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Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究
被引量：
2
1
作者
李晓晖
赵俊伟
+2 位作者
滕虎
西野宪和
修志龙
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期374-378,共5页
采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacety-lases,HDACs)中的HDAC1和HDAC8.通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型,将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟,结...
采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacety-lases,HDACs)中的HDAC1和HDAC8.通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型,将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟,结果表明,HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apici-din-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键,而在HDAC8中未发现,这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.
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关键词
组蛋白脱乙酰酶抑制剂
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)
分子动力学
同源模建
分子对接
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职称材料
题名
Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究
被引量：
2
1
作者
李晓晖
赵俊伟
滕虎
西野宪和
修志龙
机构
大连理
工
大学
环境与
生命
学院
日本九州工业大学大学院生命体工学研究科
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期374-378,共5页
基金
国家"八六三"计划项目(批准号:2007AA021604)资助
文摘
采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacety-lases,HDACs)中的HDAC1和HDAC8.通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型,将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟,结果表明,HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apici-din-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键,而在HDAC8中未发现,这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.
关键词
组蛋白脱乙酰酶抑制剂
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)
分子动力学
同源模建
分子对接
Keywords
Apicidin
Histone deacetylase
Molecular dynamics
Homology modeling
Molecular docking
分类号
O641 [理学—物理化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究
李晓晖
赵俊伟
滕虎
西野宪和
修志龙
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
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