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广东汉族妊娠期糖尿病妇女胎盘组织microRNA差异表达谱分析
被引量：
8
1
作者
李伟
胡宝春
龚照
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2017年第3期298-302,共5页
目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就...
目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就诊并分娩的GDM孕妇20例作为观察组(GDM组),均为粤籍汉族并且相互之间无亲缘关系,随机选取同期无妊娠合并症的正常广东汉族孕妇20例作为对照组。胎儿分娩后收集胎盘组织,用TRIzol法进行总RNA提取,经过质量和纯度分析鉴定合格后分别选取5个样本混合成GDM和对照组,采用逆转录法构建小RNA文库,使用第二代高通量测序采用边合成边测序的方法对miRNA进行测序并分析结果。结果:从胎盘组织提取到的总RNA纯度较高,D(260 nm)/D(280 nm)>1.90,并成功构建小RNA的c DNA文库。采用高通量测序得到长度为10~35 nt的小RNA片段,其中文库数量最多的小RNA长度21~24 nt,miRNA量占所有小RNA总量的30%以上,最终获得洁净的片段超过10 000 000。将得到的片段与Genebank及Rfram数据库比对,去除其他小RNA筛选出miRNA达7 000多种。通过样本两两比较分析,与对照组相比,发现GDM组有138种已知的miRNA表达明显上调,包括hsa-miR-548au-5p、hsa-miR-95a-5p、hsa-miR-373-5p、hsa-miR-216-5p等(log2-ratio>1,P<0.01);16种已知miRNAs明显表达下调,如hsa-miR-5699-5p、hsa-miR-4286等(log2-ratio<-1,P<0.01)。Mireap软件预测出27种新miRNA,其中有9种在GDM表达升高,6种表达降低。结论:GDM的胎盘组织miRNAs与对照组存在表达差异,胎盘组织miRNA可能在GDM发病过程中起一定的调节作用。
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关键词
妊娠期糖尿病
miRNA
差异表达谱
高通量测序
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职称材料
妊娠期糖尿病胎盘组织hsa-miR95-5p、hsa-miR-548am-5p和hsa-miR-1246的表达及意义
被引量：
12
2
作者
李伟
胡宝春
龚照
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2016年第4期566-569,共4页
目的:分析妊娠期糖尿病(GDM)胎盘组织微小RNA(miRNA)的表达,探讨miRNA在GDM发病中的作用。方法:选取2013年1月至2014年1月GDM妇女和正常孕妇分娩后的胎盘组织,采用测序及荧光定量PCR(q RT-PCR)法检测miRNA,利用数据库对miRNA靶基因进行...
目的:分析妊娠期糖尿病(GDM)胎盘组织微小RNA(miRNA)的表达,探讨miRNA在GDM发病中的作用。方法:选取2013年1月至2014年1月GDM妇女和正常孕妇分娩后的胎盘组织,采用测序及荧光定量PCR(q RT-PCR)法检测miRNA,利用数据库对miRNA靶基因进行分析。结果:GDM胎盘组织中胰岛素信号通路相关的有47种miRNA表达升高,5种表达降低。q RT-PCR检测发现GDM组的hsa-mi R-548am-5p、hsa-mi R-95-5p明显升高(P<0.05);而hsa-mi R-1246表达明显降低(P<0.05),与测序结果一致。部分miRNA靶基因可对PI3K等靶点发挥调节作用。结论 :GDM发生时胎盘组织miRNA表达异常,多种差异表达的miRNA通过调节胰岛素信号通路的多个关键靶点参与GDM的发病。
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关键词
妊娠糖尿病
MIRNA
胰岛素信号通路
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职称材料
题名
广东汉族妊娠期糖尿病妇女胎盘组织microRNA差异表达谱分析
被引量：
8
1
作者
李伟
胡宝春
龚照
机构
武警广东省总队医院内分泌科
武警
广东省
总队
医院
妇产
科
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2017年第3期298-302,共5页
基金
广东省医学科研基金(A2013452)
文摘
目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就诊并分娩的GDM孕妇20例作为观察组(GDM组),均为粤籍汉族并且相互之间无亲缘关系,随机选取同期无妊娠合并症的正常广东汉族孕妇20例作为对照组。胎儿分娩后收集胎盘组织,用TRIzol法进行总RNA提取,经过质量和纯度分析鉴定合格后分别选取5个样本混合成GDM和对照组,采用逆转录法构建小RNA文库,使用第二代高通量测序采用边合成边测序的方法对miRNA进行测序并分析结果。结果:从胎盘组织提取到的总RNA纯度较高,D(260 nm)/D(280 nm)>1.90,并成功构建小RNA的c DNA文库。采用高通量测序得到长度为10~35 nt的小RNA片段,其中文库数量最多的小RNA长度21~24 nt,miRNA量占所有小RNA总量的30%以上,最终获得洁净的片段超过10 000 000。将得到的片段与Genebank及Rfram数据库比对,去除其他小RNA筛选出miRNA达7 000多种。通过样本两两比较分析,与对照组相比,发现GDM组有138种已知的miRNA表达明显上调,包括hsa-miR-548au-5p、hsa-miR-95a-5p、hsa-miR-373-5p、hsa-miR-216-5p等(log2-ratio>1,P<0.01);16种已知miRNAs明显表达下调,如hsa-miR-5699-5p、hsa-miR-4286等(log2-ratio<-1,P<0.01)。Mireap软件预测出27种新miRNA,其中有9种在GDM表达升高,6种表达降低。结论:GDM的胎盘组织miRNAs与对照组存在表达差异,胎盘组织miRNA可能在GDM发病过程中起一定的调节作用。
关键词
妊娠期糖尿病
miRNA
差异表达谱
高通量测序
Keywords
gestational diabetes mellitus
miRNA
expression profile
high through-put sequencing
分类号
R714.256 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
妊娠期糖尿病胎盘组织hsa-miR95-5p、hsa-miR-548am-5p和hsa-miR-1246的表达及意义
被引量：
12
2
作者
李伟
胡宝春
龚照
机构
武警广东省总队医院内分泌科
武警
广东省
总队
医院
妇产
科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2016年第4期566-569,共4页
基金
广东省医学科研基金立项资助项目(编号:A2012453)
文摘
目的:分析妊娠期糖尿病(GDM)胎盘组织微小RNA(miRNA)的表达,探讨miRNA在GDM发病中的作用。方法:选取2013年1月至2014年1月GDM妇女和正常孕妇分娩后的胎盘组织,采用测序及荧光定量PCR(q RT-PCR)法检测miRNA,利用数据库对miRNA靶基因进行分析。结果:GDM胎盘组织中胰岛素信号通路相关的有47种miRNA表达升高,5种表达降低。q RT-PCR检测发现GDM组的hsa-mi R-548am-5p、hsa-mi R-95-5p明显升高(P<0.05);而hsa-mi R-1246表达明显降低(P<0.05),与测序结果一致。部分miRNA靶基因可对PI3K等靶点发挥调节作用。结论 :GDM发生时胎盘组织miRNA表达异常,多种差异表达的miRNA通过调节胰岛素信号通路的多个关键靶点参与GDM的发病。
关键词
妊娠糖尿病
MIRNA
胰岛素信号通路
Keywords
Gestational diabetes mellitus
MicroRNA
Insulin signaling pathway
分类号
R714.256 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东汉族妊娠期糖尿病妇女胎盘组织microRNA差异表达谱分析
李伟
胡宝春
龚照
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2017
8
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职称材料
2
妊娠期糖尿病胎盘组织hsa-miR95-5p、hsa-miR-548am-5p和hsa-miR-1246的表达及意义
李伟
胡宝春
龚照
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2016
12
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职称材料
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