为鉴定不同种植物中的HMGR(3-Hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase)基因,采用生物信息学方法分析拟南芥、番茄、马铃薯等18种植物中HMGR蛋白的理化性质,并对其跨膜结构、亚细胞定位、修饰位点等特性进行分析,预测18种植物HMG...为鉴定不同种植物中的HMGR(3-Hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase)基因,采用生物信息学方法分析拟南芥、番茄、马铃薯等18种植物中HMGR蛋白的理化性质,并对其跨膜结构、亚细胞定位、修饰位点等特性进行分析,预测18种植物HMGR基因编码蛋白的高级结构和保守结构域。结果表明,甜瓜HMGR蛋白序列最长,由1 244个氨基酸组成,草莓HMGR蛋白序列最短,由131个氨基酸组成;玉米HMGR蛋白的等电点最高,为10.12,草莓HMGR蛋白的等电点最低,为4.72;除芒果、玉米、小麦、杨树和桃HMGR蛋白带正电荷之外,其余植物均带负电荷。除玉米、杨树、草莓之外,其余植物的脂肪族指数均在90以上,推断HMGR大多为疏水蛋白;HMGR蛋白在芒果中最稳定,在梨和杏中的最强疏水性最高,在杨树中的最强亲水性最高;除草莓外,其余植物中的HMGR都具有跨膜结构,其中甜瓜跨膜结构位置最多。对蛋白质修饰位点的分析结果显示,草莓中的HMGR蛋白的糖基化位点数量最少,杏的糖基化修饰位点最多,拟南芥的磷酸化位点数量最多,草莓的磷酸化位点数量最少,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成。HMGR基因基本被分为3类,且除玉米外,17种植物HMGR蛋白均包含HMG-CoA reductase ClassⅠ结构域。展开更多