【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中H...【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。展开更多
文摘【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。
