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梵净山同域分布黔金丝猴和藏酋猴肠道寄生虫比较研究
1
作者
黄小龙
李海波
+7 位作者
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
《野生动物学报》
北大核心
2024年第4期744-756,共13页
肠道寄生虫可作为反映宿主生存状态的指标,为了解梵净山同域分布黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道寄生虫组成,基于18S rRNA高通量测序技术对采集的42份冬季粪便样本进行鉴定。结果表明:共获得44个属...
肠道寄生虫可作为反映宿主生存状态的指标,为了解梵净山同域分布黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道寄生虫组成,基于18S rRNA高通量测序技术对采集的42份冬季粪便样本进行鉴定。结果表明:共获得44个属于寄生虫类群的ASVs,归属于10门26属;二者的肠道寄生虫主要由线虫动物门(Nematoda)组成,其中,鞭虫属(Trichuris)线虫为黔金丝猴的主要寄生类群,鞭虫属和宫脂线虫属(Hysterothylacium)线虫为藏酋猴的主要寄生类群;藏酋猴肠道寄生虫α多样性(Shannon、Simpson和Richness指数)均高于黔金丝猴,但未达到显著水平,β多样性分析发现二者肠道寄生虫组成差异显著(R=0.406,P<0.05);PICRUSt功能预测分析表明二者肠道寄生虫功能基因在Level 1水平上主要与生物合成、前体代谢物和能量的产生有关,且二者差异显著(P<0.05),在Level 2水平上与28类代谢通路相关,其中6类具有显著性差异;代谢通路物种组成差异分析表明,在属级分层上有14属与28类Level 2代谢通路相关联,每条代谢通路可由多种物种共同协作完成,并发挥不同程度的作用。本研究初步了解了梵净山同域分布黔金丝猴和藏酋猴的肠道寄生虫组成和功能,可为后续研究肠道寄生虫对宿主的影响及野生和圈养非人灵长类动物的保护提供思路。
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关键词
黔金丝猴
藏酋猴
肠道寄生虫
高通量测序
功能预测
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职称材料
梵净山同域分布黔金丝猴与藏酋猴的肠道微生物结构差异
被引量:
2
2
作者
黄小龙
李海波
+7 位作者
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期183-194,共12页
肠道微生物与动物的健康密切相关,动物肠道微生物伴随宿主进化并与胃肠道构成复杂的微生态系统。为探究梵净山同域分布的黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道微生物组成和功能差异,本研究采集两个物种冬...
肠道微生物与动物的健康密切相关,动物肠道微生物伴随宿主进化并与胃肠道构成复杂的微生态系统。为探究梵净山同域分布的黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道微生物组成和功能差异,本研究采集两个物种冬季粪便样本进行16S rRNA基因高通量测序。结果显示,藏酋猴肠道微生物Chao1和Shannon指数都显著高于黔金丝猴(P<0.05),基于bray-curtis距离矩阵的β多样性分析发现两者的肠道微生物群落结构存在一定相似性和差异性。门水平,厚壁菌门(Firmicutes)占两者肠道微生物的绝对优势,且藏酋猴相对丰度高于黔金丝猴;属水平,除相对丰度较高的不动杆菌属(Acinetobacter)和颤螺旋菌属(Oscillospira)外,其他优势菌属类群均不相同。LEfSe分析发现粪球菌属(Coprococcus)、布劳特氏菌属(Blautia)、阿克曼菌属(Akkermansia)等与代谢通路功能相关的微生物在两者之间差异显著。PICRUSt功能预测分析表明,两者肠道微生物与新陈代谢、基因信息处理、环境信息处理和细胞过程等功能相关,Level 2水平,有3类代谢通路具有显著性差异(P<0.05)。黔金丝猴与藏酋猴肠道微生物组成和群落特征差异较大,可能是由于同域觅食灵长类的种类、数量及食物来源不同。同时,PICRUSt功能预测揭示了两者肠道微生物功能基因丰度的显著差异,表明两者可以通过调整自身肠道微生物组成来适应外界食物资源变化带来的挑战。该结果可为生态位高度重叠的两种灵长类肠道微生物的深入研究提供一定科学依据,也对两者开展野外人工保护干预措施的建立具有一定参考价值和现实意义。
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关键词
黔金丝猴
藏酋猴
梵净山
肠道微生物
16S
rRNA基因测序
PICRUSt功能预测
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职称材料
题名
梵净山同域分布黔金丝猴和藏酋猴肠道寄生虫比较研究
1
作者
黄小龙
李海波
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
机构
贵州省林业科学
研究
院
梵净山森林生态系统国家级定位观测研究站
贵州省林业科学
研究
院西南喀斯特山地生物多样性保护
国家
林业和草原局重点实验室
梵净山
国家级
自然保护区管理局
湖南张家界大鲵
国家级
自然保护区事务中心
贵州师范大学生命科学学院
出处
《野生动物学报》
北大核心
2024年第4期744-756,共13页
基金
贵州省林业科研项目(黔林科合J字〔2022〕10号,黔林科合J字〔2022〕13号,黔林科合〔2024〕14号)
贵州省科技计划项目(黔科合支撑〔2023〕一般188,黔科合支撑〔2024〕一般129,黔科合服企〔2023〕009)。
文摘
肠道寄生虫可作为反映宿主生存状态的指标,为了解梵净山同域分布黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道寄生虫组成,基于18S rRNA高通量测序技术对采集的42份冬季粪便样本进行鉴定。结果表明:共获得44个属于寄生虫类群的ASVs,归属于10门26属;二者的肠道寄生虫主要由线虫动物门(Nematoda)组成,其中,鞭虫属(Trichuris)线虫为黔金丝猴的主要寄生类群,鞭虫属和宫脂线虫属(Hysterothylacium)线虫为藏酋猴的主要寄生类群;藏酋猴肠道寄生虫α多样性(Shannon、Simpson和Richness指数)均高于黔金丝猴,但未达到显著水平,β多样性分析发现二者肠道寄生虫组成差异显著(R=0.406,P<0.05);PICRUSt功能预测分析表明二者肠道寄生虫功能基因在Level 1水平上主要与生物合成、前体代谢物和能量的产生有关,且二者差异显著(P<0.05),在Level 2水平上与28类代谢通路相关,其中6类具有显著性差异;代谢通路物种组成差异分析表明,在属级分层上有14属与28类Level 2代谢通路相关联,每条代谢通路可由多种物种共同协作完成,并发挥不同程度的作用。本研究初步了解了梵净山同域分布黔金丝猴和藏酋猴的肠道寄生虫组成和功能,可为后续研究肠道寄生虫对宿主的影响及野生和圈养非人灵长类动物的保护提供思路。
关键词
黔金丝猴
藏酋猴
肠道寄生虫
高通量测序
功能预测
Keywords
Rhinopithecus brelichi
Macaca thibetana
Intestinal parasites
High-throughput sequenc‐ing
Functional prediction
分类号
Q958.9 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
梵净山同域分布黔金丝猴与藏酋猴的肠道微生物结构差异
被引量:
2
2
作者
黄小龙
李海波
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
机构
贵州省林业科学
研究
院
梵净山
国家级
自然保护区管理局
梵净山森林生态系统国家级定位观测研究站
湖南张家界大鲵
国家级
自然保护区事务中心
贵州师范大学生命科学学院
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期183-194,共12页
基金
黔金丝猴肠道微生物群落结构研究(黔林科合J字[2022]10号)
采用DNA测序技术研究黔金丝猴的食性(黔林科合J字[2022]13号)
黔金丝猴种群致危因子及野外繁育人工干预调控关键技术研究(黔科合支撑[2023]一般188)。
文摘
肠道微生物与动物的健康密切相关,动物肠道微生物伴随宿主进化并与胃肠道构成复杂的微生态系统。为探究梵净山同域分布的黔金丝猴(Rhinopithecus brelichi)和藏酋猴(Macaca thibetana)的肠道微生物组成和功能差异,本研究采集两个物种冬季粪便样本进行16S rRNA基因高通量测序。结果显示,藏酋猴肠道微生物Chao1和Shannon指数都显著高于黔金丝猴(P<0.05),基于bray-curtis距离矩阵的β多样性分析发现两者的肠道微生物群落结构存在一定相似性和差异性。门水平,厚壁菌门(Firmicutes)占两者肠道微生物的绝对优势,且藏酋猴相对丰度高于黔金丝猴;属水平,除相对丰度较高的不动杆菌属(Acinetobacter)和颤螺旋菌属(Oscillospira)外,其他优势菌属类群均不相同。LEfSe分析发现粪球菌属(Coprococcus)、布劳特氏菌属(Blautia)、阿克曼菌属(Akkermansia)等与代谢通路功能相关的微生物在两者之间差异显著。PICRUSt功能预测分析表明,两者肠道微生物与新陈代谢、基因信息处理、环境信息处理和细胞过程等功能相关,Level 2水平,有3类代谢通路具有显著性差异(P<0.05)。黔金丝猴与藏酋猴肠道微生物组成和群落特征差异较大,可能是由于同域觅食灵长类的种类、数量及食物来源不同。同时,PICRUSt功能预测揭示了两者肠道微生物功能基因丰度的显著差异,表明两者可以通过调整自身肠道微生物组成来适应外界食物资源变化带来的挑战。该结果可为生态位高度重叠的两种灵长类肠道微生物的深入研究提供一定科学依据,也对两者开展野外人工保护干预措施的建立具有一定参考价值和现实意义。
关键词
黔金丝猴
藏酋猴
梵净山
肠道微生物
16S
rRNA基因测序
PICRUSt功能预测
Keywords
Rhinopithecus brelichi
Macaca thibetana
Fanjingshan National Nature Reserve
Gut microbial
16S rRNA gene sequencing
PICRUSt function prediction
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
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作者
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被引量
操作
1
梵净山同域分布黔金丝猴和藏酋猴肠道寄生虫比较研究
黄小龙
李海波
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
《野生动物学报》
北大核心
2024
0
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职称材料
2
梵净山同域分布黔金丝猴与藏酋猴的肠道微生物结构差异
黄小龙
李海波
张旭
程绍传
晏玉莹
杨伟
蒙秉顺
王丞
杨杰
冉景丞
《兽类学报》
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北大核心
2024
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