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罗氏沼虾白斑综合征病毒囊膜蛋白VP28基因的克隆及分析 被引量:1
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作者 王晓兰 贡成良 +6 位作者 薛宇醒 曹广力 魏育红 陈辉 许雅香 张伟明 薛仁宇 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2007年第3期12-16,共5页
根据已公布的罗氏沼虾白斑综合征病毒(WSSV)囊膜蛋白VP28基因序列设计一对特异性引物,从疑似患白斑病毒病的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增、克隆并测序后将该片段通过GenBank比对,证实为WSSV... 根据已公布的罗氏沼虾白斑综合征病毒(WSSV)囊膜蛋白VP28基因序列设计一对特异性引物,从疑似患白斑病毒病的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增、克隆并测序后将该片段通过GenBank比对,证实为WSSV的VP28基因;与20个已公布的WSSV VP28进行同源性比较,结果显示:从中国对虾、斑节对虾、南美白对虾、日本对虾、波纹龙虾提取的病毒株聚为一类,印度对虾WSSV VP28为另一类,罗氏沼虾WSSV VP28又单独为一类。根据测序结果推测VP28蛋白的二级结构在氨基酸的7~29区间可能为跨膜螺旋区,且该区域高度保守。 展开更多
关键词 VP28基因 克隆 序列分析 蛋白质二级结构
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以WWSV ORF234片段诊断罗氏沼虾白斑病毒病及片段分析 被引量:1
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作者 杨贺 王晓兰 +4 位作者 陈辉 韩凤丽 贡成良 曹广力 薛仁宇 《水生态学杂志》 北大核心 2008年第6期101-106,共6页
根据GenBank中登录的对虾白斑综合症病毒(WSSV)全基因组序列中和ORF234相应的序列来设计1对引物,从疑似病例的罗氏沼虾中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增出约885bp的特异性片段,克隆进质粒载体pET-28a(+),进行序列测定和分析。结果显... 根据GenBank中登录的对虾白斑综合症病毒(WSSV)全基因组序列中和ORF234相应的序列来设计1对引物,从疑似病例的罗氏沼虾中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增出约885bp的特异性片段,克隆进质粒载体pET-28a(+),进行序列测定和分析。结果显示:扩增序列共编码294个氨基酸,预测的相对分子质量为34kDa,与GenBank中登录序列的对应区域同源性达99%,由此确认该罗氏沼虾患有白斑综合病毒病。该序列所编码的蛋白在22~96氨基酸位置有一段球状结构,在142~272氨基酸位置有一个与DUF1335蛋白同源的将近130个氨基酸残基的保守区,其功能未知。同时还对克隆出的片段进行序列分析和蛋白预测,以进一步深入开展蛋白的功能及对该病毒病的防治的研究。 展开更多
关键词 对虾白斑综合症病毒 ORF234基因 克隆 序列分析 罗氏沼虾
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罗氏沼虾白斑综合症病毒WSSV ORF147片段的克隆、表达与序列分析
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作者 薛宇醒 曹广力 +6 位作者 王晓兰 贡成良 魏育红 沈卫德 陈辉 张伟明 薛仁宇 《水利渔业》 北大核心 2008年第1期105-108,共4页
白斑综合症病毒WSSV(White Spot Syndrome Virus),是严重危害虾类养殖业的主要病原之一。本实验根据已知南美白对虾WSSV ORF147序列设计1对特异性引物,从患疑似白斑病毒病的罗氏沼虾中提取总DNA,用PCR法扩增得到1特异性片段。将该... 白斑综合症病毒WSSV(White Spot Syndrome Virus),是严重危害虾类养殖业的主要病原之一。本实验根据已知南美白对虾WSSV ORF147序列设计1对特异性引物,从患疑似白斑病毒病的罗氏沼虾中提取总DNA,用PCR法扩增得到1特异性片段。将该片段克隆进pET-28a(+)载体,测序表明该片段全长1475bp.最大开放式阅读框为1380bp,编码459个氨基酸,预计其相对分子质量为51.9kDa;与GenBank登录的WSSV ORF147序列(登录号AF369029)进行比对,核苷酸同源性为99%,证实为WSSV ORF147片段。将该片段在大肠杆菌Ecoli中进行表达,能获得相应的特异多肽条带。根据测序结果推导WSSV ORF147多肽在N端有信号肽序列,并且在氨基酸序列的122~144区间形成跨膜螺旋区。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 白斑综合症 WSSV ORF147片段 克隆 序列分析 表达
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