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基于图像插值的小样本手写数字识别研究被引量：5: 1; 作者宋伟谢建平 +2 位作者高倩谢良旭许晓军《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2022年第2期298-307,共10页; 人工智能方法的高性能通常需要有充足的数据来训练模型参数。如何在数据量不足的情况下提升模型的性能,即小样本学习,是人工智能领域的重要研究方向之一。本文提出了基于图像插值的小样本学习策略,并在手写数字图像识别任务中验证了该... 展开更多; 关键词人工智能手写数字小样本学习计算机视觉图像识别; 在线阅读下载PDF 职称材料

HIV-1衣壳蛋白抑制剂体外筛选方法研究进展: 2; 作者张大为许晓双常珊《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期473-477,共5页; HIV-1的感染高度依赖其圆锥形的"富勒烯"型衣壳。衣壳由大约1 500个衣壳蛋白组装而成。近年来,衣壳蛋白已成为设计和筛选抗HIV-1药物的理想靶点。目前,文献已报道了多种基于不同原理的HIV-1衣壳蛋白抑制剂的筛选方法,该文将... 展开更多; 关键词 HIV-1 衣壳蛋白抑制剂邻近闪烁分析均相时间分辨荧光放大化学发光临近均相检测噬菌体展示双分子荧光互补假病毒虚拟筛选; 在线阅读下载PDF 职称材料

HTLV-1蛋白酶与印地那韦识别的分子动力学模拟: 3; 作者常珊梁立 +2 位作者刘嵬胡建平苟小军《湖北农业科学》 2015年第12期3034-3040,共7页; 对HTLV-1蛋白酶和抑制剂印地那韦的复合物进行了11 ns的分子动力学模拟,从分子整体、氢键、结合自由能及运动性等方面进行了分析。结果表明,动力学模拟使得体系更为松弛,但大部分氢键仍得到保持;疏水相互作用有利于HTLV-1蛋白酶和印地... 展开更多; 关键词 HTLV-1蛋白酶印地那韦分子动力学模拟分子识别结合自由能; 在线阅读下载PDF 职称材料

人转运蛋白SR2的原核表达及其与HIV-1整合酶体外相互作用的检测: 4; 作者许晓双张大为孔韧《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期38-41,共4页; 人转运蛋白SR2(TRN-SR2)与HIV-1整合酶(IN)相互作用是抗HIV治疗的有效靶点,寻找和设计该靶点的高效抑制剂具有重要的临床意义和广阔的应用前景。因此为了开展以TRN-SR2与HIV-1IN相互作用为靶点的抑制剂筛选研究,以pGEX-2T为载体的重组质... 展开更多; 关键词 HIV-1整合酶 TRN-SR2 蛋白-蛋白相互作用 BLI HTRF; 在线阅读下载PDF 职称材料

环索奈德通过靶向HIV-1衣壳蛋白六聚体调节其体外装配: 5; 作者张莉张大为包小峰《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期19-24,共6页; 多肽CAI在HIV-1衣壳蛋白(CA)C末端的结合口袋可用来筛选CA蛋白装配调节剂。采用均相时间分辨荧光技术(HTRF)筛选399个化合物,发现1个小分子化合物环索奈德(ciclesonide)能够竞争性抑制十二肽CAI与CA蛋白C末端的结合,其半数抑制浓度IC_(... 展开更多; 关键词环索奈德衣壳装配 C端结构域人类免疫缺陷病毒1型均相时间分辨荧光技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合: 6; 作者郁莉蒋颖敏 +1 位作者许磊朱景宇《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期341-348,共8页; 大量研究表明磷脂酰肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)与多种恶性肿瘤及免疫疾病的发生、发展密切相关,因此成为一个备受关注的药物靶点。伊德利塞(Idelalisib),PI3Kδ抑制剂,是首个被FDA批准上市的PI3K抑制剂,以此开启了PI3Kδ选择性抑制剂开发的热... 展开更多; 关键词磷脂酰肌醇-3-激酶δ(PI3Kδ) 选择性抑制剂度维利塞(Duvelisib IPI-145) 分子对接分子动力学模拟(MD) 自由能计算; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于图像插值的小样本手写数字识别研究被引量：5: 1; 作者宋伟谢建平高倩谢良旭许晓军; 机构江苏理工学院电气信息工程学院湖州师范学院理学院江苏理工学院计算机工程学院江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 出处《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2022年第2期298-307,共10页; 基金国家自然科学基金(22003020,12074151) 江苏省自然科学基金(BK20191032) 常州市重点研发项目(CJ20200045)。; 文摘人工智能方法的高性能通常需要有充足的数据来训练模型参数。如何在数据量不足的情况下提升模型的性能,即小样本学习,是人工智能领域的重要研究方向之一。本文提出了基于图像插值的小样本学习策略,并在手写数字图像识别任务中验证了该策略的可行性。系统研究了全连接神经网络和卷积神经网络对MNIST和USPS手写数字图像识别的小样本学习性能。计算结果表明,基于图像插值的数据增强方法可以显著提升神经网络在小样本数据中的特征提取能力和学习效率,且选择合适的图像插值缩放系数可以进一步优化神经网络的小样本学习性能。; 关键词人工智能手写数字小样本学习计算机视觉图像识别; Keywords artificial intelligence handwritten digits few-shot learning computer vision image recognition; 分类号 TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名HIV-1衣壳蛋白抑制剂体外筛选方法研究进展: 2; 作者张大为许晓双常珊; 机构江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 出处《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期473-477,共5页; 基金国家自然科学基金资助项目(No 31700297) 2017江苏省双创计划"双创博士"; 文摘 HIV-1的感染高度依赖其圆锥形的"富勒烯"型衣壳。衣壳由大约1 500个衣壳蛋白组装而成。近年来,衣壳蛋白已成为设计和筛选抗HIV-1药物的理想靶点。目前,文献已报道了多种基于不同原理的HIV-1衣壳蛋白抑制剂的筛选方法,该文将对这些体外筛选方法进行综述。; 关键词 HIV-1 衣壳蛋白抑制剂邻近闪烁分析均相时间分辨荧光放大化学发光临近均相检测噬菌体展示双分子荧光互补假病毒虚拟筛选; Keywords HIV-1 capsid protein inhibitors SPA HTRF ALPHA phage display BiFC pseudo-viruses virtual screening; 分类号 R-05 [医药卫生] R341 [医药卫生—基础医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名HTLV-1蛋白酶与印地那韦识别的分子动力学模拟: 3; 作者常珊梁立刘嵬胡建平苟小军; 机构江苏理工学院生物信息与医药工程研究所成都大学药食同源植物资源开发重点实验室乐山师范学院化学学院; 出处《湖北农业科学》 2015年第12期3034-3040,共7页; 基金国家自然科学基金项目(11247018 11147175 +2 种基金 31200990) 四川省乐山市科技计划项目(14SZD018); 文摘对HTLV-1蛋白酶和抑制剂印地那韦的复合物进行了11 ns的分子动力学模拟,从分子整体、氢键、结合自由能及运动性等方面进行了分析。结果表明,动力学模拟使得体系更为松弛,但大部分氢键仍得到保持;疏水相互作用有利于HTLV-1蛋白酶和印地那韦的结合,关键残基主要分布在R10、L30-V39、V56-F67和W98-I1004个区域;结合自由能预测值与试验数据吻合较好。印地那韦结合仅能部分抑制HTLV-1蛋白酶的Flap、top-site以及两个exo-site位点柔性,解释了印地那韦的HIV-1 PR抑制活性为何略大于HTLV-1 PR。该研究为基于受体结构的抗HTLV-1药物研发打下了一定的结构和理论基础。; 关键词 HTLV-1蛋白酶印地那韦分子动力学模拟分子识别结合自由能; Keywords HTLV-1 protease Indinavir molecular dynamics simulation molecular recognition binding free energy; 分类号 O641.3 [理学—物理化学] R969.1 [医药卫生—药理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人转运蛋白SR2的原核表达及其与HIV-1整合酶体外相互作用的检测: 4; 作者许晓双张大为孔韧; 机构江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 出处《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期38-41,共4页; 基金国家自然科学基金(31700297,81603152) 江苏省产学研前瞻项目(BY2016030-11); 文摘人转运蛋白SR2(TRN-SR2)与HIV-1整合酶(IN)相互作用是抗HIV治疗的有效靶点,寻找和设计该靶点的高效抑制剂具有重要的临床意义和广阔的应用前景。因此为了开展以TRN-SR2与HIV-1IN相互作用为靶点的抑制剂筛选研究,以pGEX-2T为载体的重组质粒pGST-TRN-SR2在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行原核表达,并利用亲和层析纯化得到浓度为0.80mg/mL的重组TRN-SR2蛋白;然后采用生物膜干涉技术(BLI)进行体外检测重组TRN-SR2蛋白与HIV-1IN的相互作用和结合情况。结果表明,重组TRN-SR2蛋白与HIV-1IN相互结合信号明显升高,且测得平衡解离常数KD值为45.2nmol/L。最后利用均相时间分辨荧光技术(HTRF)和交叉滴定实验确定了TRN-SR2与HIV-1IN在该靶点抑制剂筛选实验体系中的最适反应浓度分别为20和40nmol/L。以上研究结果说明原核表达的重组TRN-SR2蛋白的活性较好且与HIV-1IN体外相互作用明显,同时在筛选实验体系中TRN-SR2与HIV-1IN最适浓度的确定也为后续抑制剂的筛选提供了相应的研究基础。; 关键词 HIV-1整合酶 TRN-SR2 蛋白-蛋白相互作用 BLI HTRF; Keywords HIV-1 integrase TRN-SR2 protein-protein interaction BLI HTRF; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名环索奈德通过靶向HIV-1衣壳蛋白六聚体调节其体外装配: 5; 作者张莉张大为包小峰; 机构南通大学药学院江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 出处《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期19-24,共6页; 基金国家自然科学基金项目(31700297) 南通市第六期江海英才市级培养专项。; 文摘多肽CAI在HIV-1衣壳蛋白(CA)C末端的结合口袋可用来筛选CA蛋白装配调节剂。采用均相时间分辨荧光技术(HTRF)筛选399个化合物,发现1个小分子化合物环索奈德(ciclesonide)能够竞争性抑制十二肽CAI与CA蛋白C末端的结合,其半数抑制浓度IC_(50)值为6.06μmol/L。生物膜干涉技术(BLI)测量环索奈德与CA蛋白(单体和六聚体)的结合,环索奈德与CA六聚体的亲和力为159 nmol/L,远远大于其与CA单体的亲和力(K_(D)=1.68 mmol/L)。衣壳蛋白体外装配实验表明,环索奈德能促进CA蛋白的装配,且具有浓度依赖性。分子模拟分析环索奈德与CA蛋白的结合模式,显示环索奈德与CA六聚体的相互作用发生在六聚体相邻亚基N末端-C末端的界面上,并与H67和L211两个残基形成氢键。研究表明,环索奈德是一种潜在的HIV-1衣壳装配调节剂。; 关键词环索奈德衣壳装配 C端结构域人类免疫缺陷病毒1型均相时间分辨荧光技术; Keywords ciclesonide capsid assembly C-terminal domain human immunodeficiency virus 1 homogeneous time-resolved fluorescence; 分类号 Q51 [生物学—生物化学] R512.91 [医药卫生—内科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合: 6; 作者郁莉蒋颖敏许磊朱景宇; 机构常州工程职业技术学院检验检测认证学院江南大学药学院药物设计与分子药理学实验室江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 出处《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期341-348,共8页; 基金国家自然科学基金项目(21807049,81803430)资助。; 文摘大量研究表明磷脂酰肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)与多种恶性肿瘤及免疫疾病的发生、发展密切相关,因此成为一个备受关注的药物靶点。伊德利塞(Idelalisib),PI3Kδ抑制剂,是首个被FDA批准上市的PI3K抑制剂,以此开启了PI3Kδ选择性抑制剂开发的热潮,但是严重的毒副作用阻碍了该类化合物的使用。随后,度维利塞(Duvelisib,IPI-145)于2018年被批准上市,度维利塞是PI3Kδ/γ选择性抑制剂,然而目前关于度维利塞的选择性PI3K抑制分子机制报道较少,且目前尚无度维利塞/PI3K复合物晶体结构报道。因此本文采用整合的计算机模拟策略来揭示度维利塞的选择性抑制机制:通过分子对接获得度维利塞与PI3K各亚型的合理结合构象;分子动力学模拟结合自由能计算揭示选择性产生的关键位点及热点氨基酸。目前,因与其他亚型之间高度的同源性与结构保守性,使得PI3Kδ选择性抑制剂开发受到极大挑战,本文以上市药物度维利塞为研究主体,有望为新型PI3Kδ选择性抑制剂的开发及合理药物设计提供一定的指导意义。; 关键词磷脂酰肌醇-3-激酶δ(PI3Kδ) 选择性抑制剂度维利塞(Duvelisib IPI-145) 分子对接分子动力学模拟(MD) 自由能计算; Keywords phosphoinositide 3-Kinase delta(PI3Kδ) selective inhibitors Duvelisib(IPI-145) molecular docking molecular dynamics simulation(MD) binding free energy calculation; 分类号 O643.12 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于图像插值的小样本手写数字识别研究	宋伟谢建平高倩谢良旭许晓军	《数据采集与处理》 CSCD 北大核心	2022	5	在线阅读下载PDF 职称材料
2	HIV-1衣壳蛋白抑制剂体外筛选方法研究进展	张大为许晓双常珊	《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心	2019	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	HTLV-1蛋白酶与印地那韦识别的分子动力学模拟	常珊梁立刘嵬胡建平苟小军	《湖北农业科学》	2015	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	人转运蛋白SR2的原核表达及其与HIV-1整合酶体外相互作用的检测	许晓双张大为孔韧	《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2019	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	环索奈德通过靶向HIV-1衣壳蛋白六聚体调节其体外装配	张莉张大为包小峰	《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合	郁莉蒋颖敏许磊朱景宇	《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料