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轿子山3种杜鹃根际微生物种群结构研究
被引量:
4
1
作者
殷根深
苏源
+1 位作者
董明华
赵昌佑
《林业调查规划》
2020年第5期126-132,共7页
为探究物种和生境对杜鹃属植物根际微生物群落结构的影响,采集云南轿子山国家级自然保护区分布于同一生境以及不同生境的3种杜鹃属植物(锈红毛杜鹃、亮鳞杜鹃、乳黄杜鹃)的6个根际土壤样本,提取土壤总DNA后,进行二代高通量测序,并开展...
为探究物种和生境对杜鹃属植物根际微生物群落结构的影响,采集云南轿子山国家级自然保护区分布于同一生境以及不同生境的3种杜鹃属植物(锈红毛杜鹃、亮鳞杜鹃、乳黄杜鹃)的6个根际土壤样本,提取土壤总DNA后,进行二代高通量测序,并开展了生物信息学分析。结果表明,重抽样后,共获得55608条最终序列,检测到3209个OTUs;除来自于锈红毛杜鹃的DB样本外,其余5个样本在门、科、属水平上具有类似的丰度;亮鳞杜鹃和乳黄杜鹃各自的2个不同生境样本的微生物群落结构参数相似,而锈红毛杜鹃的2个样本则差异较大。可见,物种和生境对植物根际微生物群落结构均产生影响。
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关键词
杜鹃属
根际微生物
种群结构
生境
生物信息学
聚类分析
轿子山
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职称材料
拟南芥热激因子AtHsfA1a在低温胁迫下对细胞程序性死亡中Caspase-3活性的影响
被引量:
3
2
作者
郭丽红
徐娅
+3 位作者
郤秋霞
李念
檀文涛
张学兰
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第21期24-27,共4页
为了研究拟南芥热激因子AtHsfA1a对低温胁迫下细胞程序性死亡(programmed cell death,简称PCD)中含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl aspartate specific protease,简称Caspase)活性的影响,进一步确定拟南芥热激因子AtHsfA1a与...
为了研究拟南芥热激因子AtHsfA1a对低温胁迫下细胞程序性死亡(programmed cell death,简称PCD)中含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl aspartate specific protease,简称Caspase)活性的影响,进一步确定拟南芥热激因子AtHsfA1a与低温胁迫中PCD的关系。以热激因子AtHsfA1a不同基因型(野生型、基因沉默型)的拟南芥为材料,首先获得单细胞,于4℃处理1 h后,测定热激因子AtHsfA1a的表达量,发现基因沉默型中AtHsfA1a的表达量低于野生型。接着用4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,简称DAPI)进行染色,在荧光显微镜下观察细胞形态,结果表明,低温胁迫后野生型未出现凋亡小体,基因沉默型的细胞出现了细胞凋亡小体。最后根据荧光底物Ac-DEVD-p NA的断裂程度测定Caspase-3活性,结果发现,低温处理后的拟南芥Caspase-3活性明显增强,而AtHsfA1a基因沉默型拟南芥Caspase-3活性比野生型拟南芥的高,说明低温胁迫下拟南芥AtHsfA1a能够抑制Caspase-3蛋白酶的活性。研究结果初步表明,在低温胁迫下拟南芥热激因子AtHsfA1a可以通过抑制Caspase-3蛋白酶的活性而对细胞程序性死亡有一定的抑制作用,这对于揭示植物耐逆境反应机制具有重要意义。
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关键词
拟南芥
热激因子AtHsfA1a
低温胁迫
细胞程序性死亡
CASPASE-3活性
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职称材料
题名
轿子山3种杜鹃根际微生物种群结构研究
被引量:
4
1
作者
殷根深
苏源
董明华
赵昌佑
机构
昆明学院/云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室
云南
轿子山国家级自然保护区管护局
出处
《林业调查规划》
2020年第5期126-132,共7页
基金
国家自然科学基金(31860107)
云南省地方本科高校基础研究联合专项资金(2017FH001-111).
文摘
为探究物种和生境对杜鹃属植物根际微生物群落结构的影响,采集云南轿子山国家级自然保护区分布于同一生境以及不同生境的3种杜鹃属植物(锈红毛杜鹃、亮鳞杜鹃、乳黄杜鹃)的6个根际土壤样本,提取土壤总DNA后,进行二代高通量测序,并开展了生物信息学分析。结果表明,重抽样后,共获得55608条最终序列,检测到3209个OTUs;除来自于锈红毛杜鹃的DB样本外,其余5个样本在门、科、属水平上具有类似的丰度;亮鳞杜鹃和乳黄杜鹃各自的2个不同生境样本的微生物群落结构参数相似,而锈红毛杜鹃的2个样本则差异较大。可见,物种和生境对植物根际微生物群落结构均产生影响。
关键词
杜鹃属
根际微生物
种群结构
生境
生物信息学
聚类分析
轿子山
Keywords
Rhododendron
rhizosphere microorganism
community structure
habitat
bioinformatics
cluster analysis
Mt.Jiaozi
分类号
S718.542 [农业科学—林学]
S685.21 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
拟南芥热激因子AtHsfA1a在低温胁迫下对细胞程序性死亡中Caspase-3活性的影响
被引量:
3
2
作者
郭丽红
徐娅
郤秋霞
李念
檀文涛
张学兰
机构
昆明学院/云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室
昆明
学院/
昆明
市滇池水生态恢复
重点
实验室
昆明
学院
农
学院
昆明
学院
生命科学与技术系
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第21期24-27,共4页
基金
国家自然科学基金(编号:31260061
31060039)
云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室项目(编号:GXZD201601)
文摘
为了研究拟南芥热激因子AtHsfA1a对低温胁迫下细胞程序性死亡(programmed cell death,简称PCD)中含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl aspartate specific protease,简称Caspase)活性的影响,进一步确定拟南芥热激因子AtHsfA1a与低温胁迫中PCD的关系。以热激因子AtHsfA1a不同基因型(野生型、基因沉默型)的拟南芥为材料,首先获得单细胞,于4℃处理1 h后,测定热激因子AtHsfA1a的表达量,发现基因沉默型中AtHsfA1a的表达量低于野生型。接着用4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,简称DAPI)进行染色,在荧光显微镜下观察细胞形态,结果表明,低温胁迫后野生型未出现凋亡小体,基因沉默型的细胞出现了细胞凋亡小体。最后根据荧光底物Ac-DEVD-p NA的断裂程度测定Caspase-3活性,结果发现,低温处理后的拟南芥Caspase-3活性明显增强,而AtHsfA1a基因沉默型拟南芥Caspase-3活性比野生型拟南芥的高,说明低温胁迫下拟南芥AtHsfA1a能够抑制Caspase-3蛋白酶的活性。研究结果初步表明,在低温胁迫下拟南芥热激因子AtHsfA1a可以通过抑制Caspase-3蛋白酶的活性而对细胞程序性死亡有一定的抑制作用,这对于揭示植物耐逆境反应机制具有重要意义。
关键词
拟南芥
热激因子AtHsfA1a
低温胁迫
细胞程序性死亡
CASPASE-3活性
分类号
Q945.78 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
轿子山3种杜鹃根际微生物种群结构研究
殷根深
苏源
董明华
赵昌佑
《林业调查规划》
2020
4
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职称材料
2
拟南芥热激因子AtHsfA1a在低温胁迫下对细胞程序性死亡中Caspase-3活性的影响
郭丽红
徐娅
郤秋霞
李念
檀文涛
张学兰
《江苏农业科学》
北大核心
2017
3
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