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大肠杆菌F18菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基因表达谱差异分析
被引量：
5
1
作者
包文斌
叶兰
+6 位作者
潘章源
朱璟
杜子栋
蔡家嘉
黄小国
朱国强
吴圣龙
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期60-66,共7页
文章运用Agilent双标记表达谱芯片,基于已建立的苏太猪大肠杆菌F18菌株敏感性和抗性型全同胞配对个体,分析十二指肠组织基因表达谱差异,旨在筛选导致仔猪断奶后腹泻和水肿病发生的大肠杆菌F18菌株受体相关基因,探讨造成大肠杆菌病抗性...
文章运用Agilent双标记表达谱芯片,基于已建立的苏太猪大肠杆菌F18菌株敏感性和抗性型全同胞配对个体,分析十二指肠组织基因表达谱差异,旨在筛选导致仔猪断奶后腹泻和水肿病发生的大肠杆菌F18菌株受体相关基因,探讨造成大肠杆菌病抗性和敏感性资源家系抗性差异的分子生物学机理。研究结果显示,以Fold change绝对值大于2倍进行筛选,在敏感型(GG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,差异基因共13个,其中上调6个,下调7个,在以敏感型(AG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,共筛选出差异基因6个,其中上调4个,下调2个。经GO分析发现差异基因的生物学过程主要涉及免疫应答、胞外区修饰(如糖基化)、细胞黏附、信号转导等。通路发现大肠杆菌F18菌株抵抗性和敏感性差异基因主要涉及糖脂合成代谢以及炎症免疫相关通路,经芯片筛选出的相关基因的功能还需进一步的研究验证。
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关键词
猪
大肠杆菌F18菌株
基因芯片
基因表达谱
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职称材料
题名
大肠杆菌F18菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基因表达谱差异分析
被引量：
5
1
作者
包文斌
叶兰
潘章源
朱璟
杜子栋
蔡家嘉
黄小国
朱国强
吴圣龙
机构
扬州大学动物科学与
技术
学院
江苏省现代猪种分子选育工程技术研究中心
江苏
(扬州)规模
猪
场高效健康养殖公共
技术
服务
中心
扬州大学兽医学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期60-66,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30972089)
转基因生物新品种培育科技重大专项(编号:2009ZX08006-004B)
+1 种基金
江苏省科技支撑计划(农业)项目(编号:BE2008364
BE2009330-2)资助
文摘
文章运用Agilent双标记表达谱芯片,基于已建立的苏太猪大肠杆菌F18菌株敏感性和抗性型全同胞配对个体,分析十二指肠组织基因表达谱差异,旨在筛选导致仔猪断奶后腹泻和水肿病发生的大肠杆菌F18菌株受体相关基因,探讨造成大肠杆菌病抗性和敏感性资源家系抗性差异的分子生物学机理。研究结果显示,以Fold change绝对值大于2倍进行筛选,在敏感型(GG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,差异基因共13个,其中上调6个,下调7个,在以敏感型(AG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,共筛选出差异基因6个,其中上调4个,下调2个。经GO分析发现差异基因的生物学过程主要涉及免疫应答、胞外区修饰(如糖基化)、细胞黏附、信号转导等。通路发现大肠杆菌F18菌株抵抗性和敏感性差异基因主要涉及糖脂合成代谢以及炎症免疫相关通路,经芯片筛选出的相关基因的功能还需进一步的研究验证。
关键词
猪
大肠杆菌F18菌株
基因芯片
基因表达谱
Keywords
porcine
Escherichia coli F18
gene chip
gene expression profile
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大肠杆菌F18菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基因表达谱差异分析
包文斌
叶兰
潘章源
朱璟
杜子栋
蔡家嘉
黄小国
朱国强
吴圣龙
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
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