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鳜KLF6序列特征、组织表达及其对BCAAs代谢酶基因表达的影响
1
作者
宾琴
宾石玉
+5 位作者
包凌晟
褚武英
张建社
程聪益
曾维
姚舟
《广西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第6期236-243,共8页
为研究鳜KLF6基因序列特征、组织表达及其对支链氨基酸代谢酶基因表达的影响,通过在线工具和软件对KLF6基因进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,检测KLF6基因在鳜7个不同组织的表达丰度及用siRNA干扰后KLF6基因和BCAA...
为研究鳜KLF6基因序列特征、组织表达及其对支链氨基酸代谢酶基因表达的影响,通过在线工具和软件对KLF6基因进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,检测KLF6基因在鳜7个不同组织的表达丰度及用siRNA干扰后KLF6基因和BCAAs代谢相关酶基因的mRNA表达量。结果表明:鳜KLF6基因编码区全长为3791 bp(登录号:XM_044176560.1),其中5′端和3′端分别为271和2659 bp,开放阅读框860 bp,共编码氨基酸286个。与鳃棘鲈KLF6基因的亲缘关系最近(98.6%),与鲤鱼较远(82.3%)。KLF6有1个KLF6-N型结构域(2-204 aa)、1个COG5048结构域(194-268 aa)和3个Znf-C2H2结构域(分别位于203-227、233-257、263-285个氨基酸之间)。鳜KLF6蛋白二级结构由无规则卷曲(56.99%)、α-螺旋(26.22%)、延伸链(10.84%)和β-转角(5.94%)相互连接而成。RT-qPCR结果发现,KLF6基因在鳜组织的相对表达量大小由高到低依次为心脏、脾脏、脑、肾脏、肠道、肌肉、肝脏。其中,心脏的表达量显著高于肝脏(P<0.01)和肌肉(P<0.05),脾脏、脑、肾脏及肠道的表达量高于肝脏(P<0.05)。在KLF6基因的mRNA表达量受到抑制后,BCAAs代谢酶(BCKDHb、ACADM、MCCC1、MCCC2、MUT、IVD)基因的mRNA表达量显著上升(P<0.05)。本研究为KLF6基因在鳜肌肉BCAAs代谢的调控机制研究提供了依据。
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关键词
鳜
转录因子
支链氨基酸
代谢酶
组织表达
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职称材料
题名
鳜KLF6序列特征、组织表达及其对BCAAs代谢酶基因表达的影响
1
作者
宾琴
宾石玉
包凌晟
褚武英
张建社
程聪益
曾维
姚舟
机构
广西师范大学生命科学
学院
珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部
重点
实验室
(广西师范大学)
长沙
学院
生物与化学工程
学院
水生动物
营养与
品质
调控
湖南省
重点
实验室
(
长沙
学院
)
出处
《广西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第6期236-243,共8页
基金
国家自然科学基金(31560718,31820103016)。
文摘
为研究鳜KLF6基因序列特征、组织表达及其对支链氨基酸代谢酶基因表达的影响,通过在线工具和软件对KLF6基因进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,检测KLF6基因在鳜7个不同组织的表达丰度及用siRNA干扰后KLF6基因和BCAAs代谢相关酶基因的mRNA表达量。结果表明:鳜KLF6基因编码区全长为3791 bp(登录号:XM_044176560.1),其中5′端和3′端分别为271和2659 bp,开放阅读框860 bp,共编码氨基酸286个。与鳃棘鲈KLF6基因的亲缘关系最近(98.6%),与鲤鱼较远(82.3%)。KLF6有1个KLF6-N型结构域(2-204 aa)、1个COG5048结构域(194-268 aa)和3个Znf-C2H2结构域(分别位于203-227、233-257、263-285个氨基酸之间)。鳜KLF6蛋白二级结构由无规则卷曲(56.99%)、α-螺旋(26.22%)、延伸链(10.84%)和β-转角(5.94%)相互连接而成。RT-qPCR结果发现,KLF6基因在鳜组织的相对表达量大小由高到低依次为心脏、脾脏、脑、肾脏、肠道、肌肉、肝脏。其中,心脏的表达量显著高于肝脏(P<0.01)和肌肉(P<0.05),脾脏、脑、肾脏及肠道的表达量高于肝脏(P<0.05)。在KLF6基因的mRNA表达量受到抑制后,BCAAs代谢酶(BCKDHb、ACADM、MCCC1、MCCC2、MUT、IVD)基因的mRNA表达量显著上升(P<0.05)。本研究为KLF6基因在鳜肌肉BCAAs代谢的调控机制研究提供了依据。
关键词
鳜
转录因子
支链氨基酸
代谢酶
组织表达
Keywords
Siniperca chuatsi
transcription factor
branched-chain amino acid
metabolic enzyme
tissue expression
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鳜KLF6序列特征、组织表达及其对BCAAs代谢酶基因表达的影响
宾琴
宾石玉
包凌晟
褚武英
张建社
程聪益
曾维
姚舟
《广西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024
0
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