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宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用
被引量：
2
1
作者
彭司华
江守文
+2 位作者
孙丹
吴智超
陈洁
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第1期229-237,共9页
近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病...
近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。
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关键词
水产动物病毒
宏基因组学
病毒鉴定
二代测序
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职称材料
斑马鱼ddx27基因对tp53基因的调控作用
2
作者
陈改拓
周志杰
+4 位作者
周泽斌
包林珠
邱军强
李伟明
张庆华
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期201-207,共7页
为探究斑马鱼ddx27基因对tp53基因表达的影响,根据NCBI网站在线数据库中分析得到的ddx27基因编码序列(coding sequence,CDS),利用同源重组技术构建斑马鱼ddx27真核表达载体pCMV-3×Flagddx27。通过亚细胞定位试验和蛋白质免疫印迹...
为探究斑马鱼ddx27基因对tp53基因表达的影响,根据NCBI网站在线数据库中分析得到的ddx27基因编码序列(coding sequence,CDS),利用同源重组技术构建斑马鱼ddx27真核表达载体pCMV-3×Flagddx27。通过亚细胞定位试验和蛋白质免疫印迹技术验证ddx27基因的表达,并利用双荧光素酶试验验证ddx27基因的过表达对tp53基因转录活性的影响。结果显示,ddx27 CDS区及阳性克隆的电泳片段大小以及测序比对均与预期结果一致。蛋白质免疫印迹显示Ddx27重组质粒可正常表达,且蛋白大小与预测结果一致。亚细胞定位显示Ddx27蛋白表达于HEK293T细胞的细胞核中。而且,过表达pCMV-3×Flag-ddx27真核表达载体能够显著增强tp53启动子报告基因载体pGL3-tp53-Luc的活性,为对照组的1.8倍(P<0.05)。以上结果表明,斑马鱼pCMV-3×Flag-ddx27真核表达载体构建成功,能够在哺乳动物的细胞核中表达,且ddx27基因可以促进tp53基因的表达。
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关键词
斑马鱼
ddx27
亚细胞定位
真核表达载体
TP53
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职称材料
题名
宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用
被引量：
2
1
作者
彭司华
江守文
孙丹
吴智超
陈洁
机构
上海
海洋大学
水产
与生命学院
水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/上海海洋大学
农业部国家水生动物病原库
/上海
海洋大学
科学技术部
海洋
生物科学国际联合研究中心
/上海
海洋大学
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第1期229-237,共9页
基金
上海市自然科学基金项目(15ZR1420800)
上海海洋大学博士科研启动项目(A2-0203-00-100313)
上海海洋大学青年基金项目(A2-0203-00-100237)
文摘
近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。
关键词
水产动物病毒
宏基因组学
病毒鉴定
二代测序
Keywords
aquatic animal virus
metagenomics
virus identification
next generation sequencing
分类号
S941.41 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
斑马鱼ddx27基因对tp53基因的调控作用
2
作者
陈改拓
周志杰
周泽斌
包林珠
邱军强
李伟明
张庆华
机构
上海
海洋大学
水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/上海海洋大学
国家水生动物病原库
密歇根州立
大学
农业和自然
资源
学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期201-207,共7页
基金
国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”专项(2019YFD0900102)
教育部留学回国人员科研启动基金(D-8002-15-0042)
水产动物疾病与基因编辑育种的平台建设和前沿科学研究(A1-3201-19-3013)。
文摘
为探究斑马鱼ddx27基因对tp53基因表达的影响,根据NCBI网站在线数据库中分析得到的ddx27基因编码序列(coding sequence,CDS),利用同源重组技术构建斑马鱼ddx27真核表达载体pCMV-3×Flagddx27。通过亚细胞定位试验和蛋白质免疫印迹技术验证ddx27基因的表达,并利用双荧光素酶试验验证ddx27基因的过表达对tp53基因转录活性的影响。结果显示,ddx27 CDS区及阳性克隆的电泳片段大小以及测序比对均与预期结果一致。蛋白质免疫印迹显示Ddx27重组质粒可正常表达,且蛋白大小与预测结果一致。亚细胞定位显示Ddx27蛋白表达于HEK293T细胞的细胞核中。而且,过表达pCMV-3×Flag-ddx27真核表达载体能够显著增强tp53启动子报告基因载体pGL3-tp53-Luc的活性,为对照组的1.8倍(P<0.05)。以上结果表明,斑马鱼pCMV-3×Flag-ddx27真核表达载体构建成功,能够在哺乳动物的细胞核中表达,且ddx27基因可以促进tp53基因的表达。
关键词
斑马鱼
ddx27
亚细胞定位
真核表达载体
TP53
Keywords
zebrafish
ddx27
subcellular localization
eukaryotic expression vector
tp53
分类号
S857.4 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用
彭司华
江守文
孙丹
吴智超
陈洁
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2019
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
斑马鱼ddx27基因对tp53基因的调控作用
陈改拓
周志杰
周泽斌
包林珠
邱军强
李伟明
张庆华
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
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0
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