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携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌耐药流行特征分析被引量：7: 1; 作者陈正辉刘淑敏杜艳《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第10期1281-1285,共5页; 目的了解昆明医科大学第一附属医院携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌的分子流行特征。方法收集昆明医科大学第一附属医院2011年12月—2014年10月临床送检的非重复标本,通过VITEK-2系统鉴定耐碳青酶烯类肠杆菌科细菌(CRE),EDTA协同纸... 展开更多; 关键词 blaNDM-1基因耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌同源性; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于高通量芯片对急性髓系白血病竞争内源性RNA网络的构建和分析被引量：3: 2; 作者潘玉卿孙运艳 +5 位作者李轶勋王丽英斯南卓玛陈睿张曦杜艳《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期669-676,共8页; 目的:构建急性髓系白血病(AML)相关的竞争内源性RNA(ceRNA)网络,探讨AML发生发展的分子机制。方法:采用NCBI的基因表达数据库(GEO)下载AML的表达矩阵(GSE96535),通过R语言的edgeR函数对差异表达的mRNA和长链非编码RNA(lncRNA)进行筛选... 展开更多; 关键词生物信息学急性髓系白血病竞争内源性RNA 基因芯片; 在线阅读下载PDF 职称材料

36例新型隐球菌性脑膜炎的临床分析被引量：10: 3; 作者王芳黄琛 +1 位作者杜艳卯建《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第2期273-276,共4页; 目的探讨36例新型隐球菌性脑膜炎的临床特征,以提高对该病的认识。方法分析36例新型隐球菌感染患者的临床资料。结果新型隐球菌感染的患者临床表现均有不同程度的头痛、颅内压增高表现,葡萄糖降低尤为显著,IgG、IgM、IgA及微量总蛋白升... 展开更多; 关键词新型隐球菌隐球菌性脑膜炎临床分析诊断治疗; 在线阅读下载PDF 职称材料

人早幼粒细胞cDNA文库的构建及其鉴定被引量：1: 4; 作者张曦潘玉卿 +6 位作者李静芳杨伟高艳章魏颖石琼夏全松杨丽《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1015-1019,共5页; 目的:构建人早幼粒细胞HL60的cDNA文库,阐明文库内相关基因在急性早幼粒细胞白血病(APL)发生发展中的相关机制。方法:采用Trizol法提取HL60细胞总RNA,离心柱法分离纯化样本中的mRNA,逆转录PCR法合成cDNA第一链,酶促法直接合成cDNA第二链... 展开更多; 关键词白血病人早幼粒细胞酵母双杂交 CDNA文库; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于高通量芯片对小儿急性髓系白血病的生物信息学分析: 5; 作者张曦翟丽 +4 位作者孙运艳杨伟高艳章雷鸣潘玉卿《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1036-1042,I0007,共8页; 目的:通过生物信息学工具筛选小儿急性髓系白血病(AML)相关的差异表达基因(DEGs),探讨小儿AML的核心基因并阐明其发病机制。方法:从基因表达数据库(GEO)下载符合本研究要求的小儿AML的转录组数据,采用基因表达分析工具(GEO2R)进行DEGs... 展开更多; 关键词生物信息学急性髓系白血病差异基因基因芯片; 在线阅读下载PDF 职称材料

人早幼粒细胞cDNA文库中与GINS2发生相互作用靶蛋白的筛选和鉴定: 6; 作者张曦潘玉卿 +6 位作者余鑫郑亚婷郭成斌徐娜王良晓何亮杨丽《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期66-72,共7页; 目的:采用酵母双杂交系统筛选与人GINS2编码蛋白发生相互作用的靶蛋白,阐明其在急性早幼粒细胞白血病(APL)中的致病信号及相关机制。方法:采用热激法将诱饵质粒pGBKT7-GINS2与人早幼粒细胞cDNA文库质粒共同转化至酵母AH109感受态细胞中... 展开更多; 关键词白血病人早幼粒细胞cDNA文库酵母双杂交 GINS2; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌耐药流行特征分析被引量：7: 1; 作者陈正辉刘淑敏杜艳; 机构昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室; 出处《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第10期1281-1285,共5页; 基金云南省医疗卫生单位内设研究机构科研项目(No.2016NS030); 文摘目的了解昆明医科大学第一附属医院携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌的分子流行特征。方法收集昆明医科大学第一附属医院2011年12月—2014年10月临床送检的非重复标本,通过VITEK-2系统鉴定耐碳青酶烯类肠杆菌科细菌(CRE),EDTA协同纸片法进行金属酶表型确证,PCR技术检测bla_(NDM-1)基因的携带情况,最后采用ERIC-PCR技术分析菌株的同源性,明确待测菌株的耐药流行特征;结果 (1)共收集到206株CRE菌株,产bla_(NDM-1)的有42株(20.0%),其中以弗氏柠檬酸杆菌(43.0%)为主,主要分离自移植中心的尿液标本中;(2)药敏结果显示实验菌株均为多重耐药株,但磷霉素(5.4%)、阿米卡星(12.0%)和呋喃妥因(18.7%)等抗菌药物的耐药率相对较低;(3)金属酶表型确证的阳性率为95.0%;(4)ERIC-PCR结果显示弗氏柠檬酸杆菌、阴沟肠杆菌和大肠埃希菌在本院移植中心存在局部克隆播散;另外有4株分离自儿科的肺炎克雷伯菌电泳图谱相同。结论本院携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌高度流行,尤其是移植中心存在不同菌种的克隆播散型,应引起我们高度重视。; 关键词 blaNDM-1基因耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌同源性; Keywords blaNDM-1 gene Carbapenem resistant Enterobacteriaceae Homogeneity; 分类号 R978.1 [医药卫生—药品]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于高通量芯片对急性髓系白血病竞争内源性RNA网络的构建和分析被引量：3: 2; 作者潘玉卿孙运艳李轶勋王丽英斯南卓玛陈睿张曦杜艳; 机构昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室云南省肿瘤医院昆明医科大学第三附属医院血液科云南省肿瘤医院昆明医科大学第三附属医院检验科; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期669-676,共8页; 基金云南省科技厅应用基础研究计划重点项目(2018FA043) 云南省科技厅-昆明医科大学联合专项(202001AY070001-239)。; 文摘目的:构建急性髓系白血病(AML)相关的竞争内源性RNA(ceRNA)网络,探讨AML发生发展的分子机制。方法:采用NCBI的基因表达数据库(GEO)下载AML的表达矩阵(GSE96535),通过R语言的edgeR函数对差异表达的mRNA和长链非编码RNA(lncRNA)进行筛选。采用miRcode、miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库预测差异表达的lncRNA与miRNA以及差异表达的mRNA与miRNA之间的调控关系。采用Cytoscape软件构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络,采用基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)对差异基因进行富集分析,采用CytoHubba插件筛选核心基因,即Hub基因。采用GEPIA数据库比较AML患者和正常对照者中前10个Hub基因的表达,绘制Hub基因的生存曲线。结果:与正常对照者比较,AML患者中有1105个mRNA和387个lncRNA存在差异表达。构建的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络由45个lncRNAs、31个miRNA和89个mRNA组成。GO分析,差异基因所调节的功能主要有膜微结构域调节、谷氨酸受体结合和上皮细胞增殖调节等。KEGG分析,19条通路被富集,其中包括转录调控、蛋白聚糖调控和Ras信号通路等。通过CytoHubba共筛选出GATA结合蛋白3(GATA3)、WT1转录因子(WT1)和过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)等前10个连接度最高的Hub基因。采用GEPIA数据库验证GATA3、WT1、PPARG、MYB原癌基因(MYB)、性别决定相关的高迁移率基因群4(SOX4)和E2F7存在差异表达。E2F7低表达组患者生存率高于E2F7高表达组(P=0.028)。结论:筛选出的lncRNA、miRNA和mRNA所构成的ceRNA网络可能促进了AML的发生发展。; 关键词生物信息学急性髓系白血病竞争内源性RNA 基因芯片; Keywords bioinformatics acute myeloid leukemia competitive endogenous RNA gene chip; 分类号 R733.7 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名36例新型隐球菌性脑膜炎的临床分析被引量：10: 3; 作者王芳黄琛杜艳卯建; 机构云南省文山州马关县人民医院医学检验科昆明医科大学第一附属医院医学检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室; 出处《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第2期273-276,共4页; 文摘目的探讨36例新型隐球菌性脑膜炎的临床特征,以提高对该病的认识。方法分析36例新型隐球菌感染患者的临床资料。结果新型隐球菌感染的患者临床表现均有不同程度的头痛、颅内压增高表现,葡萄糖降低尤为显著,IgG、IgM、IgA及微量总蛋白升高明显。治疗后脑脊液和血清标本中隐球菌荚膜多糖抗原滴度下降明显。新型隐球菌对两性霉素B(100%)、氟康唑(94.4%)和5-氟胞嘧啶(94.4%)抗真菌药敏感性较高。结论对颅内压增高、脑膜刺激征阳性的患者反复多次进行脑脊液培养、墨汁染色和隐球菌荚膜多糖抗原检测,有助于新型隐球菌性脑膜炎的早期诊断和早期治疗;隐球菌荚膜多糖抗原滴度随着患者病情的好转而下降。两性霉素B联合氟康唑或5-氟胞嘧啶治疗新型隐球菌性脑膜炎仍然安全有效;早期控制感染和降低颅内压是治疗的关键。; 关键词新型隐球菌隐球菌性脑膜炎临床分析诊断治疗; Keywords Cryptococcus neoformans Cryptococcal meningitis Clinical analysis Diagnosis Treatment; 分类号 R978.1 [医药卫生—药品]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人早幼粒细胞cDNA文库的构建及其鉴定被引量：1: 4; 作者张曦潘玉卿李静芳杨伟高艳章魏颖石琼夏全松杨丽; 机构云南省肿瘤医院·昆明医科大学第三附属医院检验科昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1015-1019,共5页; 基金国家自然科学基金地区项目资助课题(81760426) 云南省科技厅-昆明医科大学联合专项基金资助课题(2015FB070) 云南省教育厅科学研究基金项目资助课题(2018JS228); 文摘目的:构建人早幼粒细胞HL60的cDNA文库,阐明文库内相关基因在急性早幼粒细胞白血病(APL)发生发展中的相关机制。方法:采用Trizol法提取HL60细胞总RNA,离心柱法分离纯化样本中的mRNA,逆转录PCR法合成cDNA第一链,酶促法直接合成cDNA第二链,胶回收目的长度的cDNA片段后将其与pPR3-N载体连接,通过同源重组方法在酵母Y187菌株中构建人早幼粒细胞cDNA文库。将培养的菌液涂布于LB平板进行库容量鉴定,PCR法鉴定插入片段大小及分布。结果:提取到的HL60细胞RNA条带清晰无降解且弥散度低,以纯化后的细胞mRNA为模板成功合成cDNA,经胶回收cDNA片段后顺利将其与pPR3-N载体连接。将重组载体转化至酵母菌株Y187,通过同源重组方法在菌株中成功构建人早幼粒细胞cDNA文库。在原始电转化菌稀释100倍后取10μL涂板,共长约250个克隆子,库容量为2.5×10^6CFU·mL^-1,转化后原始菌液共计5mL,总库容量为1.25×10^7CFU。文库的插入片段电泳检测,平均插入片段大于1200bp,阳性率为100%。结论:成功构建人早幼粒细胞的cDNA文库,为白血病的发病机制及治疗机制的研究奠定了基础。; 关键词白血病人早幼粒细胞酵母双杂交 CDNA文库; Keywords leukemia human promyelocytic cells yeast two hybrid cDNA library; 分类号 R733.7 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于高通量芯片对小儿急性髓系白血病的生物信息学分析: 5; 作者张曦翟丽孙运艳杨伟高艳章雷鸣潘玉卿; 机构云南省肿瘤医院·昆明医科大学第三附属医院检验科云南省肿瘤医院·昆明医科大学第三附属医院血液科昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1036-1042,I0007,共8页; 基金云南省科技厅-昆明医科大学联合专项资助课题(2015FB070) 云南省教育厅科学研究基金项目资助课题(2019J1276)。; 文摘目的:通过生物信息学工具筛选小儿急性髓系白血病(AML)相关的差异表达基因(DEGs),探讨小儿AML的核心基因并阐明其发病机制。方法:从基因表达数据库(GEO)下载符合本研究要求的小儿AML的转录组数据,采用基因表达分析工具(GEO2R)进行DEGs的筛选。利用基因本体功能注释(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析DEGs功能及通路富集情况;利用STRING数据库构建蛋白质互作网络(PPI)并利用Cytoscape软件及插件iRegulon筛选相关的核心基因(Hub genes)及转录因子,通过生物技术信息基因云(GCBI)在线数据库分析前5位的核心基因。结果:本研究共筛选出600个DEGs,其中407个基因上调,193个基因下调。GO分析,相关的DEGs主要参与细胞成分的组成,包括核浆、细胞质、核膜和核斑点。KEGG分析,DEGs主要在肿瘤坏死因子(TNF)、细胞因子受体相互作用及Jak激酶/信号转导与转录激活子(Jak-STAT)信号通路中富集。通过STRING数据库及Cytoscape软件共筛选出甲酰肽受体2(FPR2)、磷酸肌醇3激酶调节亚单位1(PIK3R1)、E1A结合蛋白p300(EP300)、热休克蛋白90α家族(HSP90AA1)和NRAS原癌基因(NRAS)等前20个连接度最高的核心基因,其中EP300、HSP90AA1和NRAS参与了白血病的发生发展。iRegulon共筛选出TP63、NFE2L1和TBX等55个作用于Hub基因的转录因子。结论:筛选出的核心基因和转录因子可能参与小儿AML的发生发展,并可能成为小儿AML的治疗新靶点。; 关键词生物信息学急性髓系白血病差异基因基因芯片; Keywords bioinformatics acute myeloid leukemia differential genes gene chip; 分类号 R733. [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人早幼粒细胞cDNA文库中与GINS2发生相互作用靶蛋白的筛选和鉴定: 6; 作者张曦潘玉卿余鑫郑亚婷郭成斌徐娜王良晓何亮杨丽; 机构云南省肿瘤医院昆明医科大学第三附属医院检验科昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期66-72,共7页; 基金国家癌症中心肿瘤科研专项基金项目(NCC2017A33) 云南省科技厅-昆明医科大学联合专项基金项目(2018FE001-248,202001AY070001-239)。; 文摘目的:采用酵母双杂交系统筛选与人GINS2编码蛋白发生相互作用的靶蛋白,阐明其在急性早幼粒细胞白血病(APL)中的致病信号及相关机制。方法:采用热激法将诱饵质粒pGBKT7-GINS2与人早幼粒细胞cDNA文库质粒共同转化至酵母AH109感受态细胞中,筛选与GINS2编码蛋白相互作用的文库蛋白。利用多重报告基因检测和DNA测序对编码互作蛋白的阳性克隆进行生物信息学分析。结果:成功从文库中筛选到15个初始阳性克隆,其中10个能激活腺苷酸琥珀酸合成酶2(ADE2)和组氨醇氨基盐转移酶3(HIS3)报告基因,13个能激活β-半乳糖苷酶(LacZ)报告基因。对10个能在SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade培养基中生长的阳性克隆行DNA测序和基本局部比对搜索工具(BLAST)比对分析后,除8和9号测序失败,其余8个阳性克隆分属8种不同的蛋白编码基因,分别是RNA结合基序蛋白39(RBM39)、泛素样修饰因子激活酶1(UBA1)、金属硫蛋白2(MT2A)、线粒体钙离子摄入蛋白1(MICU1)、N-乙基马来酰亚胺敏感性融合蛋白辅因子(NSFL1C)、脂肪酰基辅酶a还原酶1(FAR1)、双特异性磷酸酶1(DUSP1)和细胞表面抗原14(CD14)。结论:成功筛选到与GINS2发生相互作用的8个功能蛋白,推测目的蛋白可能在细胞损伤、转录调控和增殖代谢等方面发挥重要作用。; 关键词白血病人早幼粒细胞cDNA文库酵母双杂交 GINS2; Keywords leukemia human promyelocytic cDNA library yeast two hybrid GINS2; 分类号 R733.7 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	携带bla_(NDM-1)基因的肠杆菌科细菌耐药流行特征分析	陈正辉刘淑敏杜艳	《中国抗生素杂志》 CAS CSCD	2018	7	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于高通量芯片对急性髓系白血病竞争内源性RNA网络的构建和分析	潘玉卿孙运艳李轶勋王丽英斯南卓玛陈睿张曦杜艳	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料
3	36例新型隐球菌性脑膜炎的临床分析	王芳黄琛杜艳卯建	《中国抗生素杂志》 CAS CSCD	2019	10	在线阅读下载PDF 职称材料
4	人早幼粒细胞cDNA文库的构建及其鉴定	张曦潘玉卿李静芳杨伟高艳章魏颖石琼夏全松杨丽	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基于高通量芯片对小儿急性髓系白血病的生物信息学分析	张曦翟丽孙运艳杨伟高艳章雷鸣潘玉卿	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	人早幼粒细胞cDNA文库中与GINS2发生相互作用靶蛋白的筛选和鉴定	张曦潘玉卿余鑫郑亚婷郭成斌徐娜王良晓何亮杨丽	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2021	0	在线阅读下载PDF 职称材料