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甘蓝型油菜BnMAPK1超量表达及中油821的转录差异表达分析
1
作者
王珍
张晓莉
+6 位作者
刘淼
姚梦楠
孟晓静
曲存民
卢坤
李加纳
梁颖
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期856-868,共13页
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国重要的油料作物之一,具有较高的产量及营养价值。挖掘油菜广谱抗逆基因并深入探究其分子机制,对提高油菜抗逆性且保证产量及品质具有重要意义。MAPK级联(Mitogen-activated protein kinase cascades...
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国重要的油料作物之一,具有较高的产量及营养价值。挖掘油菜广谱抗逆基因并深入探究其分子机制,对提高油菜抗逆性且保证产量及品质具有重要意义。MAPK级联(Mitogen-activated protein kinase cascades)是多种信号跨膜传递的交汇点,参与生长发育、生物及非生物胁迫应答等生物学过程。为了解甘蓝型油菜BnMAPK1基因的生物学功能,本研究以BnMAPK1超量表达(OE)和中油821(CK)油菜为材料进行数字基因表达谱分析。结果显示,与CK相比,650个基因在OE油菜中差异表达;其中上调表达基因243个,下调表达基因407个。GO注释共富集到生物学过程118条途径,其中18条与光合作用相关(包含77个差异表达基因);分子功能7条途径,包括草酸氧化酶活性、锰离子结合、氧化还原酶活性等;细胞组分38条途径,包括叶绿体、质体、类囊体等。KEGG分析结果表明,BnMAPK1参与调控油菜光合作用、碳代谢、次生代谢物生物合成等14条过程。此外,利用实时荧光定量PCR验证8个候选基因在OE和CK油菜中的表达,其表达变化与测序结果基本一致。本研究结果为甘蓝型油菜BnMAPK1在生长发育及光响应等生物学过程中的功能分析奠定了基础,也为农作物广谱抗逆遗传育种提供了理论依据。
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关键词
甘蓝型油菜
BnMAPK1
差异表达基因(DEGs)
光合作用
数字基因表达谱测序(DGE-seq)
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职称材料
题名
甘蓝型油菜BnMAPK1超量表达及中油821的转录差异表达分析
1
作者
王珍
张晓莉
刘淼
姚梦楠
孟晓静
曲存民
卢坤
李加纳
梁颖
机构
西南大学农学与生物科技学院/油菜工程
研究
中心
西南大学现代
农业
科学研究院
贵州大学
农业
生物工程
研究院
/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室
江苏沿江地区农业科学研究所/南通市农业科学研究院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期856-868,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32101663,31872876)
中国博士后科学基金项目(2021M692683)
+2 种基金
重庆市自然科学基金项目(cstc2021jcyj-bshX0234)
重庆市博士后科研特别资助项目(2010010006157688)
高等学校学科创新引智基地项目111(B12006)资助。
文摘
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国重要的油料作物之一,具有较高的产量及营养价值。挖掘油菜广谱抗逆基因并深入探究其分子机制,对提高油菜抗逆性且保证产量及品质具有重要意义。MAPK级联(Mitogen-activated protein kinase cascades)是多种信号跨膜传递的交汇点,参与生长发育、生物及非生物胁迫应答等生物学过程。为了解甘蓝型油菜BnMAPK1基因的生物学功能,本研究以BnMAPK1超量表达(OE)和中油821(CK)油菜为材料进行数字基因表达谱分析。结果显示,与CK相比,650个基因在OE油菜中差异表达;其中上调表达基因243个,下调表达基因407个。GO注释共富集到生物学过程118条途径,其中18条与光合作用相关(包含77个差异表达基因);分子功能7条途径,包括草酸氧化酶活性、锰离子结合、氧化还原酶活性等;细胞组分38条途径,包括叶绿体、质体、类囊体等。KEGG分析结果表明,BnMAPK1参与调控油菜光合作用、碳代谢、次生代谢物生物合成等14条过程。此外,利用实时荧光定量PCR验证8个候选基因在OE和CK油菜中的表达,其表达变化与测序结果基本一致。本研究结果为甘蓝型油菜BnMAPK1在生长发育及光响应等生物学过程中的功能分析奠定了基础,也为农作物广谱抗逆遗传育种提供了理论依据。
关键词
甘蓝型油菜
BnMAPK1
差异表达基因(DEGs)
光合作用
数字基因表达谱测序(DGE-seq)
Keywords
Brassica napus
BnMAPK1
differentially expressed genes(DEGs)
photosynthesis
digital gene expression profiling sequencing(DGE-seq)
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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1
甘蓝型油菜BnMAPK1超量表达及中油821的转录差异表达分析
王珍
张晓莉
刘淼
姚梦楠
孟晓静
曲存民
卢坤
李加纳
梁颖
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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