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基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
被引量：
1
1
作者
姚宇轩
邓正栋
+2 位作者
梅洪亮
李翔宇
王剑明
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期772-779,共8页
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM2...
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于TRIM29低表达的胰腺癌患者(P<0.05)。Meta分析验证了TRIM29上调是胰腺癌患者OS的不利预后因素。TRIM29表达水平与胰腺癌T分期和病理分期密切相关(均P<0.05)。TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03~1.36,P<0.05)。列线图分析同样验证了TRIM29的预测能力。GO富集分析结果显示TRIM29可能具有调节细胞外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路相关。TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且TRIM29低甲基化的胰腺癌患者OS和无进展生存期(PFS)显著低于TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05)。结论TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用。
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关键词
胰腺癌
TRIM29
甲基化
生物信息学
预后
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职称材料
题名
基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
被引量：
1
1
作者
姚宇轩
邓正栋
梅洪亮
李翔宇
王剑明
机构
武汉科技大学附属天佑医院肝胆胰外科
华中
科技
大学
同济医学院
附属
同济
医院
小儿
外科
湖北省先天性巨结肠及同源病临床医学研究中心
中国人民解放军中部战区总
医院
普通
外科
华中
科技
大学
同济医学院
附属
同济
医院
胆胰
外科
出处
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期772-779,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82072730)。
文摘
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于TRIM29低表达的胰腺癌患者(P<0.05)。Meta分析验证了TRIM29上调是胰腺癌患者OS的不利预后因素。TRIM29表达水平与胰腺癌T分期和病理分期密切相关(均P<0.05)。TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03~1.36,P<0.05)。列线图分析同样验证了TRIM29的预测能力。GO富集分析结果显示TRIM29可能具有调节细胞外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路相关。TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且TRIM29低甲基化的胰腺癌患者OS和无进展生存期(PFS)显著低于TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05)。结论TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用。
关键词
胰腺癌
TRIM29
甲基化
生物信息学
预后
Keywords
pancreatic cancer
TRIM29
methylation
bioinformatics
prognosis
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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作者
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1
基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
姚宇轩
邓正栋
梅洪亮
李翔宇
王剑明
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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