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松茸bHLH基因家族成员的鉴定及其在重金属胁迫下的表达分析
1
作者
郎茜
张敏
+2 位作者
王浩
龚蕾
周玉
《河南农业科学》
北大核心
2025年第7期72-83,共12页
bHLH(Basic helix-loop-helix)转录因子广泛参与植物的生长发育及胁迫应答,为明确松茸中bHLH家族成员的详细信息及其对重金属胁迫应答情况,基于松茸基因组,利用生物信息学方法鉴定松茸中bHLH家族成员,并对其蛋白质理化性质及结构、保守...
bHLH(Basic helix-loop-helix)转录因子广泛参与植物的生长发育及胁迫应答,为明确松茸中bHLH家族成员的详细信息及其对重金属胁迫应答情况,基于松茸基因组,利用生物信息学方法鉴定松茸中bHLH家族成员,并对其蛋白质理化性质及结构、保守结构域、基因启动子顺式作用元件等进行了分析,同时对松茸子实体不同发育阶段、不同冷藏时间及不同重金属胁迫下bHLH家族成员的表达模式进行了研究。结果表明,在松茸基因组中共鉴定到12个bHLH基因,在9条染色体上均匀分布。理化性质分析表明,松茸bHLH(TmabHLH)基因编码氨基酸数目、蛋白质理论分子质量、等电点、不稳定系数分别在96~878个、10.72~96.02 ku、4.72~10.81、33.55~89.90;亚细胞定位分析显示,所有基因均定位于细胞核中,且以亲水、不稳定的核蛋白为主。此外,TmabHLH蛋白的三级结构主要由α-螺旋及无规则卷曲组成,并且TmabHLH基因的启动子序列中含有大量的光响应元件、激素响应元件和非生物胁迫响应元件,暗示其可能参与松茸的生长发育和胁迫应答。转录组分析显示,大部分TmabHLH基因在松茸子实体发育早期大量表达,大部分TmabHLH基因随着冷藏时间的延长表达量呈下降趋势。qRT-PCR检测发现,6个TmabHLH基因均能响应4种重金属胁迫,并且在不同含量下具有不同的表达模式,如As胁迫下基因的响应程度比Hg、Cd和Pb胁迫下更加剧烈。综上所述,松茸bHLH基因家族具有调控松茸响应重金属胁迫的功能。
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关键词
松茸
bHLH基因家族
非生物胁迫
重金属
表达模式
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题名
松茸bHLH基因家族成员的鉴定及其在重金属胁迫下的表达分析
1
作者
郎茜
张敏
王浩
龚蕾
周玉
机构
曲靖医学高等专科学校药学院
曲靖
医学
高等
专科学校
临床
学院
曲靖
市中医医院
曲靖
医学
高等
专科学校
基础
医学
院
云南农业大学云南省药用植物生物学重点实验室
出处
《河南农业科学》
北大核心
2025年第7期72-83,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31660501)。
文摘
bHLH(Basic helix-loop-helix)转录因子广泛参与植物的生长发育及胁迫应答,为明确松茸中bHLH家族成员的详细信息及其对重金属胁迫应答情况,基于松茸基因组,利用生物信息学方法鉴定松茸中bHLH家族成员,并对其蛋白质理化性质及结构、保守结构域、基因启动子顺式作用元件等进行了分析,同时对松茸子实体不同发育阶段、不同冷藏时间及不同重金属胁迫下bHLH家族成员的表达模式进行了研究。结果表明,在松茸基因组中共鉴定到12个bHLH基因,在9条染色体上均匀分布。理化性质分析表明,松茸bHLH(TmabHLH)基因编码氨基酸数目、蛋白质理论分子质量、等电点、不稳定系数分别在96~878个、10.72~96.02 ku、4.72~10.81、33.55~89.90;亚细胞定位分析显示,所有基因均定位于细胞核中,且以亲水、不稳定的核蛋白为主。此外,TmabHLH蛋白的三级结构主要由α-螺旋及无规则卷曲组成,并且TmabHLH基因的启动子序列中含有大量的光响应元件、激素响应元件和非生物胁迫响应元件,暗示其可能参与松茸的生长发育和胁迫应答。转录组分析显示,大部分TmabHLH基因在松茸子实体发育早期大量表达,大部分TmabHLH基因随着冷藏时间的延长表达量呈下降趋势。qRT-PCR检测发现,6个TmabHLH基因均能响应4种重金属胁迫,并且在不同含量下具有不同的表达模式,如As胁迫下基因的响应程度比Hg、Cd和Pb胁迫下更加剧烈。综上所述,松茸bHLH基因家族具有调控松茸响应重金属胁迫的功能。
关键词
松茸
bHLH基因家族
非生物胁迫
重金属
表达模式
Keywords
Tricholoma matsutake
bHLH gene family
Abiotic stress
Heavy metal
Expression pattern
分类号
S567.3 [农业科学—中草药栽培]
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作者
出处
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1
松茸bHLH基因家族成员的鉴定及其在重金属胁迫下的表达分析
郎茜
张敏
王浩
龚蕾
周玉
《河南农业科学》
北大核心
2025
0
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