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以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库
1
作者
杨小亮
白大章
+6 位作者
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
高剑峰
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期887-894,共8页
在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选...
在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库(库库杂交),对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定,并与相应的已知序列信息和基因注释的BAC克隆比对以及在NCBI Blastn数据库中序列相似性检索,旨在验证基因注释结果的准确性和对基因(序列)功能的初步分析。实验中,经过两轮杂交共筛选出27个cDNA阳性克隆(序列),并发现这些序列均可定位到相应的BAC克隆上,且25条序列处在注释基因的外显子部分;在NCBI数据库中经Blastn序列相似性检索发现,23条序列与牛基因的序列相似性最高,且与免疫功能密切相关。
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关键词
绵羊MHC
细菌人工染色体(BAC)
CDNA文库
噬菌斑原位杂交
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职称材料
绵羊基因组MHCClassⅢ区段部分基因的分离与鉴定
2
作者
杨小亮
高剑峰
+6 位作者
白大章
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期580-586,共7页
绵羊基因组MHC段分为ClassⅠ、ClassⅢ和ClassⅡ(含Ⅱa和Ⅱb两个亚区)3个区段,与另外2个区段相比,ClassⅢ区的基因信息远少于ClassⅠ和ClassⅡ区.为丰富绵羊基因组MHC ClassⅢ区段基因信息.本研究用位于中国美利奴羊基因组BAC文库中MHC ...
绵羊基因组MHC段分为ClassⅠ、ClassⅢ和ClassⅡ(含Ⅱa和Ⅱb两个亚区)3个区段,与另外2个区段相比,ClassⅢ区的基因信息远少于ClassⅠ和ClassⅡ区.为丰富绵羊基因组MHC ClassⅢ区段基因信息.本研究用位于中国美利奴羊基因组BAC文库中MHC ClassⅢ区段4个BAC克隆的酶切片段制备32P标记探针,继而采用噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库,并对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定及生物信息学分析.本实验共筛选出31个cDNA阳性克隆,对其序列进行了测定及分析,确定了序列在ClassⅢ区段上的位置,并通过在NCBI中的同源检索对其功能做了初步鉴定.由实验可知,利用BAC文库与cDNA文库杂交筛选法对较大区段基因的筛选和分离是有效的.同时,对分离到的表达序列结合生物信息学进行分析,这将有助于对该序列功能的深入研究.
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关键词
绵羊MHC
细菌人工染色体(BAC)
CDNA文库
噬菌斑原位杂交
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职称材料
题名
以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库
1
作者
杨小亮
白大章
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
高剑峰
机构
石河子
大学
动物
科技学院
石河子
大学
生命
科学
学院
中国
科学
院遗传与发育
生物
学
研究所
梅西大学兽医动物和生物医学科学研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期887-894,共8页
基金
科技部国际合作重大项目(编号:2006DFB33750)
国家重点基础研究发展规划项目(973计划)(编号:2010CB530200)资助
文摘
在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库(库库杂交),对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定,并与相应的已知序列信息和基因注释的BAC克隆比对以及在NCBI Blastn数据库中序列相似性检索,旨在验证基因注释结果的准确性和对基因(序列)功能的初步分析。实验中,经过两轮杂交共筛选出27个cDNA阳性克隆(序列),并发现这些序列均可定位到相应的BAC克隆上,且25条序列处在注释基因的外显子部分;在NCBI数据库中经Blastn序列相似性检索发现,23条序列与牛基因的序列相似性最高,且与免疫功能密切相关。
关键词
绵羊MHC
细菌人工染色体(BAC)
CDNA文库
噬菌斑原位杂交
Keywords
ovar-MHC
bacterial artificial chromosome （BAC）
cDNA library
plaque in situ hybridization.
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
绵羊基因组MHCClassⅢ区段部分基因的分离与鉴定
2
作者
杨小亮
高剑峰
白大章
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
机构
石河子
大学
动物
科技学院
石河子
大学
生命
科学
学院
中国
科学
院遗传与发育
生物
学
研究所
新西兰
梅西
大学
兽医
、
动物
和生物医学
科学
研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期580-586,共7页
基金
国家科技部国际合作项目基金(No.2006DFB33750)资助~~
文摘
绵羊基因组MHC段分为ClassⅠ、ClassⅢ和ClassⅡ(含Ⅱa和Ⅱb两个亚区)3个区段,与另外2个区段相比,ClassⅢ区的基因信息远少于ClassⅠ和ClassⅡ区.为丰富绵羊基因组MHC ClassⅢ区段基因信息.本研究用位于中国美利奴羊基因组BAC文库中MHC ClassⅢ区段4个BAC克隆的酶切片段制备32P标记探针,继而采用噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库,并对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定及生物信息学分析.本实验共筛选出31个cDNA阳性克隆,对其序列进行了测定及分析,确定了序列在ClassⅢ区段上的位置,并通过在NCBI中的同源检索对其功能做了初步鉴定.由实验可知,利用BAC文库与cDNA文库杂交筛选法对较大区段基因的筛选和分离是有效的.同时,对分离到的表达序列结合生物信息学进行分析,这将有助于对该序列功能的深入研究.
关键词
绵羊MHC
细菌人工染色体(BAC)
CDNA文库
噬菌斑原位杂交
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库
杨小亮
白大章
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
高剑峰
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
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职称材料
2
绵羊基因组MHCClassⅢ区段部分基因的分离与鉴定
杨小亮
高剑峰
白大章
邱巍
董慧芹
李大全
陈芳
马润林
Hugh T Blair
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
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