全球银鲳研究趋势解析

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作者 宋雨峰 尹绍武 +3 位作者 赵诚 贾超峰 高波 祝斐 《水产养殖》 2025年第9期30-36,46,共8页

采用文献计量学方法,以“2000—2022年银鲳”为关键词,对Web of Science核心合集数据库和中国知网数据库收录的相关论文进行检索,同时基于文献检索结果对其年发表量、国家(地区)、机构、期刊、学科和关键词分布等相关数据进行统计分析,... 采用文献计量学方法,以“2000—2022年银鲳”为关键词,对Web of Science核心合集数据库和中国知网数据库收录的相关论文进行检索,同时基于文献检索结果对其年发表量、国家(地区)、机构、期刊、学科和关键词分布等相关数据进行统计分析,并将结果通过GraphPad Prism 9.5.1、Excel 2019、VOSviewer等软件进行可视化处理,对2000—2022年国际银鲳研究概况进行分析。结果显示,我国是银鲳的研究大国,且近年来发展迅速,渔业、海洋与淡水生物学一直是国内外银鲳的研究热点,同时在生化与分子生物学等学科也有研究。 展开更多

关键词 银鲳 文献计量学 科学网 中国知网

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瓦氏黄颡鱼全基因组微卫星的分布特征及其定位的初步研究 被引量：11

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作者 彭冶 李杰 +4 位作者 王涛 张凯 宁先会 暨杰 尹绍武 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期90-98,共9页

文章探究了瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)全基因组微卫星的分布特征及其规律,旨在为相关功能性微卫星分子标记的筛选提供依据。利用MISA (MIcroSAtellite identification tool)软件对其全基因组微卫星进行筛查和分析,并对外显子中... 文章探究了瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)全基因组微卫星的分布特征及其规律,旨在为相关功能性微卫星分子标记的筛选提供依据。利用MISA (MIcroSAtellite identification tool)软件对其全基因组微卫星进行筛查和分析,并对外显子中含有微卫星的基因进行了GO (Gene Ontology)注释和KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。在瓦氏黄颡鱼全基因组(约663.53 Mb)中筛查到6种完整型微卫星共417 724个,相对丰度为630个·Mb-1,在全基因组总长度中占比1.48%。其中二碱基重复类型的微卫星个数最多,占微卫星总数的43.36%,其他依次分别是单碱基(39.02%)、四碱基(9.05%)、三碱基(7.34%)、五碱基(1.12%)和六碱基(0.12%)。对筛选得到的完整型微卫星进行初步定位,发现其中10 924个微卫星分布在外显子区,共定位到5 788个基因上。GO分析表明注释到生物过程的基因数量最多,GO富集较为显著的条目为结合活性和细胞大分子代谢过程。KEGG富集表明这些基因共富集到273条通路,其中黄酮与黄酮醇生物合成等通路最为显著(P=0)。联合分析预测瓦氏黄颡鱼定位到外显子上的微卫星和其体内的生物代谢过程密切相关。 展开更多

关键词 瓦氏黄颡鱼 基因组 微卫星 分布规律

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中华绒螯蟹新品种种质创制的研究进展 被引量：4

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作者 邢秀梅 沈铭浩 +3 位作者 李杰 宁先会 张凯 尹绍武 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期742-746,共5页

中华绒螯蟹(Eriocheirsinensis),属节肢动物门甲壳纲十足目方蟹科绒螯蟹属,又名河蟹、大闸蟹[1]。中华绒螯蟹因含有矿物质元素、脂肪酸、氨基酸、核苷酸和胆固醇等多类营养物质而深受长江流域居民喜爱,其肌肉中蛋白质品质高且肌苷酸的... 中华绒螯蟹(Eriocheirsinensis),属节肢动物门甲壳纲十足目方蟹科绒螯蟹属,又名河蟹、大闸蟹[1]。中华绒螯蟹因含有矿物质元素、脂肪酸、氨基酸、核苷酸和胆固醇等多类营养物质而深受长江流域居民喜爱,其肌肉中蛋白质品质高且肌苷酸的含量丰富,雄蟹性腺中更是包含25种脂肪酸[2]。近年来,我国中华绒螯蟹的种业保护措施较薄弱,加上无序引种和苗种盲目放流,导致种质混杂和退化,严重制约了该产业的绿色发展[3-4]。国外水产选育多以种业企业为主体,投入大、效果显著;国内则以科研单位为主,这样会造成产业集中度低、良种化水平和覆盖率均较低、苗种质量不稳定等一系列问题[5]。 展开更多

关键词 中华绒螯蟹 育种方法 种质创制 研究进展

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暗纹东方鲀肠上皮细胞体外培养方法的建立及皮质醇对其生理生化的影响

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作者 刘雨曦 孙亦如 +4 位作者 王思进 马思思 喻伟峰 尹绍武 王涛 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第5期119-133,共15页

应激反应对暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)养殖业危害极大,而皮质醇(cortisol)是判断鱼类应激反应的重要标志物。肠道是鱼体与外界环境接触的媒介,肠道生理状态能反映鱼体的应激水平,但目前肠道在鱼类响应应激反应中的作用不详。本研... 应激反应对暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)养殖业危害极大,而皮质醇(cortisol)是判断鱼类应激反应的重要标志物。肠道是鱼体与外界环境接触的媒介,肠道生理状态能反映鱼体的应激水平,但目前肠道在鱼类响应应激反应中的作用不详。本研究以暗纹东方鲀肠上皮细胞为对象,分别采用胰蛋白酶和DMEM培养基、胰蛋白酶和1640培养基、Ⅰ型胶原酶和DMEM培养基、Ⅰ型胶原酶和1640培养基4种方法对其进行原代培养,旨在建立暗纹东方鲀原代肠上皮细胞体外培养方法,并在此基础上探讨皮质醇对暗纹东方鲀肠上皮细胞氧化应激、细胞凋亡和脂代谢的影响。利用CCK-8法检测肠上皮细胞活力,透射电镜观察皮质醇处理后细胞内线粒体的形态结构,荧光定量PCR(qRT-PCR)检测氧化应激相关基因、细胞凋亡相关基因及脂代谢相关基因在肠上皮细胞内的表达模式,Annexin V-FITC/PI法检测细胞凋亡等。结果显示,在4种培养方法中,采用胰蛋白酶消化和DMEM培养基进行培养的肠上皮细胞增殖率最高,贴壁情况最佳;与对照组相比,当皮质醇浓度高于2 000 nmol/L时,肠上皮细胞活力显著下降(P<0.05);透射电镜显示,所有皮质醇处理组肠上皮细胞内线粒体结构发生改变,线粒体数量增加;随皮质醇处理浓度的升高,肠上皮细胞内氧化应激相关基因(sod、cat和gsh-px)及促凋亡基因(caspase-3、caspa-se7、caspase-9、bax和p53)表达量和凋亡指数均显著上升,抗凋亡基因bcl-2表达量显著下降(P<0.05);脂肪合成相关基因(g6pd、6gpd、pparγ、fas和acc)表达量显著下降,脂肪分解相关基因(hsl、ppara、lpl和cpt-1)表达量显著上升(P<0.05);甘油三酯和总胆固醇含量显著下降,游离脂肪酸含量显著上升(P<0.05)。结果表明,皮质醇能够促进暗纹东方鲀肠上皮细胞的氧化应激和细胞凋亡,同时促进脂肪的分解并抑制脂肪的合成。本研究以期为暗纹东方鲀抗应激养殖提供一定的参考资料。 展开更多

关键词 暗纹东方鲀 肠上皮细胞 皮质醇 氧化应激 细胞凋亡 脂代谢

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暗纹东方鲀TGF-β1基因的克隆、表达特征及生长性状相关SNP位点筛选

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作者 马思思 喻伟峰 +5 位作者 张凯 张雯雯 唐晓东 刘雨曦 尹绍武 王涛 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2024年第2期129-139,共11页

为探究暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)TGF-β1基因与其生长性状的关联及作用,采用RACE技术克隆了暗纹东方鲀TGF-β1基因,分析了其基因结构与表达特征,并通过直接PCR扩增法对TGF-β1基因进行多片段比对,在此基础上筛选出与生长性状相关... 为探究暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)TGF-β1基因与其生长性状的关联及作用,采用RACE技术克隆了暗纹东方鲀TGF-β1基因,分析了其基因结构与表达特征,并通过直接PCR扩增法对TGF-β1基因进行多片段比对,在此基础上筛选出与生长性状相关的SNP位点。研究发现TGF-β1基因cDNA全长共2217 bp,包含5′UTR 51 bp,3′UTR 1014 bp,ORF 1152 bp,编码383个氨基酸。氨基酸序列比对分析表明,暗纹东方鲀TGF-β1基因与红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)同源性最高(92.82%)。进化树分析表明,暗纹东方鲀TGF-β1基因编码氨基酸序列与红鳍东方鲀聚为一支,与鲈形目鱼类亲缘关系最近(68.46%~73.33%)。qRT-PCR检测显示,TGF-β1基因在暗纹东方鲀8种不同组织(心脏、肝脏、脑、脾脏、肾脏、肌肉、中肠和鳃)都有表达,其中肾脏表达量最高,心脏和脾脏表达量次之。通过SNP位点不同基因型与个体生长性状的相关性分析,发现TGF-β1上的SNP g.3908 C>A位点与暗纹东方鲀多项生长性状有关,其中CC型是优势基因型,且CC型个体体宽、肥满度较高。研究结果证实TGF-β1基因与暗纹东方鲀生长性状有一定的相关性,可为暗纹东方鲀分子标记辅助育种提供基础资料。 展开更多

关键词 暗纹东方鲀 TGF-Β1 表达特征 生长性状 SNP

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暗纹东方鲀雌雄个体形态差异及其判别分析 被引量：6

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作者 毕宜慧 张鑫宇 +4 位作者 李杰 孙亦如 王浩哲 付东勇 尹绍武 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2021年第5期563-572,共10页

为比较暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)雌雄个体之间的主要形态指标及形态差异,对296尾暗纹东方鲀的11项计量性状及11项比例性状进行了统计和分析。主成分分析结果显示,暗纹东方鲀22项形态指标可以划分为整体轮廓、整体及尾部的浑圆程... 为比较暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)雌雄个体之间的主要形态指标及形态差异,对296尾暗纹东方鲀的11项计量性状及11项比例性状进行了统计和分析。主成分分析结果显示,暗纹东方鲀22项形态指标可以划分为整体轮廓、整体及尾部的浑圆程度、头部特征、尾部长度比例4个方面,累积贡献率达72.31%。逐步判别分析最终筛选出眼径、肥满度、头长/体长、尾柄高/体长和体宽/体长5个相关变量,并建立了该鱼的性别判别函数。通过数据回代方程检验可得出暗纹东方鲀雌雄判别的综合正确率为81.1%。同时对筛选出用于建立判别函数的5个变量进行t检验,结果显示,尾柄高/体长、体宽/体长两个比例性状在雌雄个体间差异显著(P<0.05),表明雌性个体较雄性个体尾柄处较厚,体型较宽。上述差异性状和雌雄判别函数可为暗纹东方鲀性别的鉴定提供参考方法和理论依据。 展开更多

关键词 暗纹东方鲀 形态差异 雌雄判别 主成分分析 判别方程

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斑点叉尾鮰全基因组微卫星分布特征分析 被引量：8

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作者 唐荣叶 苏孟园 +3 位作者 杨汶珊 徐杰杰 王涛 尹绍武 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2022年第2期89-97,共9页

为了解斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)全基因组中完整型微卫星的分布特征,本研究使用生物信息学软件MISA对其全基因组微卫星进行了搜索并分析。结果显示,在斑点叉尾鮰29条染色体中,筛选到完整型微卫星共510256个,总长度达11036941 bp... 为了解斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)全基因组中完整型微卫星的分布特征,本研究使用生物信息学软件MISA对其全基因组微卫星进行了搜索并分析。结果显示,在斑点叉尾鮰29条染色体中,筛选到完整型微卫星共510256个,总长度达11036941 bp。其中,微卫星数量最多的是2号染色体(25284个),其次分别是3号、1号和5号染色体,29号染色体的微卫星数量最少,只有11591个。每条染色体长度与位于其上的微卫星的数量均显著相关(SPSS,r=0.98,P<0.01)。27号染色体的微卫星相对丰度最大(785.03个/Mb),11号染色体的微卫星相对丰度最小(615.89个/Mb)。6种重复拷贝类型的微卫星中,单碱基的数量最多,占总数的45.31%,随后依次是二碱基(38.53%)、三碱基(8.73%)、四碱基(6.93%)、五碱基(0.46%)和六碱基(0.04%)。斑点叉尾鮰全基因组微卫星中,前10种优势重复拷贝类别为A、AC、AG、AT、AAT、AAAT、C、AAC、AAAC和AAG,表现出明显的A、T碱基优势。本研究结果可为进一步研究斑点叉尾鮰全基因组特征提供参考,并为今后进行斑点叉尾鮰分子标记辅助育种及遗传信息评估等工作提供基础资料。 展开更多

关键词 斑点叉尾鮰 全基因组 微卫星 分布特征

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黄颡鱼(♀)、长吻[鱼危](♂)及其杂交F1代遗传多样性分析 被引量：5

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作者 王宏玉 武兆文 +5 位作者 付东勇 苏孟园 杨汶珊 唐荣叶 王涛 尹绍武 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期226-232,共7页

利用SSR分子标记技术和从20对微卫星引物中筛选出的12对多态性较高的引物,分析1龄、体质量(14.20±1.20)g黄颡鱼(♀)和长吻[鱼危](♂)及其杂交F1代[黄颡鱼(♀)×野生长吻[鱼危](♂)]的遗传多样性。试验结果显示,这3个群体之间... 利用SSR分子标记技术和从20对微卫星引物中筛选出的12对多态性较高的引物,分析1龄、体质量(14.20±1.20)g黄颡鱼(♀)和长吻[鱼危](♂)及其杂交F1代[黄颡鱼(♀)×野生长吻[鱼危](♂)]的遗传多样性。试验结果显示,这3个群体之间的平均等位基因数分别为4.583、3.667、5.000;平均有效等位基因数分别为2.382、2.221和2.535;平均观测杂合度分别为0.419、0.367和0.604;平均期望杂合度分别为0.477、0.383和0.597;多态信息含量分别为0.420、0.365和0.509。杂交F1代与父本长吻[鱼危]的遗传距离为0.8551,小于与母本黄颡鱼的遗传距离(1.7271),在亲缘关系树状图上先与父本聚为一支。杂交F1代从父本中获得较多的遗传物质,较双亲有丰富的遗传多样性和更高的基因杂合度。该试验结果将为研究黄颡鱼和长吻[鱼危]杂交后代的遗传多样性,探索鲿科鱼类属间杂交育种后亲本与子代的亲缘关系和遗传规律提供理论依据。 展开更多

关键词 黄颡鱼 长吻[鱼危] 遗传多样性 微卫星

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精子密度对杂交黄颡鱼“黄优1号”受精率、孵化率及出苗率的影响 被引量：5

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作者 程景颢 李杰 +7 位作者 付东勇 储明旭 张凯 王涛 尹绍武 唐忠林 茆健强 周国勤 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2021年第3期288-297,共10页

为研究瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)不同精子密度对杂交黄颡鱼“黄优1号”(hybrid yellow catfish“Huangyou-1”)受精率、孵化率和出苗率的影响,设置8组不同精子密度组(1.0×10^(3)~1.0×10^(6)个·mL^(-1))开展人... 为研究瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)不同精子密度对杂交黄颡鱼“黄优1号”(hybrid yellow catfish“Huangyou-1”)受精率、孵化率和出苗率的影响,设置8组不同精子密度组(1.0×10^(3)~1.0×10^(6)个·mL^(-1))开展人工授精实验。结果表明:当精子密度从1.0×10^(3)个·mL^(-1)提高到2.5×10^(4)个·mL^(-1)时,受精率、孵化率和出苗率均显著上升(P<0.05);当精子密度为5.0×10^(4)个·mL^(-1)时,受精率达到最大值为(88.8±2.0)%;当精子密度为2.5×10^(4)个·mL^(-1)时,孵化率及出苗率达到最大值,分别为(83.4±2.8)%和(79.4±4.6)%。最后,通过建立回归方程确定了精子密度与受精率、孵化率和出苗率之间的关系。研究筛选出了最适精子密度,研究结果可为杂交黄颡鱼规模化高效繁育提供理论参考。 展开更多

关键词 杂交黄颡鱼“黄优1号” 精子密度 受精率 孵化率 出苗率

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低氧胁迫和恢复对杂交黄颡鱼“黄优1号”肠道组织的影响 被引量：2

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作者 程景颢 李谣 +6 位作者 沈铭浩 杨智茹 张伟健 张凯 王涛 张国松 尹绍武 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1598-1608,共11页

为探究低氧胁迫和恢复对杂交黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)“黄优1号”肠道组织的影响,研究运用酶活测定、HE染色、qRT-PCR、TUNEL检测及16S rRNA测序技术等方法,分析低氧胁迫[(1.0±0.1)mg/L]和恢复下[(7.0±0.5)mg/L]该鱼... 为探究低氧胁迫和恢复对杂交黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)“黄优1号”肠道组织的影响,研究运用酶活测定、HE染色、qRT-PCR、TUNEL检测及16S rRNA测序技术等方法,分析低氧胁迫[(1.0±0.1)mg/L]和恢复下[(7.0±0.5)mg/L]该鱼肠道氧化应激指标、组织结构形态、细胞凋亡及微生物组成变化。结果显示:(1)在低氧胁迫下肠道中抗氧化酶活性(SOD、CAT、GSH-Px)、能量代谢酶活性(LDH)、丙二醛(MDA)和脂质过氧化物(LPO)含量显著升高,恢复溶氧后氧化应激反应也比较剧烈。(2)低氧胁迫阶段,肠道组织受损现象逐渐加剧,杯状细胞肿胀、黏膜层被侵蚀,恢复溶氧24h后,缺氧引起的生理变化并未得到明显改善。(3)肠道组织细胞凋亡程度随着低氧时间的延长而加剧,凋亡相关基因(bax、caspase9和p53)的表达量显著升高,bcl-2基因的表达量则减少。(4)低氧胁迫阶段肠道微生物相对丰度降低,低氧胁迫72h的处理组中以厚壁菌门(Firmicutes)(47.8%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(40.6%)的丰度最为优势,恢复溶氧后肠道菌群数量有所增加;KEGG功能预测显示,多数肠道微生物与代谢通路相关。研究结果可为解析低氧和恢复下杂交黄颡鱼“黄优1号”肠道组织内环境稳态调控机制提供理论依据。 展开更多

关键词 低氧 肠道 氧化应激 细胞凋亡 微生物组成 杂交黄颡鱼“黄优1号”

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暗纹东方鲀HTR4基因的分子特征及其生长相关SNP位点筛查 被引量：1

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作者 张雯雯 喻伟峰 +5 位作者 张宇飞 许伟鹤 张鑫宇 王涛 尹绍武 张凯 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第12期18-28,共11页

【目的】明确暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)5-羟色胺受体4(5-hydroxytryptamine receptor 4,HTR4)的分子结构、表达特征和功能,并探究HTR4基因SNP位点与暗纹东方鲀生长的相关性。【方法】采用分段克隆方法,分别扩增HTR4基因的3′RACE... 【目的】明确暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)5-羟色胺受体4(5-hydroxytryptamine receptor 4,HTR4)的分子结构、表达特征和功能,并探究HTR4基因SNP位点与暗纹东方鲀生长的相关性。【方法】采用分段克隆方法,分别扩增HTR4基因的3′RACE、5′RACE以及中间保守区域,将其拼接后获得暗纹东方鲀HTR4基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR技术,分析HTR4基因在暗纹东方鲀脑、肾脏、肝脏、脾脏、心脏、卵巢、中肠、鳃、皮肤和肌肉等10种组织中的分布,以及其在卵巢5个不同发育时期(Ⅰ~Ⅴ期)的脑、肾脏、肝脏、脾脏、心脏、中肠、鳃和肌肉等8种组织中的表达模式;利用Sanger测序法,筛查HTR4编码区生长性状相关的SNP位点。【结果】暗纹东方鲀HTR4 cDNA全长2302 bp,开放阅读框长度为1170 bp,共编码389个氨基酸,包含5个外显子;氨基酸序列比对及系统进化树分析结果显示,暗纹东方鲀与红鳍东方鲀HTR4的一致性最高(99.53%),亲缘关系最近;三维结构预测显示,HTR4蛋白在鱼类中较为保守。荧光定量PCR结果表明,HTR4基因在暗纹东方鲀10个不同组织中均有表达,其中在脑组织表达量最高,其次是中肠,肌肉组织表达量最低;HTR4基因在卵巢5个不同发育时期的8个不同组织中均有表达,其中在卵巢发育的Ⅳ时期表达量最高。SNP位点筛查结果表明,暗纹东方鲀HTR4基因第4外显子1202 bp处存在1个同义突变SNP位点(c.1202 C>G),关联分析表明该位点与暗纹东方鲀肥满度性状显著相关(P<0.05),其中CC基因型个体肥满度较高。【结论】HTR4基因在暗纹东方鲀生长发育中发挥了重要作用,可作为优良候选基因,在一定程度上可为暗纹东方鲀生长性状新品种的选育提供分子标记。 展开更多

关键词 暗纹东方鲀 5-羟色胺受体4 基因克隆 单核苷酸多态性 动物育种

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