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夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
被引量：
7
1
作者
王彦环
吴慧
+2 位作者
房兴堂
陈宏
张春雷
《家畜生态学报》
北大核心
2018年第3期17-23,共7页
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的...
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。
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关键词
夏南牛
MTDNA
D-LOOP
微卫星DNA
遗传多样性
母系起源
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职称材料
中国黄牛mtDNA 16S rRNA基因遗传多样性与系统进化分析
被引量：
3
2
作者
佘一凡
武青
+3 位作者
张春雷
房兴堂
何丹丹
陈宏
《家畜生态学报》
北大核心
2015年第12期12-18,共7页
采用PCR和DNA测序技术和生物信息学方法,测定分析了10个中国黄牛品种（群体）和2个外来牛品种共131个体的mtDNA 16SrRNA基因全序列的遗传变异,并分析了品种（群体）间的亲缘关系以及母系起源。结果表明,在12个群体131条16SrRNA基因序列...
采用PCR和DNA测序技术和生物信息学方法,测定分析了10个中国黄牛品种（群体）和2个外来牛品种共131个体的mtDNA 16SrRNA基因全序列的遗传变异,并分析了品种（群体）间的亲缘关系以及母系起源。结果表明,在12个群体131条16SrRNA基因序列中,共发现了78个变异位点,形成了40种单倍型,揭示了中国黄牛群体具有丰富的遗传多样性。总群体的平均单倍型多样性指数（Hd）为0.857±0.024,平均核苷酸多样性指数（Pi）为0.00582,Kimura双参数品种间遗传距离范围为0.001-0.009,10个中国黄牛品种（群体）核苷酸多样度高于2个外来牛品种。基于Kimura-2-parameter距离采用NJ法构建了10个中国黄牛品种（群体）分子系统树,111个体聚为2簇,即分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛存在两个母系起源,主要起源于瘤牛和普通牛。其中草原红牛和蒙古牛起源于普通牛,恩施牛主要起源于瘤牛,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异。这些结果为我国黄牛的种质资源保护、杂交育种和品种改良奠定了分子遗传学基础。
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关键词
中国黄牛
MTDNA
16S
RRNA
遗传多样性
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职称材料
题名
夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
被引量：
7
1
作者
王彦环
吴慧
房兴堂
陈宏
张春雷
机构
江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2018年第3期17-23,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31772558
31472077)
文摘
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。
关键词
夏南牛
MTDNA
D-LOOP
微卫星DNA
遗传多样性
母系起源
Keywords
Xianan cattle
mtDNAnD-loop
microsatellite DNA
genetic diversity
maternal origin
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
中国黄牛mtDNA 16S rRNA基因遗传多样性与系统进化分析
被引量：
3
2
作者
佘一凡
武青
张春雷
房兴堂
何丹丹
陈宏
机构
江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2015年第12期12-18,共7页
基金
现代农业(肉牛)产业技术体系专项(CARS-38)
陕西省科技统筹创新工程计划项目(2014KTZB02-02-02-02
+1 种基金
2015KTCL02-08)
国家发改委生物育种能力建设与产业化专项(2014-2573)
文摘
采用PCR和DNA测序技术和生物信息学方法,测定分析了10个中国黄牛品种（群体）和2个外来牛品种共131个体的mtDNA 16SrRNA基因全序列的遗传变异,并分析了品种（群体）间的亲缘关系以及母系起源。结果表明,在12个群体131条16SrRNA基因序列中,共发现了78个变异位点,形成了40种单倍型,揭示了中国黄牛群体具有丰富的遗传多样性。总群体的平均单倍型多样性指数（Hd）为0.857±0.024,平均核苷酸多样性指数（Pi）为0.00582,Kimura双参数品种间遗传距离范围为0.001-0.009,10个中国黄牛品种（群体）核苷酸多样度高于2个外来牛品种。基于Kimura-2-parameter距离采用NJ法构建了10个中国黄牛品种（群体）分子系统树,111个体聚为2簇,即分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛存在两个母系起源,主要起源于瘤牛和普通牛。其中草原红牛和蒙古牛起源于普通牛,恩施牛主要起源于瘤牛,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异。这些结果为我国黄牛的种质资源保护、杂交育种和品种改良奠定了分子遗传学基础。
关键词
中国黄牛
MTDNA
16S
RRNA
遗传多样性
Keywords
Chinese yellow cattle breeds
16S rRNA
genetic diversity
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
王彦环
吴慧
房兴堂
陈宏
张春雷
《家畜生态学报》
北大核心
2018
7
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职称材料
2
中国黄牛mtDNA 16S rRNA基因遗传多样性与系统进化分析
佘一凡
武青
张春雷
房兴堂
何丹丹
陈宏
《家畜生态学报》
北大核心
2015
3
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