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肝细胞癌预后、诊断和免疫细胞浸润相关关键基因及其潜在治疗药物的生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
黎金连
黄岚珍
+4 位作者
黄希仕
李康智
蒋佳丽
张苗苗
吴群英
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1062-1075,共14页
目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采...
目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采用R软件limma包筛选HCC差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选关键基因。通过Kaplan-Meier生存曲线和LASSO回归算法鉴定HCC预后相关关键基因,并利用外部数据集对其表达进行验证和诊断效能分析。采用CIBERSORT算法评估预后相关的关键基因表达与HCC免疫细胞浸润的关系。利用MiRNet和Network Analyst数据库分别构建微小RNA(miRNA)-关键基因mRNA和转录因子(TFs)-关键基因mRNA分子调控网络。利用CMap数据库筛选潜在治疗HCC的小分子药物。结果:共筛选出146个DEGs,其中表达上调基因30个,表达下调基因116个。GO功能和KEGG信号通路富集分析,DEGs明显富集在类固醇、烯化合物和激素代谢等生物过程(BP)及视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450(CYP450)、补体和凝血级联反应等信号通路。PPI网络分析筛选得到14个关键基因,其中甲酰氨基转移酶环化脱氨酶(FTCD)、分泌型磷蛋白2(SPP2)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、补体C6(C6)和CYP450家族成员2C9(CYP2C9)与HCC患者预后、临床病理分期和组织学分级有明显相关性,在HCC诊断中具有较高的诊断效能,与HCC的免疫细胞浸润有密切关联。Hsa-mir-182-5p、同源框CUT样蛋白1(CUX1)、早期生长反应1(EGR1)、SMAD家族成员4(SMAD4)和肿瘤蛋白P53(TP53)是靶向上述预后相关关键基因的重要调控因子。DL-硫沙芬(DL-thiorphan)、异丙嗪(promethazine)和芹菜素(apigenin)可能对HCC有治疗作用。结论:FTCD、SPP2、TAT、C6和CYP2C9可能是HCC诊断、预后判断和治疗的潜在靶点,预测得到的3种小分子药物DL-thiorphan,promethazine和apigenin可为HCC治疗药物的研发提供参考。
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关键词
肝细胞癌
生物标志物
小分子药物
生物信息学
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职称材料
重大突发公共卫生事件综合社会治理力量运行机制研究:以新冠肺炎疫情为例
被引量：
16
2
作者
杨风
马莉丽
+4 位作者
钟彬
朱俊敏
吴红艳
周政希
马明霞
《中国卫生事业管理》
北大核心
2022年第2期85-88,119,共5页
在新冠肺炎疫情爆发背景下,社会治理力量在参与应对重大突发公共卫生事件发挥了重要作用。本文立足于当前中国社会治理的行政、法律、媒体和社会四个方面的力量,分析了四大主体力量的力量特点、作用范围以及运行的困境,对各社会治理力...
在新冠肺炎疫情爆发背景下,社会治理力量在参与应对重大突发公共卫生事件发挥了重要作用。本文立足于当前中国社会治理的行政、法律、媒体和社会四个方面的力量,分析了四大主体力量的力量特点、作用范围以及运行的困境,对各社会治理力量的运行机制进行研究和探讨。最终提出了完善社会治理力量的四大举措,即推进行政应急体系的优化、加快防控法制化的建设进程、强化媒体力量的舆论引导力、整顿和改革社会公益事业。以期突破社会治理面临的难题和挑战,增强全社会应对重大突发公共卫生事件的反应能力,减轻事件带来的社会危害。
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关键词
新冠肺炎疫情治理
重大突发公共卫生事件
社会治理力量
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职称材料
题名
肝细胞癌预后、诊断和免疫细胞浸润相关关键基因及其潜在治疗药物的生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
黎金连
黄岚珍
黄希仕
李康智
蒋佳丽
张苗苗
吴群英
机构
桂林
医学院
智能
医学
与生物技术
学院
细胞与遗传学教研室
南宁中心血站输血传播疾病联合实验室
桂林
医学院
科学实验中心
桂林医学院全科医学院
出处
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1062-1075,共14页
基金
广西壮族自治区教育厅中青年提升项目(2018KY0407)
广西壮族自治区教育厅大学生创新创业训练计划项目(S202310601092)
桂林医学院博士科研启动基金项目(20501021028)。
文摘
目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采用R软件limma包筛选HCC差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选关键基因。通过Kaplan-Meier生存曲线和LASSO回归算法鉴定HCC预后相关关键基因,并利用外部数据集对其表达进行验证和诊断效能分析。采用CIBERSORT算法评估预后相关的关键基因表达与HCC免疫细胞浸润的关系。利用MiRNet和Network Analyst数据库分别构建微小RNA(miRNA)-关键基因mRNA和转录因子(TFs)-关键基因mRNA分子调控网络。利用CMap数据库筛选潜在治疗HCC的小分子药物。结果:共筛选出146个DEGs,其中表达上调基因30个,表达下调基因116个。GO功能和KEGG信号通路富集分析,DEGs明显富集在类固醇、烯化合物和激素代谢等生物过程(BP)及视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450(CYP450)、补体和凝血级联反应等信号通路。PPI网络分析筛选得到14个关键基因,其中甲酰氨基转移酶环化脱氨酶(FTCD)、分泌型磷蛋白2(SPP2)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、补体C6(C6)和CYP450家族成员2C9(CYP2C9)与HCC患者预后、临床病理分期和组织学分级有明显相关性,在HCC诊断中具有较高的诊断效能,与HCC的免疫细胞浸润有密切关联。Hsa-mir-182-5p、同源框CUT样蛋白1(CUX1)、早期生长反应1(EGR1)、SMAD家族成员4(SMAD4)和肿瘤蛋白P53(TP53)是靶向上述预后相关关键基因的重要调控因子。DL-硫沙芬(DL-thiorphan)、异丙嗪(promethazine)和芹菜素(apigenin)可能对HCC有治疗作用。结论:FTCD、SPP2、TAT、C6和CYP2C9可能是HCC诊断、预后判断和治疗的潜在靶点,预测得到的3种小分子药物DL-thiorphan,promethazine和apigenin可为HCC治疗药物的研发提供参考。
关键词
肝细胞癌
生物标志物
小分子药物
生物信息学
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Biomarker
Small molecule drug
Bioinformatics
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
重大突发公共卫生事件综合社会治理力量运行机制研究:以新冠肺炎疫情为例
被引量：
16
2
作者
杨风
马莉丽
钟彬
朱俊敏
吴红艳
周政希
马明霞
机构
桂林
医学院
人文与管理
学院
中国地质大学(武汉)经济管理
学院
桂林医学院全科医学院
出处
《中国卫生事业管理》
北大核心
2022年第2期85-88,119,共5页
基金
国家自然科学基金“多边代理困境视域下新创社会资本办医机构管理层激励扭曲与败德行为治理机制研究”(71864009)
全国软科学研究课题项目“多元协同治理视角下社会力量参与新冠肺炎疫情防控路径研究”(2020QRK023)
广西八桂学者岗位基金资助。
文摘
在新冠肺炎疫情爆发背景下,社会治理力量在参与应对重大突发公共卫生事件发挥了重要作用。本文立足于当前中国社会治理的行政、法律、媒体和社会四个方面的力量,分析了四大主体力量的力量特点、作用范围以及运行的困境,对各社会治理力量的运行机制进行研究和探讨。最终提出了完善社会治理力量的四大举措,即推进行政应急体系的优化、加快防控法制化的建设进程、强化媒体力量的舆论引导力、整顿和改革社会公益事业。以期突破社会治理面临的难题和挑战,增强全社会应对重大突发公共卫生事件的反应能力,减轻事件带来的社会危害。
关键词
新冠肺炎疫情治理
重大突发公共卫生事件
社会治理力量
Keywords
COVID-19 epidemic control
major public health emergencies
social governance forces
分类号
R19 [医药卫生—卫生事业管理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肝细胞癌预后、诊断和免疫细胞浸润相关关键基因及其潜在治疗药物的生物信息学分析
黎金连
黄岚珍
黄希仕
李康智
蒋佳丽
张苗苗
吴群英
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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下载PDF
职称材料
2
重大突发公共卫生事件综合社会治理力量运行机制研究:以新冠肺炎疫情为例
杨风
马莉丽
钟彬
朱俊敏
吴红艳
周政希
马明霞
《中国卫生事业管理》
北大核心
2022
16
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