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2008~2017年农业信息学国家自然科学基金资助定量与网络图谱分析 被引量:2
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作者 刘岩 蒋婷婷 +4 位作者 杨月 孙艺伟 曹宏鑫 任妮 张文宇 《江西农业学报》 CAS 2019年第1期146-150,共5页
通过研究2008~2017年间国家基金对农业信息学面上项目和青年基金的资助情况,分析了农业信息学主要研究方向和发展动态,以期为农业信息研究人员提供参考。
关键词 农业信息 国家自然科学基金 基础研究 定量分析 发展动态
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农业科技云服务平台设计与实现 被引量:3
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作者 刘岩 张文宇 +1 位作者 蒋婷婷 曹静 《安徽农业科学》 CAS 2016年第29期240-242,245,共4页
围绕农业科技信息服务,以已建成的农业科技信息资源和系统为依托,通过云计算技术对底层近服务器集群资源、数字化资源及应用系统资源进行综合调配和利用,设计开发了农业科技云服务平台。该平台拥有5大模块和7个咨询通道,方便用户及时获... 围绕农业科技信息服务,以已建成的农业科技信息资源和系统为依托,通过云计算技术对底层近服务器集群资源、数字化资源及应用系统资源进行综合调配和利用,设计开发了农业科技云服务平台。该平台拥有5大模块和7个咨询通道,方便用户及时获取本地区各类农业数字资源信息,全面提升了农业科技信息服务的精准性和实效性。 展开更多
关键词 农业云 科技云 云计算 云平台
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猪SUMO1基因的碱基序列特征及其在猪肺炎支原体感染过程中的表达 被引量:1
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作者 王丽 杨晓阳 +7 位作者 曹静 赵为民 涂枫 付言峰 李碧侠 陈哲 任守文 方晓敏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第5期1229-1236,共8页
根据NCBI上GenBank的猪类泛素蛋白修饰分子1(SUMO1)基因碱基序列(NM_001112676.1),设计编码区全长上、下游引物,成功克隆了猪SUMO1基因完整的编码区序列。经生物信息学软件分析发现猪SUMO1基因的蛋白质编码区(CDS)全长306 bp,编码101个... 根据NCBI上GenBank的猪类泛素蛋白修饰分子1(SUMO1)基因碱基序列(NM_001112676.1),设计编码区全长上、下游引物,成功克隆了猪SUMO1基因完整的编码区序列。经生物信息学软件分析发现猪SUMO1基因的蛋白质编码区(CDS)全长306 bp,编码101个氨基酸,SUMO1的蛋白质氨基酸序列在物种间高度保守。SUMO1基因在猪心、肝、脾、肺、肾、小肠及肌肉组织中均有表达,且在肺部表达较高。猪肺炎支原体感染原代猪肺泡巨噬细胞后SUMO1的mRNA表达水平显著升高。参与调控炎症反应的基因,如TLR2、P65和RXRα均存在潜在的SUMO化修饰位点,并且猪肺炎支原体感染后它们的mRNA表达水平极显著升高。 展开更多
关键词 猪肺炎支原体 SUMO1 猪肺泡巨噬细胞 炎症反应
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猪蛋白编码基因3’UTR中IRPRE1元件的鉴定及其基因特征分析 被引量:1
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作者 赵为民 曹静 +5 位作者 邢菲 王丽 任守文 付言峰 李碧侠 方晓敏 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期336-342,共7页
为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因... 为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因的3’UTR序列中短散在重复序列与简单重复序列在重复序列的类别中所占比例较高,分别为27.58%与31.08%;在SINE/t RNA的重复元件中,Pre0_SS和PRE1x元件所占的比例较高,分别为41.83%和37.51%;共有1 094个候选蛋白编码基因的3’UTR中含有IRPRE1元件;GO分析发现这些候选基因主要参与m RNA经由剪接体的剪接、细胞分裂、RNA通过酯交换反应发生的剪接、T细胞激活、RNA剪接、T细胞受体信号通路、对糖苷反应、甘油三酯稳态、外源性凋亡信号通路的正调节及胆固醇合成等生物过程;KEGG pathway分析发现这些候选基因参与了缬草碱、亮氨酸和异亮氨酸降解途径、TNF信号通路、T细胞受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、吞噬体、剪接体、胆汁分泌、甲状腺激素合成和凋亡;对3个蛋白编码基因的3’UTR中的IRPRE1元件进行鉴定发现,其在多个组织中广泛表达。 展开更多
关键词 蛋白编码基因 3’UTR IRPRE1元件 特征分析
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木聚糖酶基因(XynB)肠道特异表达载体的构建及鉴定
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作者 涂枫 赵为民 +2 位作者 曹静 方晓敏 陈哲 《江苏农业科学》 2020年第11期53-57,共5页
将黑曲霉属XynB基因和猪RELMβ基因核心启动子区克隆到pcDNA3.1(-)中,构建携带绿色荧光和Myc双标记的肠道特异表达载体pcDNA3.1-RELMβ-XynB-Myc-GFP。利用脂质体介导将载体转染人结肠癌细胞(HT29)和人肝癌细胞(Bel7402),荧光显微镜检... 将黑曲霉属XynB基因和猪RELMβ基因核心启动子区克隆到pcDNA3.1(-)中,构建携带绿色荧光和Myc双标记的肠道特异表达载体pcDNA3.1-RELMβ-XynB-Myc-GFP。利用脂质体介导将载体转染人结肠癌细胞(HT29)和人肝癌细胞(Bel7402),荧光显微镜检测发现,该载体可在HT29细胞特异表达绿色荧光蛋白;对转染该表达载体的HT29细胞进行RT-PCR检测和WB分析,结果表明,XynB基因在HT29细胞中正常转录,并且在细胞内检测到目的蛋白表达。 展开更多
关键词 木聚糖酶 特异表达载体 抵抗素样β基因 WB检测 RT-PCR检测
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