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基于线粒体Ctyb基因的滆湖3种黄颡鱼遗传多样性分析
被引量：
2
1
作者
李大命
刘洋
+3 位作者
刘燕山
唐晟凯
谷先坤
殷稼雯
《安徽农业科学》
CAS
2023年第21期105-108,121,共5页
为掌握滆湖3种黄颡鱼野生资源的种质遗传状况,采用线粒体Ctyb基因探索黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的遗传多样性和进化历史动态。通过PCR扩增、测序和序列分析,获得3种黄颡鱼的Ctyb基因全序列,长度均为1 138 bp。3种黄颡鱼Cytb基因...
为掌握滆湖3种黄颡鱼野生资源的种质遗传状况,采用线粒体Ctyb基因探索黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的遗传多样性和进化历史动态。通过PCR扩增、测序和序列分析,获得3种黄颡鱼的Ctyb基因全序列,长度均为1 138 bp。3种黄颡鱼Cytb基因的碱基组成具有偏倚性,碱基A+T的含量(55.6%)高于G+C的含量(44.4%)。49尾黄颡鱼的Cytb基因序列有23个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性为0.903,核苷酸多样性为0.002 40;40尾光泽黄颡鱼的Cytb基因序列有25个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.936和0.004 59;32尾长须黄颡鱼的Cytb基因序列有20个多态位点,定义11种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.829和0.002 25。整体来看,3种黄颡鱼的单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性较低。黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的种内遗传距离分别为0~0.006、0~0.012和0~0.008。3种黄颡鱼的种间遗传距离为0.078~0.138,长须黄颡鱼与黄颡鱼的亲缘关系较近、与光泽黄颡鱼的亲缘关系较远。Tajima’s D和Fu’s F_s中性检验值均为负值,且核苷酸不配对分布图呈现单峰型,表明3种黄颡鱼经历过明显的种群扩张过程。该研究结果可为滆湖3种黄颡鱼的种质资源保护及开发利用提供参考依据。
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关键词
遗传多样性
CYTB基因
黄颡鱼
光泽黄颡鱼
长须黄颡鱼
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题名
基于线粒体Ctyb基因的滆湖3种黄颡鱼遗传多样性分析
被引量：
2
1
作者
李大命
刘洋
刘燕山
唐晟凯
谷先坤
殷稼雯
机构
江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室
南京师范大学海洋科学与工程学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2023年第21期105-108,121,共5页
基金
江苏省水生生物资源重大专项暨首次水生野生动物资源普查项目(ZYHB16-3)
2019年淡水渔业资源监测项目(2019-SJ-018-2)
2020年渔业生态监测项目(2020-SJ-016-2)。
文摘
为掌握滆湖3种黄颡鱼野生资源的种质遗传状况,采用线粒体Ctyb基因探索黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的遗传多样性和进化历史动态。通过PCR扩增、测序和序列分析,获得3种黄颡鱼的Ctyb基因全序列,长度均为1 138 bp。3种黄颡鱼Cytb基因的碱基组成具有偏倚性,碱基A+T的含量(55.6%)高于G+C的含量(44.4%)。49尾黄颡鱼的Cytb基因序列有23个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性为0.903,核苷酸多样性为0.002 40;40尾光泽黄颡鱼的Cytb基因序列有25个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.936和0.004 59;32尾长须黄颡鱼的Cytb基因序列有20个多态位点,定义11种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.829和0.002 25。整体来看,3种黄颡鱼的单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性较低。黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的种内遗传距离分别为0~0.006、0~0.012和0~0.008。3种黄颡鱼的种间遗传距离为0.078~0.138,长须黄颡鱼与黄颡鱼的亲缘关系较近、与光泽黄颡鱼的亲缘关系较远。Tajima’s D和Fu’s F_s中性检验值均为负值,且核苷酸不配对分布图呈现单峰型,表明3种黄颡鱼经历过明显的种群扩张过程。该研究结果可为滆湖3种黄颡鱼的种质资源保护及开发利用提供参考依据。
关键词
遗传多样性
CYTB基因
黄颡鱼
光泽黄颡鱼
长须黄颡鱼
Keywords
Genetic diversity
Cytb gene
Pelteobagrus fulvidraco
Pelteobagrus nitidus
Pelteobagrus eupogon
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于线粒体Ctyb基因的滆湖3种黄颡鱼遗传多样性分析
李大命
刘洋
刘燕山
唐晟凯
谷先坤
殷稼雯
《安徽农业科学》
CAS
2023
2
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