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基于转录组测序技术筛选NSUN2在卵巢癌细胞的基因差异表达
被引量：
2
1
作者
何婉珊
洪小山
+5 位作者
陈冠桥
陈斌
文斌
林育
韦之富
罗喜平
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第9期1079-1085,共7页
目的应用RNA⁃seq技术研究NSUN2对卵巢癌细胞株A2780基因表达的影响,为阐明NSUN2在卵巢癌症发生发展中的作用提供理论依据。方法慢病毒介导的RNA干扰技术抑制A2780细胞中NSUN2的表达。以转染空载体的细胞为对照,使用RNA⁃seq技术对干扰细...
目的应用RNA⁃seq技术研究NSUN2对卵巢癌细胞株A2780基因表达的影响,为阐明NSUN2在卵巢癌症发生发展中的作用提供理论依据。方法慢病毒介导的RNA干扰技术抑制A2780细胞中NSUN2的表达。以转染空载体的细胞为对照,使用RNA⁃seq技术对干扰细胞株进行基因谱高通量测序分析,筛选出差异表达的基因。并通过KEGG Pathway、GO分析和GSEA富集分析,探索NSUN2调控的差异基因主要参与的相关信号通路和生物学过程。结果与对照组细胞相比,NSUN2敲低的A2780细胞株有1642个差异表达的基因,其中上调基因有1020个,下调基因有622个;通过GO分析、KEGG Pathway和GSEA富集分析发现差异表达基因主要富集在hedgehog信号通路、P53等信号通路上,参与了病毒转录、翻译起始和调节等生物过程;通过对P53信号通路的相关基因进一步分析,筛选出与改通路相关的3个关键基因(ZMAT3、EI24和CCND2),RT⁃qPCR验证其表达结果与测序结果相符。结论A2780 sh⁃NSUN2组与A2780 sh⁃NC组的基因表达谱间存在明显的差异,其差异基因主要富集于P53信号通路。在卵巢癌中NSUN2可能通过调控P53信号通路相关因子的表达,从而调控了卵巢癌的发生发展。
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关键词
NSUN2
卵巢癌
转录组测序技术
P53信号通路
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职称材料
题名
基于转录组测序技术筛选NSUN2在卵巢癌细胞的基因差异表达
被引量：
2
1
作者
何婉珊
洪小山
陈冠桥
陈斌
文斌
林育
韦之富
罗喜平
机构
广州医科
大学
广东省妇幼保健院
妇科
南方医科
大学
暨南大学附属顺德医院妇科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第9期1079-1085,共7页
基金
广州市科技计划项目(编号:202002030174)。
文摘
目的应用RNA⁃seq技术研究NSUN2对卵巢癌细胞株A2780基因表达的影响,为阐明NSUN2在卵巢癌症发生发展中的作用提供理论依据。方法慢病毒介导的RNA干扰技术抑制A2780细胞中NSUN2的表达。以转染空载体的细胞为对照,使用RNA⁃seq技术对干扰细胞株进行基因谱高通量测序分析,筛选出差异表达的基因。并通过KEGG Pathway、GO分析和GSEA富集分析,探索NSUN2调控的差异基因主要参与的相关信号通路和生物学过程。结果与对照组细胞相比,NSUN2敲低的A2780细胞株有1642个差异表达的基因,其中上调基因有1020个,下调基因有622个;通过GO分析、KEGG Pathway和GSEA富集分析发现差异表达基因主要富集在hedgehog信号通路、P53等信号通路上,参与了病毒转录、翻译起始和调节等生物过程;通过对P53信号通路的相关基因进一步分析,筛选出与改通路相关的3个关键基因(ZMAT3、EI24和CCND2),RT⁃qPCR验证其表达结果与测序结果相符。结论A2780 sh⁃NSUN2组与A2780 sh⁃NC组的基因表达谱间存在明显的差异,其差异基因主要富集于P53信号通路。在卵巢癌中NSUN2可能通过调控P53信号通路相关因子的表达,从而调控了卵巢癌的发生发展。
关键词
NSUN2
卵巢癌
转录组测序技术
P53信号通路
Keywords
NSUN2
ovarian cancer
RNA⁃seq technology
P53 signaling pathway
分类号
R711.75 [医药卫生—妇产科学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于转录组测序技术筛选NSUN2在卵巢癌细胞的基因差异表达
何婉珊
洪小山
陈冠桥
陈斌
文斌
林育
韦之富
罗喜平
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023
2
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