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云南HPV-16型E6、E7基因的突变分析
被引量：
5
1
作者
张晓琳
刘峰
+5 位作者
姚月婷
李亚东
周竞贤
易力
姚宇峰
俞建昆
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第2期17-23,共7页
人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)16型(HPV-16)是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性。因此,研究不同地域HPV-16这2个基...
人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)16型(HPV-16)是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性。因此,研究不同地域HPV-16这2个基因的变化情况是宫颈癌流行病学调研的主要内容,也可为研究E6和E7的致癌性积累数据。研究以NCBI登录号为NC_001526.2的HPV-16型病毒的序列为参照,采用Neighbor-joining方法对云南地区74例HPV-16样本的E6、E7的DNA序列构建进化树,结果显示:只有亚洲和欧洲变异亚型,而没有发现非洲1、非洲2、亚-美洲和北美洲这4种变异亚型。DNA序列分析显示:E6的碱基突变以T178G(D25E,59.46%)和T350G(L83V,8.11%)为主,E7的碱基突变主要以A647G(N29S,59.46%)和T846C(同义突变,60.81%)为主。发现E6的新突变有A95G(同义突变,1.35%)和A135G(K11R,1.35%);E7的新突变有C625T(L22F,1.35%)、C627T(同义突变,12.16%)、G689A(G43E,1.35%)、T748G(S63A,1.35%)。此外还发现有一个共突变现象:T178G(D25E,59.46%)-A647G(N29S,59.46%)-T843C(同义突变,21.62%)-T846C(同义突变,60.81%)。
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关键词
HPV-16
E6基因突变
E7基因突变
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职称材料
云南地区人乳头瘤病毒感染流行病学调查
被引量：
8
2
作者
刘峰
李铮
程思
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1048-1051,共4页
目的：调查人乳头瘤病毒（humanpapillomaviruses，HPV）在云南地区的感染状况及其分布规律，为云南地区HPV流行病学研究提供依据。方法：运用导流杂交及基因芯片技术对5376例女性进行21种HPV分型检测，统计HPV在云南地区的感染率及不同...
目的：调查人乳头瘤病毒（humanpapillomaviruses，HPV）在云南地区的感染状况及其分布规律，为云南地区HPV流行病学研究提供依据。方法：运用导流杂交及基因芯片技术对5376例女性进行21种HPV分型检测，统计HPV在云南地区的感染率及不同HPV型的比例。结果：（1）HPV总感染率为12．8％，21种基因型检出20种，其中单一型别感染率为10．4％，2型混合感染率为1．8％，3型及以上混合感染率为0．6％：（2）HPV52、16型感染最为常见，其次为HPV58、53、33、18，此6种HPV感染占总感染率的65．4％；（3）高危型HPV在≤25岁、26．35岁、36～45岁、〉146岁年龄组的感染率依次为7．4％、13．2％、11．6％、10．3％，组问比较差异具有统计学意义（序15．33，P〈0．01）。低危型HPv在各年龄组的感染率依次为1．2％、2．5％、2．2％和1．3％，组问比较差异无统计学意义（r=6．44，P〉0．05）。结论：云南地区HPV感染率低于全国水平（16．1％），以单一亚型感染为主。HPV52、16为高危型HPV感染主要型别，低危型HPV感染以CP8304、HPVll、HPV63型常见。HPV各型别的感染率与年龄有一定关系。本研究结果可为宫颈癌的防治和未来抗原肽疫苗的设计提供重要的基础数据。
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关键词
人乳头瘤病毒
基因分型
基因芯片
宫颈癌
流行病学
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职称材料
题名
云南HPV-16型E6、E7基因的突变分析
被引量：
5
1
作者
张晓琳
刘峰
姚月婷
李亚东
周竞贤
易力
姚宇峰
俞建昆
机构
中国医学
科
学院&北京协和医学院医学生物学研究所
云南省
重大传染病疫苗研发重点实验室
武警云南省总队医院检验科
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第2期17-23,共7页
基金
国家自然科学基金(31270030)
协和新星人才支持项目
+2 种基金
中央高校基本科研业务费专项资金资助(2012N08)
云南省应用基础研究面上项目(2010ZC232)
中国医学科学院病原生物学研究所基本科研业务费项目(2012IPB107)
文摘
人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)16型(HPV-16)是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性。因此,研究不同地域HPV-16这2个基因的变化情况是宫颈癌流行病学调研的主要内容,也可为研究E6和E7的致癌性积累数据。研究以NCBI登录号为NC_001526.2的HPV-16型病毒的序列为参照,采用Neighbor-joining方法对云南地区74例HPV-16样本的E6、E7的DNA序列构建进化树,结果显示:只有亚洲和欧洲变异亚型,而没有发现非洲1、非洲2、亚-美洲和北美洲这4种变异亚型。DNA序列分析显示:E6的碱基突变以T178G(D25E,59.46%)和T350G(L83V,8.11%)为主,E7的碱基突变主要以A647G(N29S,59.46%)和T846C(同义突变,60.81%)为主。发现E6的新突变有A95G(同义突变,1.35%)和A135G(K11R,1.35%);E7的新突变有C625T(L22F,1.35%)、C627T(同义突变,12.16%)、G689A(G43E,1.35%)、T748G(S63A,1.35%)。此外还发现有一个共突变现象:T178G(D25E,59.46%)-A647G(N29S,59.46%)-T843C(同义突变,21.62%)-T846C(同义突变,60.81%)。
关键词
HPV-16
E6基因突变
E7基因突变
Keywords
HPV-16
E6 gene mutation
E7 gene mutation
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
云南地区人乳头瘤病毒感染流行病学调查
被引量：
8
2
作者
刘峰
李铮
程思
机构
武警云南省总队医院检验科
昆明市延安
医院
检验
科
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1048-1051,共4页
文摘
目的：调查人乳头瘤病毒（humanpapillomaviruses，HPV）在云南地区的感染状况及其分布规律，为云南地区HPV流行病学研究提供依据。方法：运用导流杂交及基因芯片技术对5376例女性进行21种HPV分型检测，统计HPV在云南地区的感染率及不同HPV型的比例。结果：（1）HPV总感染率为12．8％，21种基因型检出20种，其中单一型别感染率为10．4％，2型混合感染率为1．8％，3型及以上混合感染率为0．6％：（2）HPV52、16型感染最为常见，其次为HPV58、53、33、18，此6种HPV感染占总感染率的65．4％；（3）高危型HPV在≤25岁、26．35岁、36～45岁、〉146岁年龄组的感染率依次为7．4％、13．2％、11．6％、10．3％，组问比较差异具有统计学意义（序15．33，P〈0．01）。低危型HPv在各年龄组的感染率依次为1．2％、2．5％、2．2％和1．3％，组问比较差异无统计学意义（r=6．44，P〉0．05）。结论：云南地区HPV感染率低于全国水平（16．1％），以单一亚型感染为主。HPV52、16为高危型HPV感染主要型别，低危型HPV感染以CP8304、HPVll、HPV63型常见。HPV各型别的感染率与年龄有一定关系。本研究结果可为宫颈癌的防治和未来抗原肽疫苗的设计提供重要的基础数据。
关键词
人乳头瘤病毒
基因分型
基因芯片
宫颈癌
流行病学
Keywords
human papilloma virus
genotyping
gene chip
cervical cancer
epidemiology
分类号
R181 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南HPV-16型E6、E7基因的突变分析
张晓琳
刘峰
姚月婷
李亚东
周竞贤
易力
姚宇峰
俞建昆
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014
5
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职称材料
2
云南地区人乳头瘤病毒感染流行病学调查
刘峰
李铮
程思
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
8
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职称材料
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