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离体时间和冻存时间对生物样本库乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量的影响
被引量：
1
1
作者
郑仰思
林旋豪
+5 位作者
李帆
肖坤胜
陈锡丰
刘春鹏
姚佩秀
王少洪
《复旦学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期437-445,共9页
目的探讨离体时间和冻存时间对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量影响,为生物样本库建立科学规范的样本处理流程和质量控制标准提供理论依据。方法采集6例乳腺癌患者和6例食管癌患者的肿瘤组织及其配对正常组织样本,冷冻保存于汕头市...
目的探讨离体时间和冻存时间对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量影响,为生物样本库建立科学规范的样本处理流程和质量控制标准提供理论依据。方法采集6例乳腺癌患者和6例食管癌患者的肿瘤组织及其配对正常组织样本,冷冻保存于汕头市中心医院生物样本库。同时采集镜像组织制备石蜡切片进行形态学分析。根据样本离体时间分为<15 min组和15~30 min组,在冻存8~10个月(T_(1))、14~16个月(T_(2))、26~28个月(T_(3))和38~40个月(T_(4))4个时间点对样本进行RNA质量分析。结果共检测96份组织样本,RNA完整性指数(RNA integrity number,RIN)≥6的高质量样本占93.8%(90/96),乳腺癌组高质量样本占89.6%(43/48),食管癌组高质量样本占97.9%(47/48)。乳腺癌组与食管癌组样本RIN值的差异有显著统计学意义(8.050 vs.8.600,P=0.009)。在食管癌组样本中,RIN值与RNA产量显著负相关(P<0.001),且肿瘤组织与正常组织RIN值的差异有显著统计学意义(7.550 vs.9.000,P<0.001),而乳腺癌组样本中肿瘤组织与正常组织RIN值的差异无统计学意义(8.200 vs.7.700,P=0.348)。RIN值与28S/18S显著正相关(P<0.001),其与肿瘤细胞百分比(P=0.676)和坏死细胞百分比(P=0.055)不相关。离体时间(<15 min和15~30 min:8.200 vs.8.300,P=0.932)和冻存时间(T_(1)~T_(4):8.400、7.700、8.450和8.600,P=0.163)均不会对组织样本RIN值产生影响。结论不同器官来源和不同组织类型的冰冻组织样本RNA质量存在差异性,有限的离体时间(≤30 min)和中长期冻存(38~40个月)对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量不会产生不利影响。
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关键词
生物样本库
RNA质量
离体时间
冻存时间
乳腺癌
食管癌
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题名
离体时间和冻存时间对生物样本库乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量的影响
被引量：
1
1
作者
郑仰思
林旋豪
李帆
肖坤胜
陈锡丰
刘春鹏
姚佩秀
王少洪
机构
汕头市中心医院生物样本库
汕头市
中心医院
病理科
出处
《复旦学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期437-445,共9页
基金
汕头市医疗卫生科技计划(230509116495638)。
文摘
目的探讨离体时间和冻存时间对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量影响,为生物样本库建立科学规范的样本处理流程和质量控制标准提供理论依据。方法采集6例乳腺癌患者和6例食管癌患者的肿瘤组织及其配对正常组织样本,冷冻保存于汕头市中心医院生物样本库。同时采集镜像组织制备石蜡切片进行形态学分析。根据样本离体时间分为<15 min组和15~30 min组,在冻存8~10个月(T_(1))、14~16个月(T_(2))、26~28个月(T_(3))和38~40个月(T_(4))4个时间点对样本进行RNA质量分析。结果共检测96份组织样本,RNA完整性指数(RNA integrity number,RIN)≥6的高质量样本占93.8%(90/96),乳腺癌组高质量样本占89.6%(43/48),食管癌组高质量样本占97.9%(47/48)。乳腺癌组与食管癌组样本RIN值的差异有显著统计学意义(8.050 vs.8.600,P=0.009)。在食管癌组样本中,RIN值与RNA产量显著负相关(P<0.001),且肿瘤组织与正常组织RIN值的差异有显著统计学意义(7.550 vs.9.000,P<0.001),而乳腺癌组样本中肿瘤组织与正常组织RIN值的差异无统计学意义(8.200 vs.7.700,P=0.348)。RIN值与28S/18S显著正相关(P<0.001),其与肿瘤细胞百分比(P=0.676)和坏死细胞百分比(P=0.055)不相关。离体时间(<15 min和15~30 min:8.200 vs.8.300,P=0.932)和冻存时间(T_(1)~T_(4):8.400、7.700、8.450和8.600,P=0.163)均不会对组织样本RIN值产生影响。结论不同器官来源和不同组织类型的冰冻组织样本RNA质量存在差异性,有限的离体时间(≤30 min)和中长期冻存(38~40个月)对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量不会产生不利影响。
关键词
生物样本库
RNA质量
离体时间
冻存时间
乳腺癌
食管癌
Keywords
biobank
RNA quality
ischemia time
storage periods
breast cancer
esophageal cancer
分类号
R-331 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
离体时间和冻存时间对生物样本库乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量的影响
郑仰思
林旋豪
李帆
肖坤胜
陈锡丰
刘春鹏
姚佩秀
王少洪
《复旦学报(医学版)》
北大核心
2025
1
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