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题名柯萨奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息学分析
被引量：15
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作者
刘洪波
阳广菲
欧维琳
沈关心
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机构
桂林医学院第二附属医院检验科
桂林医学院药学院临床药学
桂林医学院附属医院儿科
华中科技大学同济医学院免疫学系
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出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期536-541,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(81460304,81360248)
广西自然科学基金(2015GXNSFDA139020)
广西壮族自治区卫生厅科研课题(Z2014298)
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文摘
目的：预测柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法：应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果：CVA6 VP1为一亲水性蛋白,其相对分子量为33.6 k D,等电点为7.92,含有24个可能的磷酸化位点,没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点;其二级结构中以无规则卷曲居多,有48.52%的氨基酸残基暴露于溶液界面;该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位,其中的155～165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论：成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位,为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。
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关键词
柯萨奇病毒A组6型
VP1蛋白
生物学信息
B细胞表位
理化性质
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Keywords
Coxsackievirus A6
VP1 protein
Bioinformatics
B-cell epitope
Physicochemical property
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分类号
R373.23
[医药卫生—病原生物学]
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