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佛手瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析
被引量：
3
1
作者
苏何玲
肖雅伦
+4 位作者
谭燕莲
梁斌
谷云艳
刘永明
吴耀生
《安徽农业科学》
CAS
2016年第32期142-146,共5页
[目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶(SQS)基因,并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构,为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5'末端保守序列和3'race方法扩增的佛手瓜SQS基因3'末端序列设计佛手瓜SQS基因克...
[目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶(SQS)基因,并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构,为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5'末端保守序列和3'race方法扩增的佛手瓜SQS基因3'末端序列设计佛手瓜SQS基因克隆引物。扩增的佛手瓜SQS基因片段插入p GEM-T Easy Vector后经DNA测序。应用生物信息学方法分析克隆序列的开放阅读框架(ORF)、酶蛋白的疏水性/亲水性和蛋白质磷酸化位点,预测酶蛋白的二级结构、结构域、三级结构和跨膜区。以布朗葡萄藻为outgroup,应用MEGA 5.0进行UPGMA算法构建系统树,并进行1 000次的Bootstrap测试。[结果]佛手瓜SQS由417氨基酸残基构成,等电点为6.983。构象预测提示该酶二级结构以α螺旋为主,是一种只有三级结构的单体酶,其活性中心是主要由几个α螺旋围绕形成的穴状结构,酶蛋白肽链中具有1个跨膜区。结构域分析表明SQS属于异戊二烯合酶家族。磷酸化位点分析显示该酶共有17个磷酸化位点,其中,S48位于与酶活性中心相关模体中,而S196为陆生植物SQS基因的正选择位点。以佛手瓜SQS基因ORF序列构建系统发生树得到的系统发生分类结果与形态学分类结果一致。[结论]佛手瓜SQS是由417氨基酸残基构成的单体酶,具有1个跨膜区和17个磷酸化位点,其中,S48和S196可能是佛手瓜SQS酶活性调节的关键性磷酸化位点。
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关键词
佛手瓜
鲨烯合酶
基因克隆
结构分析
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职称材料
Survivin蛋白和LMP1在鼻咽癌组织中的表达关系
被引量：
6
2
作者
刘强和
向秋
+3 位作者
伍红良
何晓松
刘芳贤
雷迅
《华夏医学》
CAS
2007年第2期175-177,共3页
目的:探讨凋亡抑制基因Survivin蛋白和EB病毒潜伏膜蛋白(LMP1)在鼻咽癌组织中的表达情况以及它们之间的关系。方法:应用免疫组织化学技术S-P法对68例鼻咽癌组织标本进行凋亡抑制基因Survivin蛋白与EB-LMP1的表达检测。结果:鼻咽癌组织Su...
目的:探讨凋亡抑制基因Survivin蛋白和EB病毒潜伏膜蛋白(LMP1)在鼻咽癌组织中的表达情况以及它们之间的关系。方法:应用免疫组织化学技术S-P法对68例鼻咽癌组织标本进行凋亡抑制基因Survivin蛋白与EB-LMP1的表达检测。结果:鼻咽癌组织Survivin蛋白产物的阳性率为82.4%(56/68),LMP1阳性率为67.6%(46/68);56例Sur-vivin蛋白表达的阳性鼻咽癌标本中,有42例LMP1阳性,共同阳性率75.0%(42/56),12例Survivin蛋白表达的阴性鼻咽癌标本中,9例LMP1阴性,共同阴性率66.7%(9/12),两者之间高度相关(P<0.01)。结论:鼻咽癌组织中凋亡抑制基因Survivin蛋白的表达与LMP1的表达密切相关。
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关键词
SURVIVIN蛋白
潜伏膜蛋白
鼻咽癌
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职称材料
题名
佛手瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析
被引量：
3
1
作者
苏何玲
肖雅伦
谭燕莲
梁斌
谷云艳
刘永明
吴耀生
机构
广西医科大学
生物
化学与分子
生物
学教研室
桂林医学院医药生物技术重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2016年第32期142-146,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31260069)
广西高等学校优秀中青年骨干教师培养工程资助项目
文摘
[目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶(SQS)基因,并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构,为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5'末端保守序列和3'race方法扩增的佛手瓜SQS基因3'末端序列设计佛手瓜SQS基因克隆引物。扩增的佛手瓜SQS基因片段插入p GEM-T Easy Vector后经DNA测序。应用生物信息学方法分析克隆序列的开放阅读框架(ORF)、酶蛋白的疏水性/亲水性和蛋白质磷酸化位点,预测酶蛋白的二级结构、结构域、三级结构和跨膜区。以布朗葡萄藻为outgroup,应用MEGA 5.0进行UPGMA算法构建系统树,并进行1 000次的Bootstrap测试。[结果]佛手瓜SQS由417氨基酸残基构成,等电点为6.983。构象预测提示该酶二级结构以α螺旋为主,是一种只有三级结构的单体酶,其活性中心是主要由几个α螺旋围绕形成的穴状结构,酶蛋白肽链中具有1个跨膜区。结构域分析表明SQS属于异戊二烯合酶家族。磷酸化位点分析显示该酶共有17个磷酸化位点,其中,S48位于与酶活性中心相关模体中,而S196为陆生植物SQS基因的正选择位点。以佛手瓜SQS基因ORF序列构建系统发生树得到的系统发生分类结果与形态学分类结果一致。[结论]佛手瓜SQS是由417氨基酸残基构成的单体酶,具有1个跨膜区和17个磷酸化位点,其中,S48和S196可能是佛手瓜SQS酶活性调节的关键性磷酸化位点。
关键词
佛手瓜
鲨烯合酶
基因克隆
结构分析
Keywords
Sechium edule Swartz
Squalene synthase
Gene cloning
Molecular structure analysis
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
Q946.83 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
Survivin蛋白和LMP1在鼻咽癌组织中的表达关系
被引量：
6
2
作者
刘强和
向秋
伍红良
何晓松
刘芳贤
雷迅
机构
桂林
医学院
附属医院耳鼻咽喉-头颈外科
桂林医学院医药生物技术重点实验室
出处
《华夏医学》
CAS
2007年第2期175-177,共3页
基金
广西科学技术厅科研基金资助课题(桂科自0640187)
广西卫生厅科研基金资助课题(重2006522003-05)
文摘
目的:探讨凋亡抑制基因Survivin蛋白和EB病毒潜伏膜蛋白(LMP1)在鼻咽癌组织中的表达情况以及它们之间的关系。方法:应用免疫组织化学技术S-P法对68例鼻咽癌组织标本进行凋亡抑制基因Survivin蛋白与EB-LMP1的表达检测。结果:鼻咽癌组织Survivin蛋白产物的阳性率为82.4%(56/68),LMP1阳性率为67.6%(46/68);56例Sur-vivin蛋白表达的阳性鼻咽癌标本中,有42例LMP1阳性,共同阳性率75.0%(42/56),12例Survivin蛋白表达的阴性鼻咽癌标本中,9例LMP1阴性,共同阴性率66.7%(9/12),两者之间高度相关(P<0.01)。结论:鼻咽癌组织中凋亡抑制基因Survivin蛋白的表达与LMP1的表达密切相关。
关键词
SURVIVIN蛋白
潜伏膜蛋白
鼻咽癌
Keywords
Survivin
latent membrane protein 1
nasopharyngeal carcinoma
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
佛手瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析
苏何玲
肖雅伦
谭燕莲
梁斌
谷云艳
刘永明
吴耀生
《安徽农业科学》
CAS
2016
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
Survivin蛋白和LMP1在鼻咽癌组织中的表达关系
刘强和
向秋
伍红良
何晓松
刘芳贤
雷迅
《华夏医学》
CAS
2007
6
在线阅读
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职称材料
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