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二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶BdCDPK4基因的克隆及其编码蛋白质的生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
韦淑亚
赵旭东
+2 位作者
王会平
杨广笑
何光源
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第2期345-352,共8页
二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码...
二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明,分离了BdCDPK4基因1 851 bp的cDNA序列(Gen Bank登录号为XM_003559516),编码区长度为1 752 bp,编码583个氨基酸,分子量为64.78 ku,等电点为9.12,含有N端可变区、蛋白激酶区、自抑制区、EF手型结构、类似钙调素等结构域。亚细胞定位预测位于叶绿体和液泡上。进化树分析结果显示,该蛋白与小麦Ta CDPK19蛋白的同源性最近。根据各物种间CDPKs蛋白的高同源性,结合小麦TaCDPK19基因被高盐和小麦白粉病菌Blumeria graministritici(Bgt)诱导,推测Bd CDPK4基因也可能参与逆境胁迫下的信号传导途径,在抗逆等生物学过程中发挥重要功能。
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关键词
CDPKS
BdCDPK4
多序列比对
生物信息学分析
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题名
二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶BdCDPK4基因的克隆及其编码蛋白质的生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
韦淑亚
赵旭东
王会平
杨广笑
何光源
机构
武汉职业技术学院生物工程学院应用生物技术研究所
科技部国际科技合作基地(基因
工程
)
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第2期345-352,共8页
基金
高校博士点专项科研基金(20120142110075)
湖北省教育厅自然科学研究计划项目(B2016581)
+1 种基金
河南省教育厅自然科学研究计划项目(2009B210005)
武汉职业技术学院校级博士科研基金(2016BS001)
文摘
二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明,分离了BdCDPK4基因1 851 bp的cDNA序列(Gen Bank登录号为XM_003559516),编码区长度为1 752 bp,编码583个氨基酸,分子量为64.78 ku,等电点为9.12,含有N端可变区、蛋白激酶区、自抑制区、EF手型结构、类似钙调素等结构域。亚细胞定位预测位于叶绿体和液泡上。进化树分析结果显示,该蛋白与小麦Ta CDPK19蛋白的同源性最近。根据各物种间CDPKs蛋白的高同源性,结合小麦TaCDPK19基因被高盐和小麦白粉病菌Blumeria graministritici(Bgt)诱导,推测Bd CDPK4基因也可能参与逆境胁迫下的信号传导途径,在抗逆等生物学过程中发挥重要功能。
关键词
CDPKS
BdCDPK4
多序列比对
生物信息学分析
Keywords
CDPKs
BdCDPK4
multiple sequence alignment
bioinformatics analysis
分类号
Q949.714.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶BdCDPK4基因的克隆及其编码蛋白质的生物信息学分析
韦淑亚
赵旭东
王会平
杨广笑
何光源
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017
2
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