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基于RNA-seq技术的萍乡红鲫雌雄性腺转录组比较分析
1
作者
黄文星
侯佳浩
+5 位作者
吴海军
李琳洁
夏涛涛
周希程
黄培荧
赵大显
《江西农业大学学报》
北大核心
2025年第4期1078-1092,共15页
【目的】旨在探明萍乡红鲫(Carassius auratus var.pingxiangnensis)雌雄生长差异的分子机制,通过对性腺进行转录组比较分析,以期筛选获得性别和生长相关差异基因。【方法】以10月龄萍乡红鲫为试验材料,随机测量比较分析雌雄个体生长差...
【目的】旨在探明萍乡红鲫(Carassius auratus var.pingxiangnensis)雌雄生长差异的分子机制,通过对性腺进行转录组比较分析,以期筛选获得性别和生长相关差异基因。【方法】以10月龄萍乡红鲫为试验材料,随机测量比较分析雌雄个体生长差异,采用Illumina NovaSeq 6000转录组测序技术分别对雌雄性腺组织进行RNA-seq测序和生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术进行基因功能验证。【结果】(1)10月龄萍乡红鲫雌性个体质量、全长、体长、体宽和体高均极显著高于雄性(P<0.01)。(2)精巢和卵巢转录组共筛选获得25949个差异表达基因(DEGs),相对于卵巢,精巢中表达上调DEGs 14644个(占56.4%),表达下调DEGs 11305个(占43.6%)。(3)GO和KEGG分析表明,83、162和138个DEGs分别富集到生长(growth)、繁殖(reproduction)和繁殖过程(reproductive process);131、151、176和185个DEGs分别富集到TGF-β信号通路(TGF-βsignaling pathway)、GnRH信号通路(GnRH signaling pathway)、FoxO信号通路(FoxO signaling pathway)和胰岛素信号通路(Insulin signaling pathway)。(4)筛选获得32个与性别相关DEGs和15个与生长相关DEGs,进一步基因相关性分析发现,生长相关基因fgf4与性别相关基因foxl2b和bmp8a、生长相关基因fgfr1a与性别相关基因dmrt2a和bmp15、生长相关基因igfbp1b与性别相关基因gdf9和bmp8a,以及生长相关基因gh2与性别相关基因hsd17b1均存在极显著正相关(P<0.01)。(5)随机选取9个DEGs进行qPCR验证发现,其mRNA表达趋势均与转录组分析的表达趋势一致。【结论】萍乡红鲫雌雄生长差异可能与其性腺中bmp2a、gdf6a、gdf9、hsd17b1、foxl2b和dmrt2a等性别相关基因的差异表达相关。
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关键词
萍乡红鲫
性腺
转录组
性别
生长
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职称材料
维氏气单胞菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响
2
作者
陈春福
黄艳
+4 位作者
张浩
李佳倩
陈凯欣
曾小英
彭扣
《江西水产科技》
2025年第4期37-41,共5页
为了解病原菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响,以35±5 g中华鳖为试验对象,利用维氏气单胞菌攻毒,测定菌感染第3、6、12、24、48 h的中华鳖血清和肝脏中一些抗氧化指标与对照组的变化。结果显示:菌感染后,中华鳖血清中的SOD酶活力在...
为了解病原菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响,以35±5 g中华鳖为试验对象,利用维氏气单胞菌攻毒,测定菌感染第3、6、12、24、48 h的中华鳖血清和肝脏中一些抗氧化指标与对照组的变化。结果显示:菌感染后,中华鳖血清中的SOD酶活力在检测的各时间点均低于对照组,且在第48 h极显著(P<0.01),肝脏中的SOD活力在第12 h显著高于对照组(P<0.05);血清中的CAT酶活力在检测的各时间点均高于对照组,肝脏中的CAT活力在第6、12、24、48 h也高于对照组;血清中的GPX活力在第3、6、24 h高于对照组,且在第6 h极显著(P<0.01),肝脏中的GPX活力则在第3、6、12 h高于对照组,且在第12 h极显著(P<0.01);血清中MDA的含量在第6、48 h显著高于对照组(P<0.05),肝脏中MDA含量在第12 h极显著高于对照组(P<0.01);血清中GSH含量在第12、24、48 h显著低于对照组(P<0.01),且肝脏中GSH的含量在第12、24、48 h也均低于对照组。以上表明,维氏气单胞菌感染显著影响中华鳖抗氧化因子的表达,对中华鳖非特异性免疫有破坏作用。
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关键词
中华鳖
维氏气单胞菌
抗氧化系统
酶活力
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职称材料
题名
基于RNA-seq技术的萍乡红鲫雌雄性腺转录组比较分析
1
作者
黄文星
侯佳浩
吴海军
李琳洁
夏涛涛
周希程
黄培荧
赵大显
机构
南昌大学生命科学学院/
水产种质创新与利用江西省重点实验室
江西省
萍乡市农业科学研究中心
出处
《江西农业大学学报》
北大核心
2025年第4期1078-1092,共15页
基金
国家重点研发计划专项(2023YFD2401800)
江西省现代农业产业技术体系(JXARS-15)。
文摘
【目的】旨在探明萍乡红鲫(Carassius auratus var.pingxiangnensis)雌雄生长差异的分子机制,通过对性腺进行转录组比较分析,以期筛选获得性别和生长相关差异基因。【方法】以10月龄萍乡红鲫为试验材料,随机测量比较分析雌雄个体生长差异,采用Illumina NovaSeq 6000转录组测序技术分别对雌雄性腺组织进行RNA-seq测序和生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术进行基因功能验证。【结果】(1)10月龄萍乡红鲫雌性个体质量、全长、体长、体宽和体高均极显著高于雄性(P<0.01)。(2)精巢和卵巢转录组共筛选获得25949个差异表达基因(DEGs),相对于卵巢,精巢中表达上调DEGs 14644个(占56.4%),表达下调DEGs 11305个(占43.6%)。(3)GO和KEGG分析表明,83、162和138个DEGs分别富集到生长(growth)、繁殖(reproduction)和繁殖过程(reproductive process);131、151、176和185个DEGs分别富集到TGF-β信号通路(TGF-βsignaling pathway)、GnRH信号通路(GnRH signaling pathway)、FoxO信号通路(FoxO signaling pathway)和胰岛素信号通路(Insulin signaling pathway)。(4)筛选获得32个与性别相关DEGs和15个与生长相关DEGs,进一步基因相关性分析发现,生长相关基因fgf4与性别相关基因foxl2b和bmp8a、生长相关基因fgfr1a与性别相关基因dmrt2a和bmp15、生长相关基因igfbp1b与性别相关基因gdf9和bmp8a,以及生长相关基因gh2与性别相关基因hsd17b1均存在极显著正相关(P<0.01)。(5)随机选取9个DEGs进行qPCR验证发现,其mRNA表达趋势均与转录组分析的表达趋势一致。【结论】萍乡红鲫雌雄生长差异可能与其性腺中bmp2a、gdf6a、gdf9、hsd17b1、foxl2b和dmrt2a等性别相关基因的差异表达相关。
关键词
萍乡红鲫
性腺
转录组
性别
生长
Keywords
Carassius auratus var.pingxiangnensis
gonads
transcriptome
gender
growth
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
维氏气单胞菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响
2
作者
陈春福
黄艳
张浩
李佳倩
陈凯欣
曾小英
彭扣
机构
南昌大学生命科学学院
水产种质创新与利用江西省重点实验室
出处
《江西水产科技》
2025年第4期37-41,共5页
基金
江西省现代农业(名特优水产品)产业技术体系建设专项资金(JXARS-15-龟鳖健康养殖岗)
江西省现代种业(渔业)发展项目“中华鳖联合育种及产业化推广应用项目”(2024yyzygg-03)
+2 种基金
国家重点研发计划渔农综合种养高质高效技术与轻简化装备子任务课题“鳖-莲生态种养新模式研发与示范”(2023YFD2401804)
江西省现代农业(特种水产)产业技术体系建设专项资金(JXARS-10-育种与龟鳖养殖岗)
江西省农业(南丰县龟鳖)科技综合体建设项目(丰府字〔2024〕49号)。
文摘
为了解病原菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响,以35±5 g中华鳖为试验对象,利用维氏气单胞菌攻毒,测定菌感染第3、6、12、24、48 h的中华鳖血清和肝脏中一些抗氧化指标与对照组的变化。结果显示:菌感染后,中华鳖血清中的SOD酶活力在检测的各时间点均低于对照组,且在第48 h极显著(P<0.01),肝脏中的SOD活力在第12 h显著高于对照组(P<0.05);血清中的CAT酶活力在检测的各时间点均高于对照组,肝脏中的CAT活力在第6、12、24、48 h也高于对照组;血清中的GPX活力在第3、6、24 h高于对照组,且在第6 h极显著(P<0.01),肝脏中的GPX活力则在第3、6、12 h高于对照组,且在第12 h极显著(P<0.01);血清中MDA的含量在第6、48 h显著高于对照组(P<0.05),肝脏中MDA含量在第12 h极显著高于对照组(P<0.01);血清中GSH含量在第12、24、48 h显著低于对照组(P<0.01),且肝脏中GSH的含量在第12、24、48 h也均低于对照组。以上表明,维氏气单胞菌感染显著影响中华鳖抗氧化因子的表达,对中华鳖非特异性免疫有破坏作用。
关键词
中华鳖
维氏气单胞菌
抗氧化系统
酶活力
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
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作者
出处
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被引量
操作
1
基于RNA-seq技术的萍乡红鲫雌雄性腺转录组比较分析
黄文星
侯佳浩
吴海军
李琳洁
夏涛涛
周希程
黄培荧
赵大显
《江西农业大学学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
维氏气单胞菌对中华鳖抗氧化主要因子的影响
陈春福
黄艳
张浩
李佳倩
陈凯欣
曾小英
彭扣
《江西水产科技》
2025
0
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