江苏省2004—2022年传染病突发公共卫生事件趋势分析 被引量：3

1

作者 陈紫颖 刘鑫 +4 位作者 刘文东 沈文琪 吴莹 时影影 胡建利 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第8期1146-1154,共9页

目的:分析江苏省传染病突发公共卫生事件的流行特征,为防控工作开展提供科学依据。方法:采用joinpoint回归模型分析时间维度变化趋势,采用时空重排扫描探测时空聚集性。结果:2004—2022年累计报告传染病突发事件3641起,累计报告发病131... 目的:分析江苏省传染病突发公共卫生事件的流行特征,为防控工作开展提供科学依据。方法:采用joinpoint回归模型分析时间维度变化趋势,采用时空重排扫描探测时空聚集性。结果:2004—2022年累计报告传染病突发事件3641起,累计报告发病131880例,死亡73例,涉及25种法定传染病突发事件1868起,其中甲类76起、乙类391起、丙类1401起;涉及8种其他传染病突发事件1773起。Joinpoint回归分析显示全省事件数呈增加趋势[平均年度变化百分比(average APC,AAPC=16.28,P<0.05)],甲类自2006年呈下降趋势(AAPC=-18.23,P<0.05),乙类、丙类、其他均呈增加趋势(AAPC>0,P<0.05),苏南、苏中、苏北各区域事件数全局均呈增加趋势(AAPC>0,P<0.05),苏南分为“快速增加—慢速增加—快速增加—减少”4个阶段,苏中事件数单调增加,苏北分为“增加—慢速减少—快速增加—减少”4个阶段。2006年、2015年、2018年为主要转折点。时空重排扫描共探测出8个时空聚集区,按发生顺序分别分布在苏中+苏南—苏北—苏南—苏南+苏北。结论:江苏省传染病突发事件总体呈现增加趋势,苏南和苏北聚集,苏中相对分散,重点地区需做好水痘、流行性感冒、手足口病等重点传染病的疫情监测和防控。 展开更多

关键词 传染病 突发公共卫生事件 joinpoint回归模型 时空重排扫描 趋势分析

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2009～2011年江苏省传染病自动预警系统运行效果分析 被引量：22

2

作者 梁祁 吴莹 +6 位作者 刘文东 李媛 戴启刚 艾静 彭志行 陈峰 胡建利 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1607-1611,共5页

目的:了解2009～2011年江苏省传染病自动预警系统的运行情况,为进一步完善传染病预警工作模式提供依据。方法:对2009～2011年江苏省自动预警系统生成的预警信号、预警病种、响应时间、核实方式等进行描述性分析。结果:3年内,自动预警系... 目的:了解2009～2011年江苏省传染病自动预警系统的运行情况,为进一步完善传染病预警工作模式提供依据。方法:对2009～2011年江苏省自动预警系统生成的预警信号、预警病种、响应时间、核实方式等进行描述性分析。结果:3年内,自动预警系统共发出预警信号31 649条,预警信号响应率为99.93%,阳性率为0.6%。预警信号数与法定传染病发病总数存在正相关关系,r=0.94(P<0.01)。预警信号季节分布呈现春夏季和秋季开学双峰型。2009～2011年预警信号总响应率分别为99.79%、99.99%、100.00%,呈逐年上升趋势。单病例预警中,核实方式以综合分析为主,占54.02%,平均响应时间为0.23～0.33 h;时间模型预警中,核实方式以监测数据分析为主,占47.57%,平均响应时间为0.49～0.76 h。讨论:传染病自动预警系统运行稳定、响应率高,对及时发现重点病例和早期探测传染病暴发具有重要作用。但预警参数设定和预警数据来源还需进一步优化。 展开更多

关键词 自动预警系统 传染病

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2009-2017年江苏省手足口病病原谱及柯萨奇A16型的分子流行病学研究 被引量：38

3

作者 嵇红 鲍倡俊 +3 位作者 祁贤 霍翔 胡建利 樊欢 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期113-119,共7页

目的描述2009-2017年江苏省手足口病(HFMD)病原谱及柯萨奇A16型(CVA16)的流行病学、基因变异及遗传进化特征。方法对2009-2017年江苏省手足口病发病资料和病原学检测情况进行统计分析,选取120株CVA16病毒分离株进行VP1区全长基因序列测... 目的描述2009-2017年江苏省手足口病(HFMD)病原谱及柯萨奇A16型(CVA16)的流行病学、基因变异及遗传进化特征。方法对2009-2017年江苏省手足口病发病资料和病原学检测情况进行统计分析,选取120株CVA16病毒分离株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析。结果 2009-2017年江苏省共报告手足口病1 013 771例。其中,手足口病肠道病毒阳性病例37 389例,主要病原构成为EV71(39.85%)和CVA16(30.13%);重症病例中,以EV71为主要病原,CVA16及其他肠道病毒引起的重症病例较少。CVA16在每年的3～7月和9～11月出现流行高峰,主要感染1～4岁年龄段儿童,男性比例高于女性。江苏省地区流行的CVA16毒株属于B1a亚型和B1b亚型,其中B1b亚型为优势流行基因亚型。120株CVA16病毒分离株VP1区核苷酸及编码氨基酸序列同源性分别为87.5%～100%、97%～100%。结论 2009-2017年,江苏省地区流行的CVA16具有明显的时间、人群分布特征;120株CVA16分离株属于B1a亚型和B1b亚型。CVA16分离株核苷酸序列变异较大,但氨基酸同源性较高,推断存在一定的同义突变。 展开更多

关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 流行病学 遗传特征

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江苏省手足口病病原阳性检出率相关因素及病原学特征 被引量：28

4

作者 李亮 汪华 +7 位作者 史智扬 潘浩 祁贤 吴斌 许可 汤奋扬 祖荣强 朱凤才 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期128-133,共6页

目的:了解江苏省手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)肠道病毒阳性检出率相关因素,并对其EV71病毒的VP1基因特征进行分析。方法:在2008年4～12月份,通过监测哨点医院收集全省手足口病病例的咽拭子、粪便或肛拭子、疱疹液、脑脊液、... 目的:了解江苏省手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)肠道病毒阳性检出率相关因素,并对其EV71病毒的VP1基因特征进行分析。方法:在2008年4～12月份,通过监测哨点医院收集全省手足口病病例的咽拭子、粪便或肛拭子、疱疹液、脑脊液、血清标本,并填写病例相关基本信息。结果:共采集手足口病病例的各种类型标本2082份,咽拭子、肛拭子、疱疹液、粪便、脑脊液、血清的总肠道病毒阳性检出率分别为53.52%、41.12%、40.74%、27.27%、25.00%、9.80%,EV71阳性检出率分别为47.03%、30.84%、33.33%、22.73%、25.00%、2.94%,CoxA16阳性检出率分别为5.34%、8.41%、3.70%、0.00%、0.00%、6.68%,不同类型标本的肠道病毒阳性检出率和阳性检出构成均有差异(P值均<0.0001)。总肠道病毒阳性检出率在发病后第2天最高(56.59%),不同发病与采样时间间隔的总肠道病毒阳性检出率和EV71病毒阳性检出率均有统计学意义(P值分别为0.0019、0.0139),而与CoxA16阳性检出率没有统计学意义(P=0.2558)。总肠道病毒阳性检出率在就诊后第2天最高(59.90%),不同就诊与采样时间间隔的总肠道病毒与EV71病毒阳性检出率有统计学差异(P值分别为0.0228、0.0333),与CoxA16阳性检出率没有统计学差异(P=0.3958)。分离的4株EV71病毒均为C4.3基因亚群。结论:标本类型、采样与发病时间间隔、采样与诊断时间间隔均与手足口病病例的肠道病毒阳性检出率密切相关,分离的EV71毒株为C4亚型。 展开更多

关键词 手足口病 肠道病毒感染 基因型 相关因素

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2017年江苏省H3N2流感病毒血凝素与神经氨酸酶分子特征及耐药性分析 被引量：11

5

作者 王慎骄 祁贤 +5 位作者 邓斐 彭杰夫 余慧燕 秦圆方 戴启刚 鲍倡俊 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第12期1254-1258,共5页

目的流行性感冒(简称流感)耐药性监测目前已成为流感防控中的一项重要组成部分。文中旨在分析江苏省2017年H3N2亚型流感病毒基因变异及耐药性情况。方法从江苏省13个流感监测点流感毒株中选取17株H3N2亚型毒株,其中12株为2017年夏季高... 目的流行性感冒(简称流感)耐药性监测目前已成为流感防控中的一项重要组成部分。文中旨在分析江苏省2017年H3N2亚型流感病毒基因变异及耐药性情况。方法从江苏省13个流感监测点流感毒株中选取17株H3N2亚型毒株,其中12株为2017年夏季高峰期分离株,4株为非高峰期分离株,1株为2016年度分离株(作为1株参考株)。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对H3N2亚型流感毒株进行序列测定,从全球共享流感序列网站GISAID下载构建甲型H3N2亚型流感毒株HA(血凝素)系统进化树的骨架参考序列,使用MAGE7.0软件进行序列比对和系统进化分析。通过神经氨酸酶(NA)抑制试验,分析病毒耐药情况。结果16株病毒HA和NA基因核苷酸相似性分别为98.9%~99.6%、99.2%~99.3%,同源性较高。HA进化树分析显示,16株分离株中15株位于3C.2a分支,13株病毒3个C3.2a1分支关键位点(N171K、I406V和G484E)未发生变化,另外3株毒株关键位点发生变异,1株毒株发生该标志性氨基酸变异,1株毒株发生(N121K、T135K)的免疫相关突变。与2017-2018年度疫苗株推荐株A/HongKong/4801/2014相比,16株分离株抗原位点突变包括:A138S 1株,R142K 2株,R142K、R261Q 9株,R142KS144R、R261Q 1株,R142K、S144K、R261Q 1株。16株病毒的NA片段分析未发现NA耐药位点。基因型和表型分析表明,16株H3N2亚型流感毒株对抗流感药物奥司他韦及扎那米韦均敏感,均发现与M2基因耐药有关A30T、S31N分子位点的改变。结论2017年江苏H3N2亚型流行株HA和NA基因表现出异质性特点及发生基因重配现象,随着H3N2流感病毒变异持续发生,应密切监测病毒遗传进化和耐药基因的变化情况。 展开更多

关键词 流感病毒 H3N2亚型 血凝素 神经氨酸酶 基因特性 耐药性分析

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江苏省1996-2010年人狂犬病疫情分析 被引量：13

6

作者 孟繁岳 鲍倡俊 +2 位作者 李亮 祖荣强 汤奋扬 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期759-762,共4页

目的分析1996-2010年江苏省人狂犬病流行特征与流行趋势。方法用描述流行病学方法对江苏省人狂犬病疫情资料进行分析。结果 1996年以来江苏省出现了全省范围的狂犬病流行,疫情呈迅速的定向扩散,波及全省82.3%的县级行政区;1996-2010年... 目的分析1996-2010年江苏省人狂犬病流行特征与流行趋势。方法用描述流行病学方法对江苏省人狂犬病疫情资料进行分析。结果 1996年以来江苏省出现了全省范围的狂犬病流行,疫情呈迅速的定向扩散,波及全省82.3%的县级行政区;1996-2010年报告病例占同期中国大陆的5.1%,死亡病例排在所有法定报告传染病前4位;同期1 235例人狂犬病统计,农民占73.1%,男女性别比2.0∶1,报告病例数集中于15岁以下和35～75岁年龄范围。结论江苏省处于我国重要的狂犬病流行区,人狂犬病的大范围流行表明犬间疫情的流行强度较高,如果不能有效控制犬间狂犬病的流行,人间疫情很难得到控制。 展开更多

关键词 狂犬病 疫情分析 流行特征

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江苏省2004～2011年感染性腹泻病流行特征分析 被引量：19

7

作者 艾静 刘文东 +7 位作者 梁祁 吴莹 李媛 戴启刚 董晨 钱慧敏 彭志行 汤奋扬 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期401-406,共6页

目的:分析江苏省感染性腹泻病流行特征,为综合防控措施的科学制订和综合监测工作的有效开展提供科学依据。方法:对2004～2011年江苏省感染性腹泻病的发病情况和近5年各类感染性腹泻病的病原学监测结果进行分析,对全省所有县及县以上医... 目的:分析江苏省感染性腹泻病流行特征,为综合防控措施的科学制订和综合监测工作的有效开展提供科学依据。方法:对2004～2011年江苏省感染性腹泻病的发病情况和近5年各类感染性腹泻病的病原学监测结果进行分析,对全省所有县及县以上医疗机构在感染性腹泻病实验室检测方面的相关工作开展情况进行调查。结果:2004～2010年全省感染性腹泻病发病率呈现逐年下降趋势,2011年发病率有所反弹,年平均发病率43.79/10万;2004年以来其他感染性腹泻病在感染性腹泻病中所占的构成比增加趋势明显;感染性腹泻病总体呈较为典型的夏季高峰,但伤寒+副伤寒的季节分布近8年中有6年在8、9、10月呈现"V"字型分布,有一定的特殊性和规律性;各类感染性腹泻病的职业分布集中在农民、散居儿童、学生和工人4类人群;发病以男性为主,性别构成比逐年略有增加;随着年龄段上升发病率逐渐下降;报告发病率和实验室检测工作开展率均为苏南高于苏中,苏中高于苏北。病原学监测结果显示,近年来,我省霍乱和痢疾的菌群和菌型分布有所变化,伤寒+副伤寒菌群和菌型分布较为稳定。结论:江苏省感染性腹泻病近年来得到了较好的控制,总体和各分类病种发病特征有一定的规律性和趋势性,今后除继续做好此类传染病的监测和防控工作外,应进一步加强腹泻类传染病病原检测能力、提高实验室诊断率和病原学诊断结果的报告率。 展开更多

关键词 感染性腹泻病 发病 流行病学

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江苏省戊型肝炎发病趋势的时间序列模型应用 被引量：14

8

作者 胡建利 祖荣强 +2 位作者 彭志行 陈峰 鲍昌俊 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1874-1878,共5页

目的:探讨ARIMA模型在戊型肝炎发病预测方面的应用,为戊型肝炎的早期预警提供决策依据。方法:应用E-views5.0软件对1997～2009年江苏省戊型肝炎月发病数据进行模型拟合,建立时间序列分析模型,用模型对2010年戊型肝炎逐月发病数进行预测... 目的:探讨ARIMA模型在戊型肝炎发病预测方面的应用,为戊型肝炎的早期预警提供决策依据。方法:应用E-views5.0软件对1997～2009年江苏省戊型肝炎月发病数据进行模型拟合,建立时间序列分析模型,用模型对2010年戊型肝炎逐月发病数进行预测分析,并用2010年的实际发病数据评估模型预测效果。结果:ARIMA模型较好地拟合了既往戊型肝炎的实际发病序列,残差序列通过了白噪声检验(P>0.05),对2010年各月发病数进行预测也获得了较好的预测效果。结论:ARI-MA模型能较好地模拟江苏省戊型肝炎的发病趋势,可用于戊型肝炎疫情的短期预测和动态分析。 展开更多

关键词 ARIMA模型 时间序列 戊型肝炎 预测

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江苏省2010年O1群霍乱疫情分离株病原学特征分析 被引量：4

9

作者 董晨 张雪峰 +6 位作者 谈忠鸣 钱慧敏 顾玲 刘文东 崔志刚 汤奋扬 朱叶飞 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1317-1323,共7页

目的 :分析2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株病原学特征,为霍乱疫情分析及临床治疗提供实验室依据。方法 :对2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株进行毒力基因检测、ctx B基因序列分析、抗生素敏感性实验、脉冲场凝胶电泳分子分型分析。结果:... 目的 :分析2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株病原学特征,为霍乱疫情分析及临床治疗提供实验室依据。方法 :对2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株进行毒力基因检测、ctx B基因序列分析、抗生素敏感性实验、脉冲场凝胶电泳分子分型分析。结果:2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株均携带毒力基因ctx A、ace、zot、tox R、tcp I、omp U、rtx C、tcp AEL、hly AEL,且CTXB氨基酸序列为古典型;对庆大霉素、诺氟沙星、环丙沙星100%敏感,对复方新诺明、链霉素100%耐药,且均为多重耐药株;除VC201014外,其余14株菌脉冲场凝胶电泳图谱相似度达100%。结论:2010年9月初至10月初,发生在江苏省徐州、淮安、宿迁、南京4个地市的O1群霍乱疫情可能是有关联的暴发流行,2010年8月底发生在连云港的O1群霍乱疫情是一起散发疫情,与上述四地的霍乱疫情可能没有流行病学关联,所有疫情的病原均为非典型埃尔托型霍乱弧菌,庆大霉素、诺氟沙星、环丙沙星可作为临床治疗的首选药物。 展开更多

关键词 非典型埃尔托霍乱弧菌 毒力基因 耐药性 CTX B 脉冲场凝胶电泳

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2013-2022年江苏省柯萨奇病毒A6型全基因组序列特征分析 被引量：3

10

作者 樊欢 鲍倡俊 +2 位作者 朱立国 胡建利 嵇红 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2023年第12期1165-1173,共9页

目的 研究江苏省2013-2022年分离到的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析,以期从分子流行病学特征的角度解释CV-A6取代肠道病毒A71和柯萨奇病毒A16成为江苏省引起手足口病(HFMD)主要病原的原... 目的 研究江苏省2013-2022年分离到的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析,以期从分子流行病学特征的角度解释CV-A6取代肠道病毒A71和柯萨奇病毒A16成为江苏省引起手足口病(HFMD)主要病原的原因。方法 选取2013-2022年间江苏省地区流行的35株CV-A6毒株进行全基因组测序,采用DNASTAR、MEGA7.0和Similarity plots3.5.1等软件对获取的全基因组序列进行比对、相似性分析、系统进化分析和基因重组分析,对P1编码区和3D区主要氨基酸变异位点进行分析。结果 35株CV-A6江苏毒株的全基因组核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.5%~99.6%和97.0%~99.8%,与CV-A6原型株Gdula/USA/1949的全基因组核苷酸序列相似性仅为80.3%~81.0%,氨基酸序列相似性为94.7%~95.3%。基于VP1序列的系统进化树结果显示,2013-2022年江苏省有34株CV-A6分离毒株分属于D3a基因亚型,1株分属于D2基因亚型;基于3D区进化树划分不同重组模式,2013-2022年江苏省流行的CV-A6出现过4个重组进化分支:RF-A、RF-L、RF-K和RF-C型。重组分析结果显示:江苏省流行的CV-A6毒株与CV-A6原型株Gdula/USA/1949在结构蛋白序列上具有较高的相似性。而在非结构蛋白和非编码区则与其他EV-A原型株序列相似性更高。而氨基酸突变位点分析结果显示,与原型株Gdula/USA/1949相比,P1区和3D区多个氨基酸位点变异频繁,可能会使得衣壳蛋白的结构、潜在的受体结合位点产生变化。结论 通过对2013-2022年江苏省CV-A6的全基因组序列分析,有助于了解江苏省CV-A6基因重组及遗传进化关系,解释了近年来CV-A6成为手足口病的主要病原体的可能原因,对CV-A6的防控工作提供了基础资料。 展开更多

关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组6型 基因重组 遗传特征

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江苏省乙型肝炎病例实验室诊断符合率调查分析 被引量：5

11

作者 李媛 梁祁 +2 位作者 戴启刚 刘文东 吴莹 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期270-274,共5页

目的 ：调查分析2012年江苏省乙肝病例实验室诊断符合情况。方法 ：采用分层随机抽样的方法 ,在江苏省南、中、北部三地区各抽2~3地市,再分别抽取省、市、县级医疗机构。结果：本次共调查23家县级及以上医疗机构,收回有效调查病例287例... 目的 ：调查分析2012年江苏省乙肝病例实验室诊断符合情况。方法 ：采用分层随机抽样的方法 ,在江苏省南、中、北部三地区各抽2~3地市,再分别抽取省、市、县级医疗机构。结果：本次共调查23家县级及以上医疗机构,收回有效调查病例287例,实验室诊断符合率为75.26%。省级医疗机构诊断符合率最低;临床医生乙肝实验室诊断标准知晓率为23.68%,诊断与报告类型知晓率为36.52%,县级医疗机构临床医生两者知晓率均最高。结论：江苏省乙肝实验室诊断符合率相对较高,但临床医生乙肝相关知识知晓率亟待提高。需进一步加强培训与沟通,完善乙肝监测网络。 展开更多

关键词 乙型肝炎 诊断符合率

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江苏省2012年柯萨奇病毒A组16型基因特征分析 被引量：2

12

作者 单军 嵇红 +6 位作者 包林 付建光 王慎骄 祁贤 汤奋扬 周明浩 朱叶飞 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期80-83,共4页

目的：了解江苏省2012年柯萨奇病毒A组16型（CA16）分离株VP1区基因特征。方法：选取江苏省2012年14株CA16病毒分离株,用1对特异性引物进行VP1区核苷酸序列扩增,对扩增产物进行测序,利用生物信息学软件对序列进行分析,结果与CA16参考株... 目的：了解江苏省2012年柯萨奇病毒A组16型（CA16）分离株VP1区基因特征。方法：选取江苏省2012年14株CA16病毒分离株,用1对特异性引物进行VP1区核苷酸序列扩增,对扩增产物进行测序,利用生物信息学软件对序列进行分析,结果与CA16参考株序列进行同源性比较并构建基因进化树。结果：14株CA16分离株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为90.5%~100.0%和98.7%~100.0%,与CA16国际标准株G10的核苷酸和氨基酸同源性分别为75.5%~76.7%和91.6%~92.3%。江苏省2012年的CA16分离株全部属于B1基因亚型,同时包含B1a 和B1b 两条进化分支。结论：江苏省2012年有CA16病毒的B1a与B1b两种进化分支共同存在与循环,且呈现以B1b基因亚型为优势型别。B1a基因亚型为辅助型别的传播模式;无论是优势型别还是辅助型别,均各自呈现密切的亲缘关系。 展开更多

关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组16 型 VP1基因 基因型

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江苏省某地区人源与猪源戊型肝炎病毒的检测和部分序列分析 被引量：3

13

作者 张雪峰 闫强 +5 位作者 艾星 姜汉民 蔡加平 王忠泽 张军 朱凤才 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期500-504,共5页

目的:调查了解江苏省某农村地区人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)的相关性。方法:应用逆转录-巢式聚合酶链法(RT-PCR)对同一地区内一般人群中HEV IgM阳性者、急性戊型肝炎患者血标本和生猪胆囊标本进行HEV RNA检测,并对HEV RNA阳性标本进行... 目的:调查了解江苏省某农村地区人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)的相关性。方法:应用逆转录-巢式聚合酶链法(RT-PCR)对同一地区内一般人群中HEV IgM阳性者、急性戊型肝炎患者血标本和生猪胆囊标本进行HEV RNA检测,并对HEV RNA阳性标本进行克隆测序和序列分析。结果:一般人群中检出的HEV基因1、4型比例相近,临床散发性戊肝病例绝大部分为HEV-4型病毒感染所致(95.24%);生猪胆汁标本PCR阳性率为12.11%,猪源HEV基因分型均为HEV-4型;分离于人和生猪的HEV-4型病毒高度同源,同源性81%～97%。结论:该地区人群HEV基因分型以HEV-4型为优势毒株;猪源HEV均为基因4型;人源和猪源的HEV-4型病毒高度同源,猪是当地HEV主要宿主动物之一。 展开更多

关键词 戊型肝炎病毒 基因型 序列分析 人兽共患病

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2020年江苏省新型冠状病毒感染的肺炎时空分析 被引量：2

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作者 时影影 沈文琪 +3 位作者 嵇红 赵子平 吴莹 刘文东 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1232-1238,共7页

目的:分析江苏省新型冠状病毒感染的肺炎疫情时空聚集性,为进一步做好疫情防控提供依据。方法:绘制发病流行曲线、点标记图描述时空演变。采用最邻近指数(nearest neighbor indicator,NNI)估计本土病例全局聚集性;以县(区)为单位,采用Ku... 目的:分析江苏省新型冠状病毒感染的肺炎疫情时空聚集性,为进一步做好疫情防控提供依据。方法:绘制发病流行曲线、点标记图描述时空演变。采用最邻近指数(nearest neighbor indicator,NNI)估计本土病例全局聚集性;以县(区)为单位,采用Kulldorff扫描统计量探测时空聚集区。使用Excel 2010、SaTScan 9.6.1、ArcGIS 10.2进行分析。结果:江苏省2020年1—12月共报告684例确诊病例,其中本土631例,境外输入53例。本土病例波及全省79.44%的县(区),存在空间聚集性(NNI=0.27,P <0.01)。时空扫描显示一级聚集区位于苏北4个设区市交界处,包括21个县区,时间为1月26日—2月1日(LLR=74.92,RR=5.06,P <0.01);3个二级聚集区涉及27个县区,其中二级聚集区2时间为2月上旬。输入病例涉及11个设区市28个县(区),其中南京23例、连云港9例。结论:江苏省疫情特征表现为"南北聚集,中部分散"。苏南长三角核心城市和苏北交通枢纽地区应不断优化防控策略,以早期发现并控制潜在的暴发。 展开更多

关键词 新型冠状病毒感染的肺炎 最邻近指数 时空扫描 江苏

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江苏省输入性登革热1例病毒分离鉴定及分子特征分析 被引量：1

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作者 王慎骄 朱小娟 +8 位作者 付建光 单军 秦圆方 李志峰 王笑辰 汤奋扬 朱叶飞 鲍昌俊 祁贤 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1324-1328,共5页

目的 :从江苏省2012年4月1例菲律宾输入的疑似登革热患者急性期血清中分离病毒并分析其分子生物学特征,以找出病原学证据。方法:收集患者血清样本,采用胶体金法检测登革病毒的Ig M、Ig G抗体;用C6/36细胞分离病毒,对细胞病变的标本进行R... 目的 :从江苏省2012年4月1例菲律宾输入的疑似登革热患者急性期血清中分离病毒并分析其分子生物学特征,以找出病原学证据。方法:收集患者血清样本,采用胶体金法检测登革病毒的Ig M、Ig G抗体;用C6/36细胞分离病毒,对细胞病变的标本进行RT-PCR及荧光定量PCR检测登革病毒RNA和鉴定型别;采用高通量测序技术对该分离株进行编码区基因测序,用MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析。结果:从患者血清样本中检测到登革病毒的Ig M抗体,分离到的毒株经鉴定为登革病毒1型,与美国Haw O3663毒株的核苷酸同源性>98%。结论:该病例是由登革病毒1型引起的输入性病例。 展开更多

关键词 登革热 登革病毒1型 输入病例 序列分析

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2005—2020年江苏省结核病发病和死亡趋势分析 被引量：10

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作者 张瑜 卢鹏 +2 位作者 竺丽梅 陆伟 羊海涛 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1309-1314,1334,共7页

目的:分析江苏省2005—2020年结核病发病和死亡趋势,并探讨年龄、时期及队列对其影响,为后期更好地控制结核病提供科学依据。方法:采用Joinpoint回归方法分析江苏省2005—2020年结核病发病与死亡数据,计算其年度变化百分比(annual perce... 目的:分析江苏省2005—2020年结核病发病和死亡趋势,并探讨年龄、时期及队列对其影响,为后期更好地控制结核病提供科学依据。方法:采用Joinpoint回归方法分析江苏省2005—2020年结核病发病与死亡数据,计算其年度变化百分比(annual percent change,APC)和平均年度变化百分比(average annual percent change,AAPC),采用基于R语言的年龄-时期-队列模型网络工具对0~89岁人群的数据进行统计分析,估算其效应值。结果:男性、女性及总人口年龄调整发病率呈现下降趋势(APC=AAPC=-7.3%,P<0.001;APC=AAPC=-6.8%,P<0.001;APC=AAPC=-7.1%,P<0.001),男性、女性及总人口年龄调整死亡率总体呈现下降趋势(APC=AAPC=-10.4%,P<0.001;AAPC=-17.2%,P<0.001;APC=AAPC=-10.0%,P<0.001),人群发病率均在20~24岁及70~74岁达到较高值,死亡率在80~84岁达到最高值,人群发病及死亡风险随着时期推移逐渐下降,越晚出生的队列发病及死亡风险越低。结论:重点关注年龄对结核病的影响,男性、20~24岁和70~74岁人群是结核病发病的高危人群,80~84岁年龄段人群是结核病死亡的高危人群。 展开更多

关键词 结核 Joinpoint回归 年龄-时期-序列模型 发病率 死亡率

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基于ARIMA模型的江苏省不同地区肺结核发病趋势的预测 被引量：15

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作者 游楠楠 刘巧 +1 位作者 李忠奇 羊海涛 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期909-914,919,共7页

目的:应用差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型对江苏省常州市和盐城市的肺结核发病情况进行预测,探索其用于预测江苏地区肺结核疫情的可行性,为今后结核病防控工作提供参考依据。方法:收集并整理... 目的:应用差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型对江苏省常州市和盐城市的肺结核发病情况进行预测,探索其用于预测江苏地区肺结核疫情的可行性,为今后结核病防控工作提供参考依据。方法:收集并整理江苏省常州市和盐城市2005年1月—2016年12月肺结核月登记发病数资料,使用R3.5.2软件建立ARIMA模型,分别对两市2017年1—12月肺结核月登记发病数进行预测,以平均绝对百分比误差(mean absolute percent error,MAPE)、均方根误差(root mean square error,RMSE)和平均绝对误差(mean absolute error,MAE)评估ARIMA模型预测的准确性。结果:常州市的最优预测模型为ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12,盐城市的最优预测模型为ARIMA(1,1,1)(0,1,1)12。用于预测2017年肺结核月登记发病数时,两市的MAPE分别为8.7186和16.7278,RMSE分别为14.0617和39.4872,MAE分别为11.3813和33.3498。结论:ARIMA模型预测常州市肺结核月登记发病数的拟合效果相对较好,故推测该模型更适用于苏南地区肺结核疫情的短期预测和动态分析。 展开更多

关键词 ARIMA模型 时间序列分析 肺结核 预测

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2009-2020年江苏省南通市耐多药/利福平耐药肺结核诊疗服务特征的纵向研究 被引量：5

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作者 车贝贝 王小平 +4 位作者 邱青 陈诚 郑旭彬 赵琦 徐飚 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第9期864-871,共8页

目的:纵向描述江苏省南通市2009-2020年耐多药/利福平耐药肺结核(MDR/RR-PTB)患者发现、人群特征和诊疗情况,为优化MDR/RR-PTB卫生政策提供科学依据。方法:基于“结核病信息管理系统”,导出南通市2009-2020年MDR/RR-PTB管理数据库,描述M... 目的:纵向描述江苏省南通市2009-2020年耐多药/利福平耐药肺结核(MDR/RR-PTB)患者发现、人群特征和诊疗情况,为优化MDR/RR-PTB卫生政策提供科学依据。方法:基于“结核病信息管理系统”,导出南通市2009-2020年MDR/RR-PTB管理数据库,描述MDR/RR-PTB检出率、患者特征、诊断延误和治疗情况的纵向变化趋势。结果:南通市2009-2020年共确诊MDR/RR-PTB患者426例,其中2014-2020年共筛查4030例,检出率为5.43%(219/4030)。MDR/RR-PTB的检出率因筛查政策调整年间略有波动,从2014年的16.83%(34/202)下降至2020年的2.85%(32/1123),总体呈缓慢下降趋势(Z趋势=-11.541,P<0.001)。12年间登记的MDR/RR-PTB患者中,初治的比例从2009年的0上升至2020年的53.12%(17/32),≥80岁的患者的比例从2009年的53.85%(7/13)下降至2020年的3.12%(1/32)。患者的诊断延误总体呈现下降趋势,由2009年的97(78,207) d下降至2020年的0(0,0) d。纳入治疗的MDR/RR-PTB患者的治疗成功率从2009年的60.00%(6/10)升高至2020年的71.88%(23/32),病亡率由2009年的20.00%(2/10)下降至2020年的9.38%(3/32)。结论:南通市MDR/RR-PTB患者检出率稳中有降,维持在相对较低水平,登记患者随时间呈年轻化趋势,初治患者占比逐年升高,患者的诊断延误时间显著下降。建议规范患者尤其是利福平耐药肺结核患者的治疗管理,减少耐药肺结核的传播。 展开更多

关键词 结核 抗药性 院内诊疗 流行病学研究特征(主题) 纵向研究

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2021年江苏省某市新型冠状病毒感染本土疫情中疑似采样点继发感染情况及采样策略评价 被引量：1

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作者 张楠 沈雅 +4 位作者 金广杰 王寅 李建军 胡建利 朱凤才 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期581-585,共5页

目的 探讨新型冠状病毒(新冠病毒)感染疫情中疑似采样活动引发的新冠病毒继发感染等相关问题。方法 2021年7-8月江苏省某市暴发新冠病毒Delta变异株本土疫情,以此期间江苏省新冠病毒核酸检测系统中的检测信息为依据,结合病例的流行病学... 目的 探讨新型冠状病毒(新冠病毒)感染疫情中疑似采样活动引发的新冠病毒继发感染等相关问题。方法 2021年7-8月江苏省某市暴发新冠病毒Delta变异株本土疫情,以此期间江苏省新冠病毒核酸检测系统中的检测信息为依据,结合病例的流行病学史、实验室基因测序结果等,筛选出疑似因采样活动引发继发新冠病毒感染的案例,分析继发病例单次暴露与关联病例发病/首次检测阳性的时间间隔,评估不同采样模式发生采样点继发新冠病毒感染的风险。结果 共有8个采样点疑似发生新冠病毒继发感染,涉及病例42例,其中L村开展的大规模新冠病毒核酸检测活动涉及32例病例。42例继发新冠病毒感染病例中,25例有明确感染来源并属于单次暴露感染,分别在与关联病例发病前3、7 d,关联病例首次检测阳性前0、1、3、4 d,以及首次检测阳性后1 d发生单次暴露,其中在关联病例首次检测阳性后1 d发生单次暴露的继发感染病例较多,占64.0%(16/25)。不同采样模式发生采样点继发新冠病毒感染的风险为:大规模人群集中采样>以街道或社区为单元的采样>入户采样。结论 大规模人群集中采样发生采样点继发新冠病毒感染的风险较大,其引起后续疫情传播和扩散的风险较大,选择以街道或社区为单元的采样和入户采样的模式较优,但做好采样现场秩序维护和个人防护仍是避免采样点继发新冠病毒感染的关键措施。 展开更多

关键词 新型冠状病毒感染 核酸检测 继发感染 传染性 采样策略

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糖尿病和血糖控制水平对结核病发病风险的影响:基于人群的队列研究

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作者 连依琳 李晨 +4 位作者 卢鹏 刘巧 竺丽梅 洪忻 羊海涛 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第12期1723-1728,共6页

目的:探讨血糖控制对结核病发病风险的影响。方法:在江苏省南京市对60 283例受试者进行为期6年的队列研究,在排除了基线筛查时发现的活动性结核病患者后,将受试者与南京市结核病患者管理信息进行匹配以发现活动性结核病患者。采用Cox比... 目的:探讨血糖控制对结核病发病风险的影响。方法:在江苏省南京市对60 283例受试者进行为期6年的队列研究,在排除了基线筛查时发现的活动性结核病患者后,将受试者与南京市结核病患者管理信息进行匹配以发现活动性结核病患者。采用Cox比例风险模型,调整年龄、性别等因素后比较糖尿病患者与非糖尿病患者的结核病发病风险,并比较糖尿病患者血糖控制良好组与血糖控制不佳组结核病发病的差异。结果:在6年的随访中,共发现活动性结核病患者79例,发病密度为25.6(95%CI:20.4~31.7)/10万人年。在79例患者中,糖尿病占21.5%(17/79),结核发病密度为58.8(95%CI:35.4~92.2)/10万人年。非糖尿病患者占78.5%(62/79),结核发病密度为22.1(95%CI:17.1~28.2)/10万人年。血糖控制良好组活动性结核病发病密度为29.6(95%CI:21.4~33.1)/10万人年,血糖控制不佳组活动性结核病发病密度为63.5(95%CI:39.3~96.8)/10万人年。糖尿病患者发生结核病的风险是一般人群的3.057倍(HR=3.057,95%CI:1.770~5.281,P <0.001);血糖控制不佳组发生结核病的风险是血糖控制良好组的3.766倍(HR=3.766,95%CI:2.054~6.906,P <0.001)。结论:大规模人群队列研究表明,血糖控制不佳的糖尿病患者患结核病的风险增加,因此,加强对血糖控制不佳的糖尿病患者进行筛查,可以及早发现结核病,有助于降低中国结核病的发病率和流行程度。 展开更多

关键词 结核病 糖尿病 血糖控制 发病风险

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