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生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
被引量：
2
1
作者
谢卓君
马光宇
+2 位作者
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024年第3期248-255,262,共9页
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生...
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生命不同阶段的菌群动态变化。肠道菌群随着生命周期的变化不断发育、成熟、衰老,显示出年龄特征性。胎儿菌群从宫内开始定植,而出生方式和喂养方式为肠道菌群的早期定植奠定基础,断奶过程促使肠道菌群逐渐成熟;在青春期和更年期,性激素水平的波动与肠道菌群之间相互调节;在衰老阶段,肠道菌群的变化与免疫衰老和慢性低度炎症密切相关;抗生素在整个生命周期中对肠道菌群产生重要的干扰作用,尤其在生命早期的影响更为显著。本文分析了影响正常肠道菌群初始构建、成熟和衰老的重要因素,旨在探讨这些因素与宿主生理功能之间的相互关系,为深入了解肠道微生态系统的动态变化提供理论基础。
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关键词
肠道菌群
微生物群
衰老
婴儿
肠道多样性
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职称材料
SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
2
作者
李沙
李锦忠
+3 位作者
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
2025年第4期505-517,共13页
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依...
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依从性差等问题。因此,亟需开发非侵入性生物标志物以辅助诊断。本研究旨在通过整合机器学习算法与肝脏转录组数据,筛选MASH关键诊断基因,并探讨分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)在MASH中的调控机制及诊断价值。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取MAFLD患者肝脏转录组数据集,通过差异表达分析筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。结合随机森林、人工神经网络、Lasso回归和支持向量机递归特征消除算法筛选关键基因,构建Neural-MASH诊断模型,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估性能。进一步分析候选关键基因与免疫细胞浸润及临床指标的相关性,并进行功能富集分析。结果:共筛选出85个DEGs,功能富集显示其与p53信号通路和细胞外基质(extra cellular matrix,ECM)-受体相互作用密切相关。通过多算法交叉验证,确定SPP1、含Fc受体样及黏蛋白结构域蛋白(fc alpha and mu receptor,FCAMR)、含黄素单加氧酶1(flavin-containing monooxygenase 1,FMO1)为关键基因,其中SPP1在MASH中表达上调,且与B细胞、巨噬细胞M0浸润及临床指标呈正相关(均P<0.05)。Neural-MASH模型在训练集和验证集中的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为1.000和0.811。功能分析揭示SPP1主要参与ECM、细胞迁移调控、脂质定位及IL-18信号通路等生物学过程。结论:SPP1可作为MASH的潜在诊断标志物,其与免疫微环境的交互作用可能在疾病进展中发挥关键调控作用。基于机器学习所构建的Neural-MASH模型具有较高的诊断效能,可为MASH的无创诊断提供参考依据。
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关键词
代谢相关性脂肪性肝炎
分泌型磷蛋白1(SPP1)
人工神经网络
生物标志物
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职称材料
题名
生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
被引量：
2
1
作者
谢卓君
马光宇
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
机构
暨南大学附属第一医院全科医学科
暨南大学
附属
第一
医院
妇产科
出处
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024年第3期248-255,262,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81771664)。
文摘
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生命不同阶段的菌群动态变化。肠道菌群随着生命周期的变化不断发育、成熟、衰老,显示出年龄特征性。胎儿菌群从宫内开始定植,而出生方式和喂养方式为肠道菌群的早期定植奠定基础,断奶过程促使肠道菌群逐渐成熟;在青春期和更年期,性激素水平的波动与肠道菌群之间相互调节;在衰老阶段,肠道菌群的变化与免疫衰老和慢性低度炎症密切相关;抗生素在整个生命周期中对肠道菌群产生重要的干扰作用,尤其在生命早期的影响更为显著。本文分析了影响正常肠道菌群初始构建、成熟和衰老的重要因素,旨在探讨这些因素与宿主生理功能之间的相互关系,为深入了解肠道微生态系统的动态变化提供理论基础。
关键词
肠道菌群
微生物群
衰老
婴儿
肠道多样性
Keywords
intestinal microbiota
microbial community
aging
infants
intestinal diversity
分类号
R71 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
2
作者
李沙
李锦忠
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
机构
华北理工
大学
基础
医学
院
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
2025年第4期505-517,共13页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(82000556)
河北省中医药联合基金重点项目(H2022209087)。
文摘
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依从性差等问题。因此,亟需开发非侵入性生物标志物以辅助诊断。本研究旨在通过整合机器学习算法与肝脏转录组数据,筛选MASH关键诊断基因,并探讨分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)在MASH中的调控机制及诊断价值。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取MAFLD患者肝脏转录组数据集,通过差异表达分析筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。结合随机森林、人工神经网络、Lasso回归和支持向量机递归特征消除算法筛选关键基因,构建Neural-MASH诊断模型,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估性能。进一步分析候选关键基因与免疫细胞浸润及临床指标的相关性,并进行功能富集分析。结果:共筛选出85个DEGs,功能富集显示其与p53信号通路和细胞外基质(extra cellular matrix,ECM)-受体相互作用密切相关。通过多算法交叉验证,确定SPP1、含Fc受体样及黏蛋白结构域蛋白(fc alpha and mu receptor,FCAMR)、含黄素单加氧酶1(flavin-containing monooxygenase 1,FMO1)为关键基因,其中SPP1在MASH中表达上调,且与B细胞、巨噬细胞M0浸润及临床指标呈正相关(均P<0.05)。Neural-MASH模型在训练集和验证集中的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为1.000和0.811。功能分析揭示SPP1主要参与ECM、细胞迁移调控、脂质定位及IL-18信号通路等生物学过程。结论:SPP1可作为MASH的潜在诊断标志物,其与免疫微环境的交互作用可能在疾病进展中发挥关键调控作用。基于机器学习所构建的Neural-MASH模型具有较高的诊断效能,可为MASH的无创诊断提供参考依据。
关键词
代谢相关性脂肪性肝炎
分泌型磷蛋白1(SPP1)
人工神经网络
生物标志物
Keywords
metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
secreted phosphoprotein 1(SPP1)
artificial neural network
biomarker
分类号
R575.5 [医药卫生]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
谢卓君
马光宇
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
李沙
李锦忠
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
2025
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