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Radviz可视化方法在基因表达数据分析中的应用
被引量：
1
1
作者
张涛
赵发林
+1 位作者
武振宇
李康
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2011年第1期2-4,8,共4页
目的介绍Radviz可视化的基本原理和方法,并将Radviz可视化应用于基因表达数据的分类和特征选择。方法以结肠癌基因表达数据为例,结合启发式搜索和Vizrank可视化评估,利用Radviz可视化实现基因表达数据的分类和差异基因排序。结果由Vizr...
目的介绍Radviz可视化的基本原理和方法,并将Radviz可视化应用于基因表达数据的分类和特征选择。方法以结肠癌基因表达数据为例,结合启发式搜索和Vizrank可视化评估,利用Radviz可视化实现基因表达数据的分类和差异基因排序。结果由Vizrank算法得到排序前100的Radviz可视化结果,最优的Vizrank得分为0.9491,并得到了17个用于可视化分类的差异基因,其中部分基因获得了生物学解释。结论 Radviz能够形象的呈现隐含在数据中的模式特征,较好地用于基因表达数据的可视化分类和差异基因筛选。
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关键词
基因表达数据
Radviz
可视化
分类
特征选择
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职称材料
题名
Radviz可视化方法在基因表达数据分析中的应用
被引量：
1
1
作者
张涛
赵发林
武振宇
李康
机构
哈尔滨医科
大学
公共
卫生
学院
卫生
统计学
教研室
杭州师范大学医药卫生管理学院社会医学教研室
复旦
大学
公共
卫生
学院
卫生
统计学
教研室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2011年第1期2-4,8,共4页
基金
国家自然科学基金(30872185)
文摘
目的介绍Radviz可视化的基本原理和方法,并将Radviz可视化应用于基因表达数据的分类和特征选择。方法以结肠癌基因表达数据为例,结合启发式搜索和Vizrank可视化评估,利用Radviz可视化实现基因表达数据的分类和差异基因排序。结果由Vizrank算法得到排序前100的Radviz可视化结果,最优的Vizrank得分为0.9491,并得到了17个用于可视化分类的差异基因,其中部分基因获得了生物学解释。结论 Radviz能够形象的呈现隐含在数据中的模式特征,较好地用于基因表达数据的可视化分类和差异基因筛选。
关键词
基因表达数据
Radviz
可视化
分类
特征选择
Keywords
Gene expression data
Radviz
Visualization
Classification
Feature selection
分类号
R195 [医药卫生—卫生统计学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Radviz可视化方法在基因表达数据分析中的应用
张涛
赵发林
武振宇
李康
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2011
1
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参考文献
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