用而导致的相邻碱基纵向距离拉长的程度快速衰减.计算表明,气相中B-DNA双螺旋结构的稳定性来源于其作用力(主要是氢键和π-π堆积作用)的协同性,对不多于10组碱基对的体系而言,其氢键的贡献明显大于碱基堆积作用. 展开更多
关键词 碱基对 氢键 基于能量的分子片方法 Π-Π堆积作用
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光滑异装蟹(Heteropanope glabra)线粒体基因组测定及其在系统发生研究中的意义 被引量:8
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作者 陈建琴 张振华 +3 位作者 邢雨辉 姚文佳 张晨岭 尤蕾 《南京师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期108-114,共7页
本文应用高通量测序方法首次测定了光滑异装蟹(Heteropanope glabra)的线粒体基因组全序列.测序研究发现,光滑异装蟹线粒体基因组全长为16 008 bp,包含典型的蟹类线粒体基因组37条基因,结构紧凑;其碱基组成的AT含量为70.3%; tRNA二级结... 本文应用高通量测序方法首次测定了光滑异装蟹(Heteropanope glabra)的线粒体基因组全序列.测序研究发现,光滑异装蟹线粒体基因组全长为16 008 bp,包含典型的蟹类线粒体基因组37条基因,结构紧凑;其碱基组成的AT含量为70.3%; tRNA二级结构中共有8处错配,且以U/U错配为主.对线粒体基因排列顺序的比较研究发现,光滑异装蟹独享一种新的基因排列模式;这种重排模式与同属毛刺蟹总科(Pilumnoidea)的蝙蝠毛刺蟹(Pilumnus vespertilio)相比有一个trn L2(UUR)发生易位,它们彼此之间共享的nad1易位和trn L2(UUR)倒位则提示二者具有最近共同祖先.这种共享的基因排列顺序为解析毛刺蟹总科(Pilumnoidea)与扇蟹总科(Xanthoidea)的进化关系,并支持将毛刺蟹类从扇蟹总科(Xanthoidea)划分出来提供了独立的分子佐证. 展开更多
关键词 毛刺蟹总科 扇蟹总科 光滑异装蟹 线粒体基因组 系统发生
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水通道蛋白在‘丰水’、‘今村秋’花粉萌发中的作用
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作者 许晔 刘青 +1 位作者 陈曦 徐国华 《南京师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期99-104,共6页
梨花粉在不同渗透压下萌发率会发生变化,用水通道蛋白的抑制剂Hg Cl2和激活剂β-巯基乙醇处理‘丰水’、‘今村秋’花粉培养基,会影响花粉萌发率.在培养基中加入浓度低于0.01%的β-巯基乙醇可以提高花粉萌发率、增加花粉管长度,若浓度高... 梨花粉在不同渗透压下萌发率会发生变化,用水通道蛋白的抑制剂Hg Cl2和激活剂β-巯基乙醇处理‘丰水’、‘今村秋’花粉培养基,会影响花粉萌发率.在培养基中加入浓度低于0.01%的β-巯基乙醇可以提高花粉萌发率、增加花粉管长度,若浓度高于0.01%,β-巯基乙醇即会对花粉造成毒害作用;加入0.001 mmol·L-1Hg Cl2即可降低萌发率,花粉管长度变短,且抑制效果随浓度增高而增强. 展开更多
关键词 水通道蛋白 梨花粉 '丰水’ '今村秋’
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基于蒽醌和三苯胺的红色延迟荧光材料
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作者 黄斌 李紫荆 +3 位作者 胡蝶 吴雯婧 周娜 冯燕 《精细化工》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期764-768,共5页
通过Suzuki反应,在电子受体基团蒽醌(AQ)的α-位引入电子给体基团三苯胺(TPA),合成了3种红色延迟荧光材料(1-TPA-AQ,1,4-2TPA-AQ和1,8-2TPA-AQ),目标化合物的结构经核磁、质谱和元素分析确证。通过理论计算、紫外-可见(UV-vis)... 通过Suzuki反应,在电子受体基团蒽醌(AQ)的α-位引入电子给体基团三苯胺(TPA),合成了3种红色延迟荧光材料(1-TPA-AQ,1,4-2TPA-AQ和1,8-2TPA-AQ),目标化合物的结构经核磁、质谱和元素分析确证。通过理论计算、紫外-可见(UV-vis)吸收光谱、荧光发射光谱和循环伏安(CV)测试,系统地考察了3种化合物的光物理和电化学性质。结果表明,3种化合物的单线态-三线态能级差(ΔEST)分别为0.08、0.09和0.06 eV,最高占有分子轨道(HOMO)能级分别为–5.26、–5.23和–5.27 eV,最低未占分子轨道(LUMO)能级分别为–3.14、–3.10和–3.10 eV。1-TPA-AQ,1,4-2TPA-AQ和1,8-2TPA-AQ在薄膜中的荧光发射波长分别为648、649和636 nm,延迟荧光寿命分别为1.6、2.6和2.1μs,三者均可作为红色延迟荧光材料。 展开更多
关键词 三苯胺 蒽醌 双极 单线态-三线态能级差 延迟荧光 功能材料
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不同还原糖对鲢鱼肉糜凝胶品质的影响 被引量:6
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作者 刘俊雅 施文正 朱学伸 《肉类研究》 2023年第2期6-11,共6页
鲢鱼蛋白质凝胶性差、鱼腥味重是限制其精深加工的主要原因。为了探究糖基化对鲢鱼肉糜凝胶色泽、质构及风味等的影响,选取葡萄糖、低聚异麦芽糖、葡聚糖、L-阿拉伯糖和木糖作为还原糖。利用紫外分光光度计、色差仪、pH计、质构仪和感... 鲢鱼蛋白质凝胶性差、鱼腥味重是限制其精深加工的主要原因。为了探究糖基化对鲢鱼肉糜凝胶色泽、质构及风味等的影响,选取葡萄糖、低聚异麦芽糖、葡聚糖、L-阿拉伯糖和木糖作为还原糖。利用紫外分光光度计、色差仪、pH计、质构仪和感官评价测定样品的接枝度、色泽、pH值、质构和风味变化。结果表明:添加L-阿拉伯糖和木糖的鲢鱼肉糜凝胶的接枝度高达(58.24±0.62)%和(61.89±2.06)%,与未加糖的对照组相比,2组样品的pH值显著下降(P<0.05),褐变和质构指标显著增加(P<0.05);定量描述分析发现,糖基化可以降低鲢鱼肉糜凝胶的鱼腥味,增加肉香味、烤味和烧焦味;喜好度评价表明,要控制接枝度为44.85%~61.89%,才能获得整体可接受度良好的产品。因此,L-阿拉伯糖和木糖是2种较好的还原羰基,可以用于增强鲢鱼肉糜凝胶的质构和香气。 展开更多
关键词 鲢鱼肉糜 糖基化 质构 风味 感官评估
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