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单细胞蛋白质组学分析方法的应用进展
1
作者
沈品
谢芹
+2 位作者
杨恩泽
程祥
孙毅
《山东医药》
CAS
2022年第30期107-110,共4页
单细胞蛋白质组学分析方法有肽段识别和蛋白质推断、蛋白质丰度定量、蛋白质生物功能分析。从质谱仪中获取单细胞蛋白质裂解谱后,利用单细胞质谱分析工具(MASCOT、Andromeda)识别肽段,推断蛋白质类型。采用毛细管电泳电喷雾电离高分辨...
单细胞蛋白质组学分析方法有肽段识别和蛋白质推断、蛋白质丰度定量、蛋白质生物功能分析。从质谱仪中获取单细胞蛋白质裂解谱后,利用单细胞质谱分析工具(MASCOT、Andromeda)识别肽段,推断蛋白质类型。采用毛细管电泳电喷雾电离高分辨率质谱技术可识别单细胞中同位素编码的蛋白质标记,与有标定量软件MaxQuant联合使用,对完整蛋白质组和低丰度蛋白质组的灵敏度和特异度较高。基于质谱的单细胞蛋白质分析软件可用于分析单细胞蛋白质的生物过程、分子功能、细胞成分及相关信号通路。基于质谱定量的MaxQuant数据库可构建蛋白质相互作用网络,分析单细胞蛋白质的生物学功能。
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关键词
蛋白质组学
蛋白质组学分析方法
单细胞蛋白质组学分析方法
质谱分析法
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职称材料
题名
单细胞蛋白质组学分析方法的应用进展
1
作者
沈品
谢芹
杨恩泽
程祥
孙毅
机构
无锡市第二人民
医院
急诊科
昆明
医科
大学
生物医学工程研究院
昆明医科大学附属心血管病医院/云南省阜外心血管病医院心外科
出处
《山东医药》
CAS
2022年第30期107-110,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(81960072)
云南省卫生和计划生育委员会医学后备人才(H-2017015)
+1 种基金
云南省心血管病临床医学中心项目(FZX2019-06-01)
昆明医科大学研究生创新基金项目(2021S088)。
文摘
单细胞蛋白质组学分析方法有肽段识别和蛋白质推断、蛋白质丰度定量、蛋白质生物功能分析。从质谱仪中获取单细胞蛋白质裂解谱后,利用单细胞质谱分析工具(MASCOT、Andromeda)识别肽段,推断蛋白质类型。采用毛细管电泳电喷雾电离高分辨率质谱技术可识别单细胞中同位素编码的蛋白质标记,与有标定量软件MaxQuant联合使用,对完整蛋白质组和低丰度蛋白质组的灵敏度和特异度较高。基于质谱的单细胞蛋白质分析软件可用于分析单细胞蛋白质的生物过程、分子功能、细胞成分及相关信号通路。基于质谱定量的MaxQuant数据库可构建蛋白质相互作用网络,分析单细胞蛋白质的生物学功能。
关键词
蛋白质组学
蛋白质组学分析方法
单细胞蛋白质组学分析方法
质谱分析法
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞蛋白质组学分析方法的应用进展
沈品
谢芹
杨恩泽
程祥
孙毅
《山东医药》
CAS
2022
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