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应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
被引量：
4
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作者
张雅靖
舒相华
+8 位作者
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
《肉类研究》
北大核心
2020年第10期26-32,共7页
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性...
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性进行分析。结果表明:撒坝火腿中微生物菌群存在差异,细菌丰富度极显著高于真菌(P<0.01),多样性高于真菌,且内部真菌和细菌微生物多样性和丰富度均高于表面;子囊菌门下曲霉菌属是表面和内部真菌中的优势菌群,其次Yamadazyma和青霉菌属也是主要菌群,这些菌属在火腿表面的分布多于内部;厚壁菌门下葡萄球菌属是火腿表面和内部细菌中的优势菌群,色盐杆菌、酸杆菌和链球菌也是表面的主要菌群;放线菌、杆菌属、酸微菌纲及球菌属则是火腿内部的主要菌群,此外火腿内部还存在大量未知微生物。综上所述,曲霉菌和葡萄球菌是撒坝火腿表面和内部的优势菌群。
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关键词
撒坝火腿
微生物多样性
高通量测序
16S
rDNA
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职称材料
题名
应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
被引量：
4
1
作者
张雅靖
舒相华
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
机构
云南农业大学动物医学院
昆明伟牧得生物科技有限责任公司
云南云测质量检验
有限
公司
出处
《肉类研究》
北大核心
2020年第10期26-32,共7页
基金
昆明市猪病防治重点实验室项目(2019-1-A-24610)
昆明市农业科技重点项目(2019-1-N-25318000001860)
昆明市重点项目(2019-1-N-25318000003525)。
文摘
为分析云南撒坝火腿中微生物的菌群构成、物种丰富度和多样性差异,以1年以上的撒坝火腿为研究对象,通过提取DNA,采用Illumina高通量测序方法对火腿表面和内部细菌的16S rDNA V3~V4区和真菌ITS2区进行扩增和测序,并对其菌落构成和多样性进行分析。结果表明:撒坝火腿中微生物菌群存在差异,细菌丰富度极显著高于真菌(P<0.01),多样性高于真菌,且内部真菌和细菌微生物多样性和丰富度均高于表面;子囊菌门下曲霉菌属是表面和内部真菌中的优势菌群,其次Yamadazyma和青霉菌属也是主要菌群,这些菌属在火腿表面的分布多于内部;厚壁菌门下葡萄球菌属是火腿表面和内部细菌中的优势菌群,色盐杆菌、酸杆菌和链球菌也是表面的主要菌群;放线菌、杆菌属、酸微菌纲及球菌属则是火腿内部的主要菌群,此外火腿内部还存在大量未知微生物。综上所述,曲霉菌和葡萄球菌是撒坝火腿表面和内部的优势菌群。
关键词
撒坝火腿
微生物多样性
高通量测序
16S
rDNA
Keywords
Saba ham
microbial diversity
high-throughput sequencing
16S rDNA
分类号
TS251.6 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用16S rDNA分析撒坝火腿表面和内部微生物多样性
张雅靖
舒相华
黄鑫
吕涛
王余磊
张雅伦
张智慧
罗高
李鑫汉
李向楠
宋春莲
《肉类研究》
北大核心
2020
4
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