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SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
1
作者
李沙
李锦忠
+3 位作者
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025年第4期505-517,共13页
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依...
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依从性差等问题。因此,亟需开发非侵入性生物标志物以辅助诊断。本研究旨在通过整合机器学习算法与肝脏转录组数据,筛选MASH关键诊断基因,并探讨分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)在MASH中的调控机制及诊断价值。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取MAFLD患者肝脏转录组数据集,通过差异表达分析筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。结合随机森林、人工神经网络、Lasso回归和支持向量机递归特征消除算法筛选关键基因,构建Neural-MASH诊断模型,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估性能。进一步分析候选关键基因与免疫细胞浸润及临床指标的相关性,并进行功能富集分析。结果:共筛选出85个DEGs,功能富集显示其与p53信号通路和细胞外基质(extra cellular matrix,ECM)-受体相互作用密切相关。通过多算法交叉验证,确定SPP1、含Fc受体样及黏蛋白结构域蛋白(fc alpha and mu receptor,FCAMR)、含黄素单加氧酶1(flavin-containing monooxygenase 1,FMO1)为关键基因,其中SPP1在MASH中表达上调,且与B细胞、巨噬细胞M0浸润及临床指标呈正相关(均P<0.05)。Neural-MASH模型在训练集和验证集中的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为1.000和0.811。功能分析揭示SPP1主要参与ECM、细胞迁移调控、脂质定位及IL-18信号通路等生物学过程。结论:SPP1可作为MASH的潜在诊断标志物,其与免疫微环境的交互作用可能在疾病进展中发挥关键调控作用。基于机器学习所构建的Neural-MASH模型具有较高的诊断效能,可为MASH的无创诊断提供参考依据。
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关键词
代谢相关性脂肪性肝炎
分泌型磷蛋白1(SPP1)
人工神经网络
生物标志物
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职称材料
生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
被引量:
2
2
作者
谢卓君
马光宇
+2 位作者
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期248-255,262,共9页
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生...
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生命不同阶段的菌群动态变化。肠道菌群随着生命周期的变化不断发育、成熟、衰老,显示出年龄特征性。胎儿菌群从宫内开始定植,而出生方式和喂养方式为肠道菌群的早期定植奠定基础,断奶过程促使肠道菌群逐渐成熟;在青春期和更年期,性激素水平的波动与肠道菌群之间相互调节;在衰老阶段,肠道菌群的变化与免疫衰老和慢性低度炎症密切相关;抗生素在整个生命周期中对肠道菌群产生重要的干扰作用,尤其在生命早期的影响更为显著。本文分析了影响正常肠道菌群初始构建、成熟和衰老的重要因素,旨在探讨这些因素与宿主生理功能之间的相互关系,为深入了解肠道微生态系统的动态变化提供理论基础。
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关键词
肠道菌群
微生物群
衰老
婴儿
肠道多样性
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职称材料
血管紧张素转化酶抑制剂或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂治疗非酒精性脂肪性肝病疗效的Meta分析
被引量:
3
3
作者
李锦忠
谌宁
+1 位作者
王丹
龚晓兵
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2018年第29期3597-3603,共7页
背景非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)在全球许多地区成为慢性肝病的主要原因,且部分患者会逐步发展为肝硬化、肝癌等,但是,目前在临床或指南上无明确推荐的药物用于治疗NAFLD。血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂(ARB)类...
背景非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)在全球许多地区成为慢性肝病的主要原因,且部分患者会逐步发展为肝硬化、肝癌等,但是,目前在临床或指南上无明确推荐的药物用于治疗NAFLD。血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂(ARB)类药物成为近期预防和治疗NAFLD的热点。目的分析ACEI或ARB类药物治疗NAFLD的效果。方法计算机检索Cochrane临床对照试验中心注册数据库、EMBase、Medline、中国生物医学文献数据库、中国知网、维普网和万方数据知识服务平台,检索时间为1978—2017年,收集ACEI/ARB类药物治疗NAFLD的随机对照试验(RCT)。采用RevMan 5.3版本软件进行统计分析试验组和对照组肝组织学、实验室检查[丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天冬氨酸氨基转移酶(AST)、血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白(LDL)]。结果共纳入8篇文献,包括646例患者。Meta分析结果显示:试验组与对照组肝脏组织学改善率比较,差异有统计学意义[比值比(OR)=5.52,95%CI(1.78,17.06),P=0.003];试验组ALT、AST水平与对照组比较,差异均无统计学意义[加权均数差(WMD)=-6.90,95%CI(-15.68,1.88),P=0.12;WMD=-3.96,95%CI(-8.64,0.72),P=0.10]。两组TC、TG、LDL水平比较,差异均无统计学意义[WMD=-8.10,95%CI(-21.00,4.80),P=0.22;WMD=-15.36,95%CI(-46.38,15.66),P=0.33;WMD=-2.54,95%CI(-12.58,7.49),P=0.62]。结论 ACEI/ARB类药物可改善NAFLD患者肝脏组织学和肝功能,临床疗效较为确切。但目前关于ACEI/ARB类药物治疗NAFLD的大样本、高质量的RCT较少,仍需更多高质量RCT进行补充和评价。
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关键词
脂肪肝
血管紧张素转化酶抑制剂
血管紧张素Ⅱ型受体拮抗剂
疗效
META分析
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职称材料
题名
SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
1
作者
李沙
李锦忠
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
机构
华北理工
大学
基础医学院
暨南大学
附属
第一
医院
感染科
暨南大学附属第一医院全科
医学科
石家庄市第五
医院
肝病研究所
河北省慢性疾病基础医学重点实验室
唐山市新药基础研究重点实验室
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025年第4期505-517,共13页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(82000556)
河北省中医药联合基金重点项目(H2022209087)。
文摘
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依从性差等问题。因此,亟需开发非侵入性生物标志物以辅助诊断。本研究旨在通过整合机器学习算法与肝脏转录组数据,筛选MASH关键诊断基因,并探讨分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)在MASH中的调控机制及诊断价值。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取MAFLD患者肝脏转录组数据集,通过差异表达分析筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。结合随机森林、人工神经网络、Lasso回归和支持向量机递归特征消除算法筛选关键基因,构建Neural-MASH诊断模型,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估性能。进一步分析候选关键基因与免疫细胞浸润及临床指标的相关性,并进行功能富集分析。结果:共筛选出85个DEGs,功能富集显示其与p53信号通路和细胞外基质(extra cellular matrix,ECM)-受体相互作用密切相关。通过多算法交叉验证,确定SPP1、含Fc受体样及黏蛋白结构域蛋白(fc alpha and mu receptor,FCAMR)、含黄素单加氧酶1(flavin-containing monooxygenase 1,FMO1)为关键基因,其中SPP1在MASH中表达上调,且与B细胞、巨噬细胞M0浸润及临床指标呈正相关(均P<0.05)。Neural-MASH模型在训练集和验证集中的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为1.000和0.811。功能分析揭示SPP1主要参与ECM、细胞迁移调控、脂质定位及IL-18信号通路等生物学过程。结论:SPP1可作为MASH的潜在诊断标志物,其与免疫微环境的交互作用可能在疾病进展中发挥关键调控作用。基于机器学习所构建的Neural-MASH模型具有较高的诊断效能,可为MASH的无创诊断提供参考依据。
关键词
代谢相关性脂肪性肝炎
分泌型磷蛋白1(SPP1)
人工神经网络
生物标志物
Keywords
metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
secreted phosphoprotein 1(SPP1)
artificial neural network
biomarker
分类号
R575.5 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
被引量:
2
2
作者
谢卓君
马光宇
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
机构
暨南大学附属第一医院全科
医学科
暨南大学
附属
第一
医院
妇产科
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期248-255,262,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81771664)。
文摘
肠道菌群作为人体内最大最复杂的微生态系统,与宿主形成互利共生关系,其构成和功能在整个生命周期中呈现出变化,同时保持相对稳定。随着肠道菌群研究技术的发展,越来越多的研究聚焦于遗传、营养和环境等因素对肠道菌群的影响,特别是生命不同阶段的菌群动态变化。肠道菌群随着生命周期的变化不断发育、成熟、衰老,显示出年龄特征性。胎儿菌群从宫内开始定植,而出生方式和喂养方式为肠道菌群的早期定植奠定基础,断奶过程促使肠道菌群逐渐成熟;在青春期和更年期,性激素水平的波动与肠道菌群之间相互调节;在衰老阶段,肠道菌群的变化与免疫衰老和慢性低度炎症密切相关;抗生素在整个生命周期中对肠道菌群产生重要的干扰作用,尤其在生命早期的影响更为显著。本文分析了影响正常肠道菌群初始构建、成熟和衰老的重要因素,旨在探讨这些因素与宿主生理功能之间的相互关系,为深入了解肠道微生态系统的动态变化提供理论基础。
关键词
肠道菌群
微生物群
衰老
婴儿
肠道多样性
Keywords
intestinal microbiota
microbial community
aging
infants
intestinal diversity
分类号
R71 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
血管紧张素转化酶抑制剂或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂治疗非酒精性脂肪性肝病疗效的Meta分析
被引量:
3
3
作者
李锦忠
谌宁
王丹
龚晓兵
机构
暨南大学
附属
第一
医院
消化科
暨南大学附属第一医院全科
出处
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2018年第29期3597-3603,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(81671946)
广东省医学科学技术研究基金资助项目(A2015479)
文摘
背景非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)在全球许多地区成为慢性肝病的主要原因,且部分患者会逐步发展为肝硬化、肝癌等,但是,目前在临床或指南上无明确推荐的药物用于治疗NAFLD。血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂(ARB)类药物成为近期预防和治疗NAFLD的热点。目的分析ACEI或ARB类药物治疗NAFLD的效果。方法计算机检索Cochrane临床对照试验中心注册数据库、EMBase、Medline、中国生物医学文献数据库、中国知网、维普网和万方数据知识服务平台,检索时间为1978—2017年,收集ACEI/ARB类药物治疗NAFLD的随机对照试验(RCT)。采用RevMan 5.3版本软件进行统计分析试验组和对照组肝组织学、实验室检查[丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天冬氨酸氨基转移酶(AST)、血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白(LDL)]。结果共纳入8篇文献,包括646例患者。Meta分析结果显示:试验组与对照组肝脏组织学改善率比较,差异有统计学意义[比值比(OR)=5.52,95%CI(1.78,17.06),P=0.003];试验组ALT、AST水平与对照组比较,差异均无统计学意义[加权均数差(WMD)=-6.90,95%CI(-15.68,1.88),P=0.12;WMD=-3.96,95%CI(-8.64,0.72),P=0.10]。两组TC、TG、LDL水平比较,差异均无统计学意义[WMD=-8.10,95%CI(-21.00,4.80),P=0.22;WMD=-15.36,95%CI(-46.38,15.66),P=0.33;WMD=-2.54,95%CI(-12.58,7.49),P=0.62]。结论 ACEI/ARB类药物可改善NAFLD患者肝脏组织学和肝功能,临床疗效较为确切。但目前关于ACEI/ARB类药物治疗NAFLD的大样本、高质量的RCT较少,仍需更多高质量RCT进行补充和评价。
关键词
脂肪肝
血管紧张素转化酶抑制剂
血管紧张素Ⅱ型受体拮抗剂
疗效
META分析
Keywords
Fatty liver
Angiotension converting enzyme inhibiter
AngiotensinⅡtype receptor blockers
Effectiveness
Meta-analysis
分类号
R575.5 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
李沙
李锦忠
谌宁
李敏然
戴二黑
齐亚娟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
生命周期不同阶段肠道菌群的影响因素
谢卓君
马光宇
陈鹏宇
陈瑩儿
肖小敏
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024
2
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职称材料
3
血管紧张素转化酶抑制剂或血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂治疗非酒精性脂肪性肝病疗效的Meta分析
李锦忠
谌宁
王丹
龚晓兵
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2018
3
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