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脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析
被引量：
5
1
作者
孙金秋
徐莞媛
+4 位作者
马杭柯
高威
欧阳乐飞
高焕
阎斌伦
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第1期127-134,共8页
本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5′端非编码区为39 bp,3′端非编码区为409 bp...
本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5′端非编码区为39 bp,3′端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd^2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd^2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd^2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd^2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。
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关键词
脊尾白虾
丝氨酸羟甲基转移酶基因
基因克隆
组织表达
Cd^2+胁迫
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职称材料
题名
脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析
被引量：
5
1
作者
孙金秋
徐莞媛
马杭柯
高威
欧阳乐飞
高焕
阎斌伦
机构
江苏省海洋大学
江苏省
海洋
生物产业技术协同创新中心
江苏省
农业种质资源保护与利用平台
江苏省
海洋
资源开发研究院(连云港)
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第1期127-134,共8页
基金
江苏省高等学校自然科学研究重大项目(17KJA240001)
江苏省“六大人才高峰”创新人才团队项目(2016-HYGC-CXTD-004)
淮海工学院研究生创新项目(XKYCXX2017-21)共同资助。
文摘
本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5′端非编码区为39 bp,3′端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd^2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd^2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd^2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd^2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。
关键词
脊尾白虾
丝氨酸羟甲基转移酶基因
基因克隆
组织表达
Cd^2+胁迫
Keywords
Exopalaemon carinicauda
Serine hydroxyl methyltransferase
Gene cloning
Tissue expression
Cd^2+ stress
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析
孙金秋
徐莞媛
马杭柯
高威
欧阳乐飞
高焕
阎斌伦
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020
5
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参考文献
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