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基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性
被引量：
16
1
作者
陈竹
钟山
+3 位作者
罗大极
杨国华
梁日深
邹记兴
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期761-767,共7页
采集广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷Hapalogenys nitens(Richardson)和养殖斜带髭鲷各25个样本。通过设计特异性引物,采用PCR技术对该50个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,测序得到的序列进行比对,发现该50个序列长度变异较小,均在...
采集广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷Hapalogenys nitens(Richardson)和养殖斜带髭鲷各25个样本。通过设计特异性引物,采用PCR技术对该50个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,测序得到的序列进行比对,发现该50个序列长度变异较小,均在788—790 bp之间,野生型和养殖型区别不大。采用MEGA(version 4.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示:50条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为29.9%、21.5%、35.2%和13.5%,其中A+T的含量(65.1%)显著高于G+C含量(34.9%),表现了明显的碱基偏倚。50个个体表现为26种单倍型,包括91个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.024,单倍型多态性(h)为0.958,核苷酸多态性(π)值为0.02277。研究表明,mtDNA D-loop区可以作为检测野生与养殖斜带髭鲷群体遗传多样性的有效分子标记,而广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷种群遗传多样性已经下降至中等水平。研究提示野生斜带髭鲷种群遗传多样性不容乐观,资源调查、种质维护与遗传评价有待深入。
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关键词
斜带髭鲷
线粒体基因组
D-LOOP
基因多态性
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职称材料
杂交鳢及其亲本血清蛋白和甘油三酯含量的比较分析
被引量：
2
2
作者
杨国华
钟山
+3 位作者
杨萍
李忠
茅沈丽
邹记兴
《河北渔业》
2011年第10期4-6,24,共4页
研究采用全自动生化分析仪,检测并比较杂交鳢(乌鳢♂×斑鳢♀)及其亲本血清蛋白及甘油三酯含量的异同。结果显示,在总蛋白(TP)和白蛋白(ALB)的含量上,杂交鳢均与其父本(乌鳢)无显著性差异,与其母本(斑鳢)有显著性差异(P<0.05);...
研究采用全自动生化分析仪,检测并比较杂交鳢(乌鳢♂×斑鳢♀)及其亲本血清蛋白及甘油三酯含量的异同。结果显示,在总蛋白(TP)和白蛋白(ALB)的含量上,杂交鳢均与其父本(乌鳢)无显著性差异,与其母本(斑鳢)有显著性差异(P<0.05);在高密度脂蛋白(HDL)含量上,杂交鳢则与其父本(乌鳢)有显著性差异(P<0.05),而与其母本(斑鳢)无显著性差异;在甘油三酯含量上,杂交鳢与其父母本均无显著性差异。杂交鳢的双亲乌鳢和斑鳢在这4个检测指标中均存在着显著性差异(P<0.05)。表明杂交鳢在白蛋白及总蛋白含量上与其父本(乌鳢)具有较高的遗传相似性,而在高密度脂蛋白的含量上与其母本(斑鳢)具有较高的遗传相似性,在甘油三酯的含量上则与其双亲都具有相似性。
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关键词
杂交鳢
乌鳢
斑鳢
血清蛋白
甘油三酯
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职称材料
斜带髭鲷线粒体DNA控制区序列的结构分析
被引量：
1
3
作者
陆星
梁日深
+3 位作者
陈竹
杨萍
邹记兴
钟山
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第6期78-83,共6页
采用PCR技术获得我国南海斜带髭鲷(Hapalogenys nitens)养殖及野生群体共50尾样品的mtDNA控制区全序列,长度范围788～790bp;测得序列与GenBank下载的其他鲈形目鱼类D-loop全序列利用CLUSTALX进行排序后,对控制区结构进行分析。识别了其...
采用PCR技术获得我国南海斜带髭鲷(Hapalogenys nitens)养殖及野生群体共50尾样品的mtDNA控制区全序列,长度范围788～790bp;测得序列与GenBank下载的其他鲈形目鱼类D-loop全序列利用CLUSTALX进行排序后,对控制区结构进行分析。识别了其终止结合序列区、中央保守区和保守序列区,指出了终止相关序列的主体是TACAT与其反向互补序列ATGTA以及一系列保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D和CSB-1、CSB-2、CSB-3),并给出了其一般形式;此外,基于斜带髭鲷D-Loop全长序列,利用贝叶斯法构建了分子系统进化树。结果显示,斜带髭鲷养殖群体与野生群体部分样品各自紧密聚成一小支,而在整棵进化树上,养殖样品与野生样品相互交错聚集在一起,可见本研究海区斜带髭鲷养殖群体与野生群体之间的遗传差异分化不显著。
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关键词
斜带髭鲷
线粒体基因组
D-LOOP
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职称材料
题名
基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性
被引量：
16
1
作者
陈竹
钟山
罗大极
杨国华
梁日深
邹记兴
机构
武汉大学遗传学系
华南农业
大学
动物科学学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期761-767,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:3077165230972258)资助
文摘
采集广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷Hapalogenys nitens(Richardson)和养殖斜带髭鲷各25个样本。通过设计特异性引物,采用PCR技术对该50个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,测序得到的序列进行比对,发现该50个序列长度变异较小,均在788—790 bp之间,野生型和养殖型区别不大。采用MEGA(version 4.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示:50条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为29.9%、21.5%、35.2%和13.5%,其中A+T的含量(65.1%)显著高于G+C含量(34.9%),表现了明显的碱基偏倚。50个个体表现为26种单倍型,包括91个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.024,单倍型多态性(h)为0.958,核苷酸多态性(π)值为0.02277。研究表明,mtDNA D-loop区可以作为检测野生与养殖斜带髭鲷群体遗传多样性的有效分子标记,而广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷种群遗传多样性已经下降至中等水平。研究提示野生斜带髭鲷种群遗传多样性不容乐观,资源调查、种质维护与遗传评价有待深入。
关键词
斜带髭鲷
线粒体基因组
D-LOOP
基因多态性
Keywords
Hapalogenys nitens
Mitochondrial genome
D-loop
Genetic diversity
分类号
Q346.5 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
杂交鳢及其亲本血清蛋白和甘油三酯含量的比较分析
被引量：
2
2
作者
杨国华
钟山
杨萍
李忠
茅沈丽
邹记兴
机构
中国水产科学研究院淡水生态与健康养殖重点开放实验室中国水产科学研究院长江水产研究所
武汉大学遗传学系
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
华南农业
大学
动物科学学院
出处
《河北渔业》
2011年第10期4-6,24,共4页
基金
国水产科学研究院长江水产研究所开放课题(编号:2010FEA03014)资助
广东省清远市科技计划项目
文摘
研究采用全自动生化分析仪,检测并比较杂交鳢(乌鳢♂×斑鳢♀)及其亲本血清蛋白及甘油三酯含量的异同。结果显示,在总蛋白(TP)和白蛋白(ALB)的含量上,杂交鳢均与其父本(乌鳢)无显著性差异,与其母本(斑鳢)有显著性差异(P<0.05);在高密度脂蛋白(HDL)含量上,杂交鳢则与其父本(乌鳢)有显著性差异(P<0.05),而与其母本(斑鳢)无显著性差异;在甘油三酯含量上,杂交鳢与其父母本均无显著性差异。杂交鳢的双亲乌鳢和斑鳢在这4个检测指标中均存在着显著性差异(P<0.05)。表明杂交鳢在白蛋白及总蛋白含量上与其父本(乌鳢)具有较高的遗传相似性,而在高密度脂蛋白的含量上与其母本(斑鳢)具有较高的遗传相似性,在甘油三酯的含量上则与其双亲都具有相似性。
关键词
杂交鳢
乌鳢
斑鳢
血清蛋白
甘油三酯
Keywords
hybrid snakehead
Channa argus
Channa maculata
serum protein
triglycercide
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
斜带髭鲷线粒体DNA控制区序列的结构分析
被引量：
1
3
作者
陆星
梁日深
陈竹
杨萍
邹记兴
钟山
机构
武汉大学
医学
遗传学
系
华南农业
大学
动物科学学院
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第6期78-83,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30771652
30972258)
中国博士后科学基金(20070420788)共同资助
文摘
采用PCR技术获得我国南海斜带髭鲷(Hapalogenys nitens)养殖及野生群体共50尾样品的mtDNA控制区全序列,长度范围788～790bp;测得序列与GenBank下载的其他鲈形目鱼类D-loop全序列利用CLUSTALX进行排序后,对控制区结构进行分析。识别了其终止结合序列区、中央保守区和保守序列区,指出了终止相关序列的主体是TACAT与其反向互补序列ATGTA以及一系列保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D和CSB-1、CSB-2、CSB-3),并给出了其一般形式;此外,基于斜带髭鲷D-Loop全长序列,利用贝叶斯法构建了分子系统进化树。结果显示,斜带髭鲷养殖群体与野生群体部分样品各自紧密聚成一小支,而在整棵进化树上,养殖样品与野生样品相互交错聚集在一起,可见本研究海区斜带髭鲷养殖群体与野生群体之间的遗传差异分化不显著。
关键词
斜带髭鲷
线粒体基因组
D-LOOP
Keywords
Hapalogenys nitens
mitochondrial genome
D-loop
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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被引量
操作
1
基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性
陈竹
钟山
罗大极
杨国华
梁日深
邹记兴
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
16
在线阅读
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职称材料
2
杂交鳢及其亲本血清蛋白和甘油三酯含量的比较分析
杨国华
钟山
杨萍
李忠
茅沈丽
邹记兴
《河北渔业》
2011
2
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职称材料
3
斜带髭鲷线粒体DNA控制区序列的结构分析
陆星
梁日深
陈竹
杨萍
邹记兴
钟山
《水生态学杂志》
北大核心
2011
1
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