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基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法
被引量:
3
1
作者
周春
吕红
+7 位作者
张若洋
陈蓉
蔡莉
刘太香
石宇鹏
洪轲
刘成成
梁文飚
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期361-368,共8页
目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法。方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、...
目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法。方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、引物设计固定格式和引物设计软件在线设计90条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各30条),以12个插入HPA1-29W野生型和突变型序列的合成质粒以及50例已知HPA分型的献血者样本进行扩增和质谱检测,分析灵敏度、特异度和重复性,随机抽取15例样本的一代测序和质谱分型结果进行对比验证,建立检测方法。结果:基于MassARRAY平台的HPA基因分型的质谱检测方法与测序法检测结果相符合,灵敏度为100%,特异度为100%,重复性为100%。结论:成功建立基于MassARRAY平台的HPA1-29W系统的质谱分型方法,适合中国人群HPA分型,具有临床应用前景。
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关键词
MassARRAY
人血小板抗原
单核苷酸多态性
基因分型
质谱分析
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职称材料
题名
基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法
被引量:
3
1
作者
周春
吕红
张若洋
陈蓉
蔡莉
刘太香
石宇鹏
洪轲
刘成成
梁文飚
机构
江苏
省血液中心
江苏先声医学诊断有限公司
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期361-368,共8页
基金
江苏省社会发展重点项目(BE2017757)
江苏省卫生与计划生育委员会科技项目(H201514)。
文摘
目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法。方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、引物设计固定格式和引物设计软件在线设计90条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各30条),以12个插入HPA1-29W野生型和突变型序列的合成质粒以及50例已知HPA分型的献血者样本进行扩增和质谱检测,分析灵敏度、特异度和重复性,随机抽取15例样本的一代测序和质谱分型结果进行对比验证,建立检测方法。结果:基于MassARRAY平台的HPA基因分型的质谱检测方法与测序法检测结果相符合,灵敏度为100%,特异度为100%,重复性为100%。结论:成功建立基于MassARRAY平台的HPA1-29W系统的质谱分型方法,适合中国人群HPA分型,具有临床应用前景。
关键词
MassARRAY
人血小板抗原
单核苷酸多态性
基因分型
质谱分析
Keywords
MassARRAY
human platelet antigen
SNP
genotyping
mass spectrum analysis
分类号
R331.1 [医药卫生—人体生理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法
周春
吕红
张若洋
陈蓉
蔡莉
刘太香
石宇鹏
洪轲
刘成成
梁文飚
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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