基于生物信息学分析VCAN作为结直肠癌顺铂耐药关键靶点研究

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作者 李静娴 陈辉广 +3 位作者 吴建泽 王德权 陈志芬 吴清明 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第4期624-633,共10页

目的预测并验证结直肠癌(CRC)顺铂(DDP)耐药的关键靶点,为临床精准医学治疗提供更多方案。方法通过基因表达综合数据库(GEO)筛选出正常肠黏膜和CRC之间差异表达基因(DEGs);采用STRING数据库和Cytoscape软件挖掘关键基因;采用基因本体联... 目的预测并验证结直肠癌(CRC)顺铂(DDP)耐药的关键靶点,为临床精准医学治疗提供更多方案。方法通过基因表达综合数据库(GEO)筛选出正常肠黏膜和CRC之间差异表达基因(DEGs);采用STRING数据库和Cytoscape软件挖掘关键基因;采用基因本体联合数据库(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)对DEGs进行富集分析;利用高通量转录组测序鉴定、qRT-PCR、Western blot筛选、验证关键靶点;将多能蛋白聚糖(VCAN)基因过表达载体转染至人回盲部结直肠腺癌细胞(HCT8)细胞系,CCK-8检测细胞活力;流式细胞术测定细胞凋亡与细胞周期;qRT-PCR与Western blot检测基因mRNA和蛋白水平。结果通过GEO数据库筛选出了118个上调的DEGs和146个下调的DEGs。DEGs主要富集于细胞外基质分解、细胞外基质和磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶(PI3K-AKT)信号通路。基于蛋白质相互作用网络分析,鉴定出20个枢纽基因。通过对比CRC细胞系HCT8亲本株与DDP耐药株的转录组测序结果,进一步筛选出VCAN基因。在CRC组织中,VCAN基因的表达水平高于正常肠黏膜组织;相对于VCAN低表达患者,VCAN高表达的患者总生存期(OS)与无复发生存时间(RFS)更短。在CRC细胞系中,过表达VCAN基因促进了细胞的增殖(P<0.05),提高了细胞对DDP的耐药性,减少了DDP诱导的凋亡(P<0.05)与G_(0)/G_(1)期阻滞(P<0.05);上调VCAN基因激活AKT-雷帕霉素靶蛋白1(mTOR)信号通路。结论基于生物信息学和转录组测序筛选出CRC DDP耐药靶基因VCAN,VCAN基因可能通过调控AKT-mTOR通路促进CRC发展与对DDP的耐药性。 展开更多

关键词 VCAN 顺铂 生物信息学 转录组测序 AKT-mTOR信号通路 化疗耐药

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以消化系统症状为主的系统性红斑狼疮一例误诊五年分析 被引量：2

2

作者 邱宇珍 龙辉 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第13期1563-1565,共3页

本文报告了1例女性患者因反复腹泻、呕吐、浆膜腔积液等,2次抗痨治疗似乎有效,误诊结核性腹膜炎5年余,因再发上腹不适、恶心、呕吐3 d入院,经院内会诊诊断为:系统性红斑狼疮(SLE)合并肠系膜血管炎、假性肠梗阻、不全输尿管梗阻、狼疮肾... 本文报告了1例女性患者因反复腹泻、呕吐、浆膜腔积液等,2次抗痨治疗似乎有效,误诊结核性腹膜炎5年余,因再发上腹不适、恶心、呕吐3 d入院,经院内会诊诊断为:系统性红斑狼疮(SLE)合并肠系膜血管炎、假性肠梗阻、不全输尿管梗阻、狼疮肾炎。治疗后病情控制无反复。该病例提示:SLE以消化系统症状为首发表现者临床误诊率高,对于自身抗体阴性或低滴度阳性的患者合并多系统损害时要警惕SLE。 展开更多

关键词 红斑狼疮 系统性 消化系统 误诊

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甘油三酯葡萄糖体质量指数(TyG-BMI)对高脂血症性急性胰腺炎严重程度的预测价值 被引量：4

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作者 罗萍萍 刘群 黄丽雯 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第8期1661-1665,共5页

目的探讨甘油三酯葡萄糖体质量指数(TyG-BMI)对高脂血症性急性胰腺炎(HLAP)严重程度的预测价值。方法回顾性分析武汉科技大学附属天佑医院2021年1月—2023年12月收治入院的185例HLAP患者临床资料。根据修订的亚特兰大急性胰腺炎分级标... 目的探讨甘油三酯葡萄糖体质量指数(TyG-BMI)对高脂血症性急性胰腺炎(HLAP)严重程度的预测价值。方法回顾性分析武汉科技大学附属天佑医院2021年1月—2023年12月收治入院的185例HLAP患者临床资料。根据修订的亚特兰大急性胰腺炎分级标准分为轻症组95例和中重症组90例,比较两组患者的临床特征,分析TyG-BMI与HLAP严重程度的相关性,评估TyG-BMI对于HLAP严重程度的预测效能。计量资料两组间比较采用成组t检验或Mann-Whitney U检验。计数资料两组间比较采用χ^(2)检验。单因素和多因素Logistic回归分析HLAP严重程度的影响因素。应用Spearman相关性分析探讨TyG-BMI与HLAP严重程度的关系。采用受试者工作特征曲线配对比较法对TyG-BMI预测HLAP严重程度的效能进行评估。结果轻症组和中重症组患者Cr、GLU、TG、TyG-BMI、BISAP评分比较,差异均有统计学意义(Z值分别为−2.059、−7.217、−7.799、−9.566、−11.386,P值均<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,BISAP评分(OR=4.221,95%CI:1.421~12.538,P=0.001)、TyG-BMI(OR=1.262,95%CI:1.140~1.396,P=0.010)和GLU(OR=1.316,95%CI:1.040~1.666,P=0.022)是HLAP严重程度的独立危险因素,且均与HLAP的严重程度呈正相关(r值分别为0.839、0.705、0.532,P值均<0.05)。在预测HLAP严重程度的效能比较中,TyG-BMI略低于BISAP评分(Z=−4.368,P<0.001),但优于GLU(Z=2.155,P<0.001),其受试者工作特征曲线下面积为0.891,敏感度为91.10%,特异度为96.80%。结论TyG-BMI对HLAP严重程度具有一定的预测价值,临床上可用于HLAP病情的综合评估。 展开更多

关键词 胰腺炎 高脂血症 甘油三酯葡萄糖体质量指数

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Sonic hedgehog信号通路与食管癌放射抗拒的相关性研究 被引量：5

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作者 贺昱霖 刘佳琪 +4 位作者 刘群 李欢 龙辉 孟忠吉 吴清明 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1043-1047,共5页

目的:研究Sonic hedgehog(Shh)信号通路在食管癌放射抗拒中的作用及机制。方法:以人食管癌细胞Eca109为亲本株,通过X射线反复照射(累计照射剂量60 Gy)诱导形成放射抗拒细胞株Eca109R。分别采用集落形成实验检测细胞放射敏感性,CCK-8实... 目的:研究Sonic hedgehog(Shh)信号通路在食管癌放射抗拒中的作用及机制。方法:以人食管癌细胞Eca109为亲本株,通过X射线反复照射(累计照射剂量60 Gy)诱导形成放射抗拒细胞株Eca109R。分别采用集落形成实验检测细胞放射敏感性,CCK-8实验检测细胞活力的变化,来证实放射抗拒细胞株Eca109R的放射抗拒性。免疫荧光及Western blot检测Eca109R和亲本细胞Eca109内Gli1蛋白与Shh蛋白的表达。结果:集落形成实验显示2 Gy的X线照射后,Eca109和Eca109R细胞的存活分数(SF_2)分别为0.499±0.042和0.937±0.013;同时,CCK-8实验显示,Eca109R细胞的活力抑制率明显低于Eca109细胞(P<0.05),证实Eca109R细胞有明显的放射抗拒性,诱导形成放射抗拒株成功。免疫荧光结果显示Eca109R细胞中Gli1表达明显高于Eca109细胞(P<0.05)。Western blot实验结果显示Eca109R细胞中的Gli1与Shh蛋白表达明显高于Eca109细胞(P<0.05)。结论:食管癌放射抗拒性的产生可能与Shh信号通路相关蛋白的过表达有关。 展开更多

关键词 食管癌 放射抗拒性 Sonic HEDGEHOG信号通路

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X射线对食管癌中microRNA-296表达的影响 被引量：3

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作者 龙辉 李欢 吴清明 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期457-460,共4页

目的探讨X射线对食管癌中microRNA-296的表达有无影响。方法人食管癌细胞Eca109被分为处理组和对照组,处理组采用X射线反复照射(累计放射剂量至60Gy),MTT法检测两组细胞增殖抑制率,单克隆形成实验检测放射敏感性,Northern blot检测micro... 目的探讨X射线对食管癌中microRNA-296的表达有无影响。方法人食管癌细胞Eca109被分为处理组和对照组,处理组采用X射线反复照射(累计放射剂量至60Gy),MTT法检测两组细胞增殖抑制率,单克隆形成实验检测放射敏感性,Northern blot检测microRNA-296的表达,Real time-PCR法检测食管癌亲本细胞经8Gy的X射线照射后不同时间点microRNA-296的表达情况。结果处理组细胞较对照组细胞增殖抑制率降低,显示出明显的放射抗性,但两组细胞中microRNA-296相对值分别为(0.032 5±0.001 6)和(0.034 1±0.003 2),表达差异无统计学意义。亲本细胞经8Gy射线照射后,计算不同时间点细胞中microRNA-296表达Ct值,30min,2h,6h,12h,24h,48h,72h,7d,10d,14d,18d,microR-296的Ct值分别为:(1.175 4±0.048 2),(1.412 3±0.140 9),(0.969 0±0.106 3),(1.048 8±0.099 9),(0.938 4±0.166 9),(0.870 5±0.213 8),(0.618 3±0.095 1),(1.608 1±0.223 0),(3.045 6±0.414 6),(1.073 5±0.110 2),(0.965 4±0.129 4),对照组Ct值为:(1.290 2±0.187 1)。第3天与第10天时与对照组比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论 microRNA-296与食管癌放射抗拒的产生没有显示直接相关性;X射线对食管癌细胞中microRNA-296的表达有影响,microRNA可能参与食管癌的放射损伤修复机制。 展开更多

关键词 microRNA-296 放射抗拒 食管癌 损伤修复

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粪便miRNA675-5p联合qFIT检测对结直肠癌筛查的诊断价值 被引量：1

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作者 陈洁 王阳 +3 位作者 金曙 李欢 龙辉 吴清明 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期540-544,共5页

目的探讨粪便miRNA675-5p联合qFIT在结直肠癌筛查中的诊断价值。方法纳入2016年1月至2021年12月于武汉科技大学附属天佑医院和十堰市太和医院就诊的173例患者,收集其临床资料及粪便标本,包括48例结直肠癌组、46例腺瘤组、42例息肉组、3... 目的探讨粪便miRNA675-5p联合qFIT在结直肠癌筛查中的诊断价值。方法纳入2016年1月至2021年12月于武汉科技大学附属天佑医院和十堰市太和医院就诊的173例患者,收集其临床资料及粪便标本,包括48例结直肠癌组、46例腺瘤组、42例息肉组、37例正常对照组。采用qRT-PCR法检测粪便miRNA675-5p,定量粪便免疫化学检测(qFIT)检测粪便潜血。采用ROC曲线评估qFIT及miRNA675-5p联合qFIT检测对结直肠癌及腺瘤的诊断价值。结果结直肠癌组的qFIT值[259.94(36.25,758.55)]明显高于腺瘤组[0(0,13.42)]、息肉组[0(0,0)]、正常对照组[0(0,0)],差异有统计学意义(均P<0.01);腺瘤组高于息肉组和正常对照组,差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。结直肠癌组qFIT敏感度为85.4%,特异度为100%;腺瘤组qFIT敏感度为28.3%,特异度为97.3%。联合检测(miRNA675-5p联合qFIT)结直肠癌组敏感度100%,特异度89.2%;腺瘤组敏感度71.7%,特异度86.5%。结直肠癌组、腺瘤组联合检测优于qFIT单独检测,差异有统计学意义(均P<0.01)。结论miRNA675-5p联合qFIT检测能够提高早期结直肠癌筛查诊断效能。 展开更多

关键词 结直肠癌 miRNA675-5p 定量粪便免疫化学检测

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基于高通量测序技术的溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性研究 被引量：50

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作者 余今菁 李欢 +4 位作者 胡邱宇 魏舒 王强 方沈应 吴清明 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期460-465,共6页

目的探讨溃疡性结肠炎(UC)肠道菌群结构、丰度与多样性的变化规律。方法收集13例溃疡性结肠炎患者及42例健康人群的粪便样本,提取基因组DNA并对细菌16SrRNA基因V4区进行PCR扩增,应用Illumina Miseq平台进行高通量测序并进行生物信息学... 目的探讨溃疡性结肠炎(UC)肠道菌群结构、丰度与多样性的变化规律。方法收集13例溃疡性结肠炎患者及42例健康人群的粪便样本,提取基因组DNA并对细菌16SrRNA基因V4区进行PCR扩增,应用Illumina Miseq平台进行高通量测序并进行生物信息学分析。结果溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性较健康对照人群显著下降(P<0.05),两组人群肠道菌群结构均存在明显个体差异。厚壁菌门在溃疡性结肠炎患者的肠道菌群中丰度显著降低(P<0.01),变形菌门和梭杆菌门在溃疡性结肠炎患者肠道菌群中的丰度相比于健康人群显著增高(均P<0.01)。属水平上:溃疡性结肠炎组梭菌属、乳杆菌属、梭杆菌属和动弯杆菌属丰度明显增高(均P<0.05),而Dialister菌属、Faecalibacterium菌属、粪球菌属、毛螺旋菌属和普雷沃氏菌属的丰度与对照组相比显著下降(均P<0.05)。结论溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性、构成及丰度与健康对照人群比较均存在显著差异,溃疡性结肠炎患者肠道菌群结构明显失衡,可能与溃疡性结肠炎的发病和发展有关。 展开更多

关键词 溃疡性结肠炎 肠道菌群 16S RRNA 高通量测序

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上调人食管癌Eca109细胞Shh-Gli1信号通路对放射抗拒性及细胞周期的影响 被引量：3

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作者 余今菁 贺昱霖 +4 位作者 刘佳琪 姚菲 刘群 龙辉 吴清明 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期799-803,共5页

目的:通过上调Sonic Hedgehog(Shh)信号通路关键因子Gli1,探究Shh信号通路与食管癌细胞放射抗拒性及细胞周期的关系。方法:用过表达Gli1质粒转染人食管癌Eca109细胞,记为Eca109-ox-Gli1组;转染空载质粒为阴性对照组;以不作处理的亲本细... 目的:通过上调Sonic Hedgehog(Shh)信号通路关键因子Gli1,探究Shh信号通路与食管癌细胞放射抗拒性及细胞周期的关系。方法:用过表达Gli1质粒转染人食管癌Eca109细胞,记为Eca109-ox-Gli1组;转染空载质粒为阴性对照组;以不作处理的亲本细胞株为正常对照组。Real-time PCR与Western blot检测转染后细胞内Gli1的表达,集落形成实验检测细胞放射敏感性,流式细胞术检测转染前后细胞周期分布。结果:Real-time PCR与Western blot结果均显示Eca109-ox-Gli1组的Gli1表达显著高于阴性对照组和正常对照组(P<0.05)。集落形成实验显示2 Gy射线照射后,Eca109-ox-Gli1组的存活分数较正常对照组明显升高(P<0.05),转染后细胞对射线敏感性降低,放射抗拒性增加。Eca109-ox-Gli1组中S期细胞分布比例显著高于对照组(P<0.01),再照射6Gy后,3组细胞均出现了G_2/M期阻滞,正常对照组相比于Eca109-ox-Gli1组G_2/M期细胞分布显著增高(P<0.01)。结论 :上调Shh信号通路关键因子Gli1能够增强食管癌细胞的放射抗拒性,这一过程可能是通过调控细胞周期实现的。 展开更多

关键词 食管癌 放射抗拒性 细胞周期 Shh-Gli1信号通路

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二甲双胍对2型糖尿病大鼠结直肠癌发生率及其肠道菌群的影响 被引量：6

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作者 黄晓颖 黄启友 +3 位作者 谢竹夫 姚菲 龙辉 吴清明 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期317-325,共9页

目的 探究二甲双胍(MET)对2型糖尿病大鼠结直肠癌发生率及肠道菌群的影响和相关机制。方法 采用高脂高糖饮食联合腹腔低剂量注射链脲佐菌素(STZ)诱导2型糖尿病大鼠模型,在此基础上腹腔注射二甲基肼(DMH)诱导大鼠结直肠癌的发生。通过ME... 目的 探究二甲双胍(MET)对2型糖尿病大鼠结直肠癌发生率及肠道菌群的影响和相关机制。方法 采用高脂高糖饮食联合腹腔低剂量注射链脲佐菌素(STZ)诱导2型糖尿病大鼠模型,在此基础上腹腔注射二甲基肼(DMH)诱导大鼠结直肠癌的发生。通过MET灌胃和控制摄入饮食量的方法模拟临床2型糖尿病患者高血糖的治疗方案。将大鼠分为正常组(NC组),对照组(Control组)和实验组(MET组)。在DMH注射32周末,解剖所有大鼠,记录结直肠肿瘤的发生率、个数,苏木精-伊红(HE)染色观察结直肠组织病理变化,实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测大鼠结直肠组织与肿瘤组织中IL-17的表达,收集大鼠粪便进行16S rRNA测序。结果 (1)成功诱导2型糖尿病大鼠模型并控制实验组大鼠的高血糖。(2)成功诱导2型糖尿病大鼠结直肠癌的发生。(3)实验组和对照组的肿瘤发生率和平均肿瘤数有显著差异。(4)HE染色结果显示二甲双胍干预可缓解2型糖尿病大鼠结直肠正常组织和癌前病变组织中炎性细胞浸润。(5)qRT-PCR检测结果显示肿瘤组织中IL-17的表达显著高于正常组织;对照组正常肠组织中IL-17表达显著高于正常组;而实验组与对照组肿瘤组织中IL-17的表达无统计学差异。(6)二甲双胍干预可降低由DMH诱导的2型糖尿病结直肠癌大鼠肠道菌群的Alpha多样性;NMDS显示实验组与正常组肠道菌群群落组成差异最大,实验组与对照组群落组成相似。组间物种差异结果显示,在门水平上实验组与对照组无明显差异;属水平上,实验组的Ligilactobacillus、Ruminococcus、[Eubacterium]_siraeum_group、Prevotellaceae_NK3B31_group、Alistipes、[Eubacterium]_fissicatena_group、UCG-005丰度均低于对照组(均P<0.05)。结论 二甲双胍干预可降低由DMH诱导的2型糖尿病大鼠结直肠癌的发生率,并影响其肠道菌群多样性和菌群构成。同时二甲双胍降低由DMH诱导的2型糖尿病结直肠癌大鼠正常肠组织中的IL-17表达,但无法抑制其肿瘤组织中IL-17的表达。 展开更多

关键词 二甲双胍 2型糖尿病 结直肠癌 IL-17 肠道菌群

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自噬促进结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶及顺铂的化疗耐药 被引量：4

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作者 周川人 姚菲 +4 位作者 黄晓颖 周艳玲 王强 龙辉 吴清明 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期434-439,共6页

目的探究自噬在结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶(5-FU)及顺铂化疗耐药中的作用。方法选用结直肠癌亲本株HCT8和2种结直肠癌化疗耐药株HCT8/5-FU及HCT8/DDP进行实验研究。MTT比色法检测各组细胞活性及对5-FU和顺铂的敏感性变化;透射电镜下观察... 目的探究自噬在结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶(5-FU)及顺铂化疗耐药中的作用。方法选用结直肠癌亲本株HCT8和2种结直肠癌化疗耐药株HCT8/5-FU及HCT8/DDP进行实验研究。MTT比色法检测各组细胞活性及对5-FU和顺铂的敏感性变化;透射电镜下观察结直肠癌细胞的自噬泡数量;Western blot检测自噬标志性蛋白的表达水平。结果MTT比色法结果显示,HCT8及HCT8/5-FU的5-FU半数抑制浓度(IC_(50))分别为(6.34±0.49)μg/mL及(32.42±8.86)μg/mL,HCT8及HCT8/DDP的顺铂IC_(50)分别为(6.56±0.34)μg/mL及(13.08±0.69)μg/mL,与HCT8相比差异均有统计学意义(均P<0.01)。透射电镜下可见2种耐药株自噬泡数量明显增多,而亲本株HCT8细胞中几乎观察不到。Western blot结果表明,相比亲本株,耐药株的自噬标志性蛋白LC3Ⅱ表达上调,而P62表达下调。经自噬抑制剂氯喹(30μmol/L)预处理的耐药株细胞对5-FU或顺铂的作用更敏感,其细胞存活率分别为(16.02±2.35)%和(43.17±1.64)%,较未经氯喹预处理时明显降低(均P<0.01)。结论自噬与结直肠癌细胞对5-FU及顺铂的化疗耐药性有关,抑制自噬可部分逆转结直肠癌细胞的耐药性,增加其对5-FU和顺铂的敏感度。 展开更多

关键词 自噬 结直肠癌 化疗耐药 5-氟尿嘧啶 顺铂

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根除幽门螺旋杆菌影响因素的研究进展 被引量：29

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作者 刘梦真 刘群 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第12期1339-1344,共6页

幽门螺旋杆菌可以通过口-口、粪-口途径进行传播,且与慢性胃炎、消化性溃疡和胃腺癌等胃肠道疾病的发展有关,世界目前幽门螺旋杆菌根除率并无明显提高,甚至有下降趋势。如何提高幽门螺旋杆菌的根除率是我们临床医师亟待解决的问题。文... 幽门螺旋杆菌可以通过口-口、粪-口途径进行传播,且与慢性胃炎、消化性溃疡和胃腺癌等胃肠道疾病的发展有关,世界目前幽门螺旋杆菌根除率并无明显提高,甚至有下降趋势。如何提高幽门螺旋杆菌的根除率是我们临床医师亟待解决的问题。文章结合国内外文献以及临床新进展,从Hp相关因素、药物因素(PPI的不同、抗生素的耐药)、患者因素(患者生活习性、患者依从性、患者年龄划分、胃部疾病)、其他因素(根除幽门螺旋杆菌治疗方案不同、胃内幽门螺旋杆菌定植密度、)、辅助治疗(益生菌、25-OH维生素D对根除幽门螺杆菌的影响)、疫苗等多方面综述,以期对临床治疗提供一定的帮助。 展开更多

关键词 幽门螺旋杆菌 Hp毒力因子 影响因素 HP根除率 HP疫苗

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