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应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
被引量：
4
1
作者
张雅靖
舒相华
+8 位作者
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
《肉类研究》
北大核心
2020年第10期26-32,共7页
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性...
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性进行分析。结果表明:撒坝火腿中微生物菌群存在差异,细菌丰富度极显著高于真菌(P<0.01),多样性高于真菌,且内部真菌和细菌微生物多样性和丰富度均高于表面;子囊菌门下曲霉菌属是表面和内部真菌中的优势菌群,其次Yamadazyma和青霉菌属也是主要菌群,这些菌属在火腿表面的分布多于内部;厚壁菌门下葡萄球菌属是火腿表面和内部细菌中的优势菌群,色盐杆菌、酸杆菌和链球菌也是表面的主要菌群;放线菌、杆菌属、酸微菌纲及球菌属则是火腿内部的主要菌群,此外火腿内部还存在大量未知微生物。综上所述,曲霉菌和葡萄球菌是撒坝火腿表面和内部的优势菌群。
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关键词
撒坝火腿
微生物多样性
高通量测序
16S
rDNA
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职称材料
云南省无量山乌骨鸡传染性支气管炎和大肠杆菌混合感染的诊断
2
作者
耿志诚
宋春莲
+5 位作者
张莹
罗高
李鑫汉
罗班乾
李鲜
舒相华
《现代畜牧兽医》
2023年第1期63-67,共5页
研究旨在诊断某鸡场发生混合感染的情况,对发病鸡开展临床观察、病理剖解。采集150日龄无量山乌骨鸡病料2份,采用分子生物学技术、细菌分离培养、生化鉴定、药敏试验及病理组织切片进行诊断。结果显示:乌骨鸡表现为精神沉郁、腹泻、呼...
研究旨在诊断某鸡场发生混合感染的情况,对发病鸡开展临床观察、病理剖解。采集150日龄无量山乌骨鸡病料2份,采用分子生物学技术、细菌分离培养、生化鉴定、药敏试验及病理组织切片进行诊断。结果显示:乌骨鸡表现为精神沉郁、腹泻、呼吸有啰音;病理解剖发病鸡可见鼻腔及气管内有大量黏液,肺部出血瘀血,肠道鼓气,肠壁变薄内有黄色泡沫样液体。分子生物学诊断结果显示,发病鸡呈鸡传染性支气管炎阳性;细菌分离培养及生化鉴定结果显示,致病菌为大肠杆菌。药敏试验结果显示,该大肠杆菌对头孢喹肟、阿莫西林、磺胺甲恶唑、四环素、多西环素和头孢曲松钠等6种抗生素显示耐药,对新霉素显示敏感;病理组织切片结果显示,患病鸡肺部病变明显。研究表明,该鸡场内发病鸡为鸡传染性支气管炎及大肠杆菌混合感染,根据诊断结果建议用药后,该场病情得到控制。
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关键词
无量山乌骨鸡
鸡传染性支气管炎
大肠杆菌
混合感染
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职称材料
题名
应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
被引量：
4
1
作者
张雅靖
舒相华
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
机构
云南农业大学动物医学院
昆明伟牧得生物科技有限责任公司
云南云测质量检验
有限
公司
出处
《肉类研究》
北大核心
2020年第10期26-32,共7页
基金
昆明市猪病防治重点实验室项目(2019-1-A-24610)
昆明市农业科技重点项目(2019-1-N-25318000001860)
昆明市重点项目(2019-1-N-25318000003525)。
文摘
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性进行分析。结果表明:撒坝火腿中微生物菌群存在差异,细菌丰富度极显著高于真菌(P<0.01),多样性高于真菌,且内部真菌和细菌微生物多样性和丰富度均高于表面;子囊菌门下曲霉菌属是表面和内部真菌中的优势菌群,其次Yamadazyma和青霉菌属也是主要菌群,这些菌属在火腿表面的分布多于内部;厚壁菌门下葡萄球菌属是火腿表面和内部细菌中的优势菌群,色盐杆菌、酸杆菌和链球菌也是表面的主要菌群;放线菌、杆菌属、酸微菌纲及球菌属则是火腿内部的主要菌群,此外火腿内部还存在大量未知微生物。综上所述,曲霉菌和葡萄球菌是撒坝火腿表面和内部的优势菌群。
关键词
撒坝火腿
微生物多样性
高通量测序
16S
rDNA
Keywords
Saba ham
microbial diversity
high-throughput sequencing
16S rDNA
分类号
TS251.6 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
云南省无量山乌骨鸡传染性支气管炎和大肠杆菌混合感染的诊断
2
作者
耿志诚
宋春莲
张莹
罗高
李鑫汉
罗班乾
李鲜
舒相华
机构
云南农业大学动物医学院
昆明伟牧得生物科技有限责任公司
云南省永德县畜牧兽医局
云南省昭通市畜牧局
出处
《现代畜牧兽医》
2023年第1期63-67,共5页
基金
云南省农业重大科技专项计划“云南省猪重要疫病防控技术体系构建及应用(202102AE090007)”。
文摘
研究旨在诊断某鸡场发生混合感染的情况,对发病鸡开展临床观察、病理剖解。采集150日龄无量山乌骨鸡病料2份,采用分子生物学技术、细菌分离培养、生化鉴定、药敏试验及病理组织切片进行诊断。结果显示:乌骨鸡表现为精神沉郁、腹泻、呼吸有啰音;病理解剖发病鸡可见鼻腔及气管内有大量黏液,肺部出血瘀血,肠道鼓气,肠壁变薄内有黄色泡沫样液体。分子生物学诊断结果显示,发病鸡呈鸡传染性支气管炎阳性;细菌分离培养及生化鉴定结果显示,致病菌为大肠杆菌。药敏试验结果显示,该大肠杆菌对头孢喹肟、阿莫西林、磺胺甲恶唑、四环素、多西环素和头孢曲松钠等6种抗生素显示耐药,对新霉素显示敏感;病理组织切片结果显示,患病鸡肺部病变明显。研究表明,该鸡场内发病鸡为鸡传染性支气管炎及大肠杆菌混合感染,根据诊断结果建议用药后,该场病情得到控制。
关键词
无量山乌骨鸡
鸡传染性支气管炎
大肠杆菌
混合感染
Keywords
Wuliangshan silky chickens
Chicken infectious bronchitis
Escherichia coli
Mixed infection
分类号
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
张雅靖
舒相华
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
《肉类研究》
北大核心
2020
4
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职称材料
2
云南省无量山乌骨鸡传染性支气管炎和大肠杆菌混合感染的诊断
耿志诚
宋春莲
张莹
罗高
李鑫汉
罗班乾
李鲜
舒相华
《现代畜牧兽医》
2023
0
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