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基于IPA探究Sig-1R在胰岛β细胞中的调控作用
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作者 柯孟婷 戴婧 《中国医药导报》 2025年第3期20-24,共5页
目的探究Sig-1R在胰岛β细胞中的调控作用。方法利用慢病毒转染技术构建稳定敲减Sig-1R和空载对照的MIN6细胞株。采用基因转录物组测序技术,筛选Sig-1R敲减MIN6细胞与空载对照组细胞之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行IPA生物信... 目的探究Sig-1R在胰岛β细胞中的调控作用。方法利用慢病毒转染技术构建稳定敲减Sig-1R和空载对照的MIN6细胞株。采用基因转录物组测序技术,筛选Sig-1R敲减MIN6细胞与空载对照组细胞之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行IPA生物信息学分析。结果转录组测序结果显示,敲减Sig-1R导致MIN6细胞663个基因表达下调和725个基因表达上调。对以上差异表达基因进行IPA生物信息学分析,结果显示,Sig-1R在胰岛β细胞中发挥多重调控作用。经典通路分析显示,敲减Sig-1R对23条经典通路有显著调控作用,其中细胞周期和胆固醇生物合成通路抑制最显著。上游调控因子分析显示,差异表达基因所涉及上游调控因子共有255个,其中CKAP2L和SREBF2这两个上游调控因子也表达下调。疾病与功能分析显示,敲减Sig-1R对42种疾病或功能有调控作用,其中对细胞坏死和细胞凋亡均有促进作用,对细胞增殖、DNA复制和细胞活性均有抑制作用,对发育不全、生殖障碍、家族性先天性畸形、家族性心血管疾病,胃肠腺癌这些疾病有促进作用,对炎症、逆转录病毒感染有抑制作用。结论Sig-1R参与胰岛β细胞多种生物学功能调控,包括细胞周期、细胞增殖、细胞凋亡及胆固醇生物合成,且还可参与其他疾病和功能调控。 展开更多
关键词 Sig-1R MIN6细胞 转录组测序 IPA生物信息学分析
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