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基于SRAP标记的紫溪山华山松种子园无性系遗传多样性分析
被引量：
5
1
作者
刘成
徐剑
+5 位作者
罗正平
董云祥
董章宏
瞿绍宏
李显煌
辛培尧
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期462-470,共9页
为明确云南楚雄市紫溪山华山松种子园内不同种源无性系间的遗传背景,该研究收集了园内6个种源的60个华山松无性系单株针叶,采用改良CTAB法提取其总DNA,并利用SRAP分子标记对其进行遗传多样性分析。结果表明:(1)从100对引物组合中共筛选...
为明确云南楚雄市紫溪山华山松种子园内不同种源无性系间的遗传背景,该研究收集了园内6个种源的60个华山松无性系单株针叶,采用改良CTAB法提取其总DNA,并利用SRAP分子标记对其进行遗传多样性分析。结果表明:(1)从100对引物组合中共筛选出15对具有多态性的SRAP引物,经SRAP-PCR扩增后,共获得出194个位点,多态位点百分率(PPB)为85.05%,Nei’s基因多样性指数(H)为0.2337,Shannon’s信息指数(I)为0.3419,种源间的遗传分化系数(GST)为0.3555。(2)华山松6个种源遗传多样性较高,且遗传变异主要存在于华山松种源内,种源地会泽(HZ)与巍山(WS)种源的遗传距离最近(D=0.0501),会泽(HZ)与宜良(YL)种源的遗传距离最远(D=0.3618)。(3)聚类分析显示将6个华山松种源一共聚为3类:会泽(HZ)和巍山(WS)种源聚为一类;楚雄(CX)、南华(NH)和宜良(YL)种源聚为一类;腾冲(TC)种源单独为一类。综合上述结果显示,紫溪山华山松种子园内无性系间的遗传分化处于较高水平,为华山松杂交育种时亲本的选配及种质资源的评价提供了分子水平的理论依据。
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关键词
华山松
种子园
无性系
SRAP
遗传多样性
在线阅读
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职称材料
华山松SRAP引物的筛选与验证
被引量：
3
2
作者
叶鹏
瞿绍宏
+6 位作者
李云芳
罗正平
董云祥
刘成
董章宏
鲁华
辛培尧
《西南林业大学学报（自然科学）》
CAS
北大核心
2020年第1期22-27,共6页
为筛选华山松SRAP遗传多样性引物,以华山松无性系种子园6个种源的30株优良无性系幼嫩无病害针叶为实验材料,基于SRAP标记技术,选用10条正向引物、10条反向引物,随机组合成100个SRAP引物组合,对华山松DNA进行PCR扩增。结果表明:实验共筛...
为筛选华山松SRAP遗传多样性引物,以华山松无性系种子园6个种源的30株优良无性系幼嫩无病害针叶为实验材料,基于SRAP标记技术,选用10条正向引物、10条反向引物,随机组合成100个SRAP引物组合,对华山松DNA进行PCR扩增。结果表明:实验共筛选获得15对多态性较为丰富并且具有可重复性的有效引物;15对引物共扩增出3767条DNA条带,其中,多态性条带有2448条,占总条带数的64.99%,平均多态性比率为64.28%。所得15对SRAP引物适合作为华山松遗传多样性分析。
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关键词
华山松
SRAP
引物筛选
验证
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职称材料
题名
基于SRAP标记的紫溪山华山松种子园无性系遗传多样性分析
被引量：
5
1
作者
刘成
徐剑
罗正平
董云祥
董章宏
瞿绍宏
李显煌
辛培尧
机构
面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心
云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地
云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室
楚雄市紫溪山省级自然保护区管理局
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期462-470,共9页
基金
国家重点研发计划子课题(2017YFD060120204)
云南省重点研发计划项目(2018BB005)
云南省省级林业科技推广项目([2018]ts04)。
文摘
为明确云南楚雄市紫溪山华山松种子园内不同种源无性系间的遗传背景,该研究收集了园内6个种源的60个华山松无性系单株针叶,采用改良CTAB法提取其总DNA,并利用SRAP分子标记对其进行遗传多样性分析。结果表明:(1)从100对引物组合中共筛选出15对具有多态性的SRAP引物,经SRAP-PCR扩增后,共获得出194个位点,多态位点百分率(PPB)为85.05%,Nei’s基因多样性指数(H)为0.2337,Shannon’s信息指数(I)为0.3419,种源间的遗传分化系数(GST)为0.3555。(2)华山松6个种源遗传多样性较高,且遗传变异主要存在于华山松种源内,种源地会泽(HZ)与巍山(WS)种源的遗传距离最近(D=0.0501),会泽(HZ)与宜良(YL)种源的遗传距离最远(D=0.3618)。(3)聚类分析显示将6个华山松种源一共聚为3类:会泽(HZ)和巍山(WS)种源聚为一类;楚雄(CX)、南华(NH)和宜良(YL)种源聚为一类;腾冲(TC)种源单独为一类。综合上述结果显示,紫溪山华山松种子园内无性系间的遗传分化处于较高水平,为华山松杂交育种时亲本的选配及种质资源的评价提供了分子水平的理论依据。
关键词
华山松
种子园
无性系
SRAP
遗传多样性
Keywords
Pinus armandii
seed orchard
clone
SRAP
genetic diversity
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
华山松SRAP引物的筛选与验证
被引量：
3
2
作者
叶鹏
瞿绍宏
李云芳
罗正平
董云祥
刘成
董章宏
鲁华
辛培尧
机构
西南林业大学西南
山
地森林资源保育与利用教育部重点实验室
云龙县漕涧林场
楚雄市紫溪山省级自然保护区管理局
出处
《西南林业大学学报（自然科学）》
CAS
北大核心
2020年第1期22-27,共6页
基金
云南省科技厅科技计划项目(2018BB005)资助
国家重点研发计划子课题(2017YFD060120204)资助
云南省省级林业科技推广项目([2018]ts04)资助
文摘
为筛选华山松SRAP遗传多样性引物,以华山松无性系种子园6个种源的30株优良无性系幼嫩无病害针叶为实验材料,基于SRAP标记技术,选用10条正向引物、10条反向引物,随机组合成100个SRAP引物组合,对华山松DNA进行PCR扩增。结果表明:实验共筛选获得15对多态性较为丰富并且具有可重复性的有效引物;15对引物共扩增出3767条DNA条带,其中,多态性条带有2448条,占总条带数的64.99%,平均多态性比率为64.28%。所得15对SRAP引物适合作为华山松遗传多样性分析。
关键词
华山松
SRAP
引物筛选
验证
Keywords
Pinus armandii
SRAP
primer selection
validation
分类号
S791.241 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SRAP标记的紫溪山华山松种子园无性系遗传多样性分析
刘成
徐剑
罗正平
董云祥
董章宏
瞿绍宏
李显煌
辛培尧
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
华山松SRAP引物的筛选与验证
叶鹏
瞿绍宏
李云芳
罗正平
董云祥
刘成
董章宏
鲁华
辛培尧
《西南林业大学学报（自然科学）》
CAS
北大核心
2020
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
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