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蓝莓R2R3-MYB基因鉴定及类黄酮调控基因表达分析
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作者 刘佳丽 宋经荣 +4 位作者 赵文宇 张馨元 赵子洋 曹一博 张凌云 《生物技术通报》 北大核心 2025年第9期124-138,共15页
【目的】解析蓝莓R2R3-MYB转录因子家族在类黄酮调控中的表达模式,为探究蓝莓参与类黄酮合成调控机制提供理论基础。【方法】运用生物信息学手段,对蓝莓R2R3-MYB基因的理化性质、亚细胞定位等进行分析;通过RT-qPCR检测VcMYBs基因在不同... 【目的】解析蓝莓R2R3-MYB转录因子家族在类黄酮调控中的表达模式,为探究蓝莓参与类黄酮合成调控机制提供理论基础。【方法】运用生物信息学手段,对蓝莓R2R3-MYB基因的理化性质、亚细胞定位等进行分析;通过RT-qPCR检测VcMYBs基因在不同组织和果实发育期的表达。【结果】在蓝莓中鉴定出278个R2R3-MYB基因,其氨基酸序列长度为160-970 aa;多数成员亚细胞定位在细胞核,进化树分析将VcMYBs分为23个亚家族,同亚家族基因结构特性相似;顺式作用元件分析表明,VcMYBs可能参与生物和非生物胁迫、激素响应、植物生长发育以及光响应;从可能参与类黄酮合成调控的基因(SG4、SG5、SG6和SG7)中随机选择14个,RT-q PCR分析显示,多数VcMYBs基因在果实中表达水平较高,其中,VcMYB91(SG6)和VcMYB56(SG5)等基因在绿果期低表达,成熟期高表达,可能参与果实着色;然而VcMYB88(SG4)和VcMYB96(SG4)等基因在绿果期高表达,成熟期低表达,可能抑制果实着色;VcMYB236(SG7)和VcMYB44(SG7)基因可能参与黄酮醇合成。【结论】全基因组分析鉴定出278个蓝莓R2R3-MYB基因,解析发现SG5/6亚组4个基因(VcMYB56、VcMYB91等)调控花青素合成,SG4/5亚组6个基因(VcMYB88、VcMYB96等)参与原花青素合成,SG7亚组2个基因(VcMYB236、VcMYB44)可能调控黄酮醇代谢。 展开更多
关键词 蓝莓 R2R3-MYB 生物信息学 组织表达模式 不同果实发育期 类黄酮合成
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